VGLL4和NOTCH4基因單核苷酸多態(tài)性與肺癌易感性的研究.pdf

1、中科院上海生命科學研究院近期在國際學術期刊Cell Research刊發(fā)了一項最新研究成果[7]，他們發(fā)現了導致肺癌發(fā)生的新抑癌基因VGLL4基因。研究表明，VGLL4異常表達與肺癌、肝癌等多種癌癥的發(fā)生發(fā)展相關，VGLL4基因表達下調是導致腫瘤發(fā)生的可能原因，但是對于其下調的機理還未見有報道，而外顯子的突變可以直接導致蛋白的變化或蛋白結構的改變，從而導致蛋白的功能改變。據此我們選取了該基因編碼區(qū)的同義突變位點rs1803489（A/G

2、，Gln/Gln）和錯義突變位點rs2276749(C/T, Met/Ile)兩個SNP位點進行分析研究：同時,在腫瘤的發(fā)生和發(fā)展過程中，Notch信號扮演著重要的角色，單一的Notch信號的紊亂可能直接引發(fā)腫瘤的發(fā)生和發(fā)展，而通路的異常可由于基因突變導致的蛋白表達變化而引起。因此，我們選取了位于NOTCH4基因外顯子區(qū)的同義突變位點rs3134942(A/C, Val/Val)作為研究對象。
　　為了研究兩個基因的三個位點與肺癌

3、易感性的關系，我們選取了375例肺癌患者外周血作為研究對象，和380例健康人群外周血作為正常對照組。首先我們根據不同的位點設計不同的引物，然后通過PCR擴增和非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳，選取電泳條帶清晰、單一無雜帶的退火溫度進行高分辨率熔解曲線（High Resolution Melting，HRM）上機實驗。然后利用Roche480 Lightcycler Software對高分辨率熔解曲線進行分析，根據曲線形成的形狀和顏色對樣本進行分

4、型，最后通過統(tǒng)計學分析這三個多態(tài)位點與肺癌易感性的關聯性。
　　研究結果表明：（1）研究對象基本資料比較結果顯示，在375例肺癌病例和380例對照樣本中：肺癌病例與正常對照在年齡、吸煙與飲酒狀況存在差異（p值均＜0.05），而性別沒有顯著差異（p=0.825），說明肺癌的發(fā)生是多因素誘導的結果。VGLL4基因的兩個多態(tài)位點基因型分布顯示：在超顯性遺傳模型下，同義突變rs1803489多態(tài)性位點與肺癌易感性具有顯著顯著相關性，其中G

5、A基因型會提高其個體的肺癌發(fā)病風險（Adjusted OR=1.42,95％CI:1.00-2.00, p=0.048），是GG基因型攜帶者肺癌發(fā)生風險的1.42倍?；谏鲜鲞z傳模型，我們對其進行了分層分析，結果顯示：小于60歲的人群中該位點GA基因型與肺癌有著顯著的相關性（Adjusted OR=1.96,95%CI:1.23-3.14, p=0.005）。我們的研究結果提示錯義突變位點rs2276749與肺癌易感性無顯著相關性。（2