利用選擇信號分析方法篩選與綿羊尾型相關的基因.pdf

1、我國的養(yǎng)羊歷史悠久，綿羊品種資源豐富，但產量相對落后，綿羊的產量、羊肉的質量關乎農牧民的經濟收入、人們對羊肉的需求。人們對心腦血管疾病的關注，綿羊的尾部脂肪逐漸失去了市場價值和經濟價值。按照綿羊的尾型，至少可以把綿羊分為四類，瘦尾、脂臀尾、短脂尾和長脂尾。野生綿羊是瘦尾羊的事實，表明不同尾型的綿羊是在人們畜牧生產中特意選育的結果。生物技術的發(fā)展和統(tǒng)計學方法的提出，使得我們能夠檢測這種選擇在基因組上留下的信息，進而挖掘出與綿羊尾型有關的基

2、因，為綿羊的品種選育和種質資源的保存利用提供依據。
　　此次研究，選擇具有極端表型的兩個類群，即：肥尾、瘦尾共計122個個體進行50K基因芯片分型。在進行選擇信號分析之前，我們首先用NETVIEW方法構建我國11個品種綿羊的精細圖譜，以了解我國綿羊的群體遺傳結構。NETVIEW分析的結果表明我國的綿羊可以分為兩個大的類群，一類是藏系綿羊；另一類是蒙古-哈薩克系；烏珠穆沁羊與除羅布羊以外的蒙古系綿羊均有直接遺傳關系，與羅布羊有間接的

3、遺傳關系。羅布羊與哈薩克系綿羊有較近的遺傳關系，而哈薩克系的哈薩克羊與多浪羊存在較遠的遺傳關系。迪慶羊能夠與藏系綿羊分離開，西藏地區(qū)藏羊能夠與其它地區(qū)的藏羊分開，青海、四川的藏羊不能分開；NETVIEW分析群體遺傳結構的計算時間短，與PCA、NJ樹、STRUCTURE的結果大體一致，且基本能夠反映史實，因而可以作為未來群體結構分析的工具；烏珠穆沁羊是此次試驗的蒙古系綿羊中，最古老的一個品種；不同地區(qū)的藏羊存在著分化趨勢，但分化并不嚴重。

4、隨后利用FST和hapFLK等方法，對肥尾綿羊和瘦尾綿羊兩類具有極端表型的類群進行選擇信號分析，這兩類方法共篩選到了6個重疊的區(qū)域和43個重疊的基因，選擇這兩種方法篩選出來的重疊基因作為候選基因。并對重疊的6個區(qū)域進行成對FST方法驗證，成對FST的結構表明，在重疊區(qū)域，肥尾與瘦尾巴之間的選擇信號出現了峰值，而肥尾與肥尾之間以及瘦尾和瘦尾之間沒有峰值。結果表明這6個重疊區(qū)域和有可能與綿羊的尾部脂肪的形成有關，這六個重疊區(qū)域篩選出來的重疊

5、基因如：BMP2, PPP1CC,PROKR1, ETAA1, HOXA11, PDGFD等可能參與了綿羊尾部脂肪的沉積或綿羊的尾形的形成；隨后我們對PDGFD進行western blot驗證，結果表明PDGFD蛋白的表達量在3月齡胎齡和剛出生綿羊的尾部脂肪中沒有明顯的差別，但是在3月齡胎齡皮下脂肪和剛出生綿羊的肝臟中表達量有明顯的差別；雖然這一結果不能支持PDGFD對綿羊尾型的形成有重要影響，但并不能否認其可能影響綿羊尾部脂肪測沉積。