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文檔簡介
1、海濱木槿(Hibiscus hamabo Sieb.et Zucc.)屬于錦葵科木槿屬,是一種落葉小喬木。該植物對(duì)鹽堿有較強(qiáng)的耐受性,能生長在堿性(p H8.0~8.6)、含鹽量高達(dá)1.5%的土壤中,是典型的鹽生植物。目前有關(guān)海濱木槿耐鹽性的研究主要集中在生理角度,而在分子機(jī)制方面的研究卻很少。本實(shí)驗(yàn)從轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組兩方面進(jìn)行分析,初步探究鹽脅迫下海濱木耐鹽性的分子機(jī)制,希望為更加深入的了解海濱木槿耐鹽的分子調(diào)控機(jī)制和更好地推廣及綜合
2、利用海濱木槿提供理論依據(jù)。
本研究主要內(nèi)容包括:⑴用200mM的NaCl處理長到10片真葉的海濱木槿1 d,以未處理的作為對(duì)照,取其葉和根進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。共測(cè)序了4個(gè)樣品,得到20.52Gb Clean Data,每個(gè)樣品Clean Data都達(dá)到4.50 Gb,Q30堿基百分比在93.00%及以上。組裝后,共獲得75,257條 Unigene,其中1 kb長度以上的 Unigene有17,795條。將得到的 Unigene與
3、 NR、Swiss-Prot、KEGG、COG、KOG、GO和 Pfam數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì),共得到44,483條 Unigene的注釋結(jié)果。對(duì) Unigene庫進(jìn)行SSR分析,共獲得6,271個(gè) SSR標(biāo)記。對(duì)得到的差異表達(dá)基因進(jìn)行模式聚類、功能注釋以及富集性分析?;诨蛟诓煌瑯悠分械谋磉_(dá)量,識(shí)別差異表達(dá)基因,200 mM NaCl脅迫下轉(zhuǎn)錄組測(cè)序中海濱木槿處理組的葉與對(duì)照組的葉相比,得到1268個(gè)差異表達(dá)基因,其中上調(diào)的有375個(gè)基因,
4、下調(diào)的有893個(gè)基因;而處理組的根與對(duì)照組的根相比,得到2093個(gè)差異表達(dá)基因中上調(diào)的基因有935個(gè),下調(diào)的基因有1104個(gè)。從差異表達(dá)基因中,選取了17個(gè)基因進(jìn)行熒光定量 PCR驗(yàn)證,證明了轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的可靠性,說明轉(zhuǎn)錄組的數(shù)據(jù)可以用來做進(jìn)一步研究。⑵根據(jù)轉(zhuǎn)錄組結(jié)果,選取了與抗鹽相關(guān)的4個(gè)差異表達(dá)基因(APX、GST、SOD和AKT1),發(fā)現(xiàn)在鹽脅迫下海濱木槿葉片中APX、GST、SOD和AKT1這四個(gè)基因的表達(dá)量都呈現(xiàn)先上升后下降的趨
5、勢(shì),在3d的時(shí)候達(dá)到最大;而在海濱木槿根中這四個(gè)基因的表達(dá)量基本上呈現(xiàn)出上升-下降-上升的趨勢(shì)。測(cè)定200mM NaCl處理0 d、1 d、3 d、6d、9d的海濱木槿葉片和根中的APX、SOD、GST的酶活,發(fā)現(xiàn)海濱木槿葉片中APX、SOD的酶活性表現(xiàn)出先升高后下降的趨勢(shì), GST的酶活呈現(xiàn)出上升-下降-上升的趨勢(shì)。APX的酶活在6d的時(shí)候達(dá)到最大,GST、SOD酶的活性在第3 d時(shí)達(dá)到最大。而海濱木槿根中APX酶活性差異卻不顯著,基
6、本沒有什么變化,GST的酶活基本呈現(xiàn)出下降的趨勢(shì),SOD酶的活性則表現(xiàn)出先升高后降低的趨勢(shì),在第6 d時(shí)酶活性最大。以上結(jié)果說明海濱木槿在遭受鹽脅迫時(shí),抗性基因最先做出響應(yīng),然后再通過轉(zhuǎn)錄翻譯合成相關(guān)的抗性蛋白,從而使植物抵抗環(huán)境脅迫。⑶用200mM的NaCl處理海濱木槿,以不含NaCl的1/2 Hoagland營養(yǎng)液澆灌為對(duì)照,取脅迫1d的海濱木槿的葉提取總蛋白,進(jìn)行雙向電泳,每個(gè)樣品進(jìn)行三次技術(shù)重復(fù)。使用 PDQ ues t軟件對(duì)圖
7、像進(jìn)行分析,對(duì)蛋白豐度表達(dá)差異為 P≤0.05且 ANOVE≥2的點(diǎn)標(biāo)記,發(fā)現(xiàn)在鹽脅迫下,與對(duì)照相比,200 mM的NaCl處理1 d后的海濱木槿葉中有86個(gè)蛋白質(zhì)點(diǎn)表現(xiàn)出顯著性差異,其中蛋白質(zhì)豐度增加的有54個(gè),蛋白質(zhì)豐度降低的有32個(gè)。對(duì)這些差異蛋白點(diǎn)進(jìn)行質(zhì)譜分析,總共檢測(cè)出77種差異蛋白,其中48種是上調(diào)的,29種是下調(diào)的。對(duì)這些差異蛋白進(jìn)行 GO富集分析和 Pathway富集分析,將這些差異蛋白進(jìn)行分類,主要分類到光合、代謝、蛋
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