WRKY基因家族的進化及水稻W(wǎng)RKY基因表達譜的研究.pdf

1、　 本文針對水稻W(wǎng)RKY轉(zhuǎn)錄因子家族的全基因組進行了分析：以WRKY結(jié)構(gòu)域?qū)λ净蚪M(國際水稻基因組計劃的粳稻精細圖譜的基因組)作序列搜索，對獲得的序列進行基因預(yù)測。結(jié)合cDNA/EST及基因表達等方法驗證，通過全基因組分析，鑒別了102個可能的水稻W(wǎng)RKY基因，以每個基因在染色體上的位置順序編號，得到了較為系統(tǒng)完整的水稻W(wǎng)RKY基因家族。分析發(fā)現(xiàn)水稻W(wǎng)RKY結(jié)構(gòu)域的編碼區(qū)有兩種保守類型的內(nèi)含子剪接方式，一個WRKY結(jié)構(gòu)域編碼區(qū)

2、通常只有其中的一種類型的內(nèi)含子或沒有，這對正確注釋W(xué)RKY基因很有幫助?！　?以ClustalW軟件分別對WRKY結(jié)構(gòu)域及WRKY基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹(phylogenetictree)，得到二者類似的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系，從而也說明WRKY結(jié)構(gòu)域在一定程度上體現(xiàn)WRKY基因的進化關(guān)系，WRKY結(jié)構(gòu)域是WRKY轉(zhuǎn)錄因子的重要功能單位和基因的進化單位?！　?總結(jié)了水稻W(wǎng)RKY基因的表達譜研究：以cDNA矩陣研究89個水稻W(wǎng)RK