胃鏡取樣的良性和惡變組織的分子標(biāo)志篩選.pdf

1、胃癌是常見惡性腫瘤,其死亡率仍占世界第二位,僅次于肺癌。中國(guó)屬胃癌高發(fā)國(guó)家,病死率較高。胃癌的5年生存率與其浸潤(rùn)深度有關(guān),胃癌早期診斷和根治性治療是取得良好預(yù)后的唯一途徑。胃鏡配合內(nèi)鏡活檢病理用于早期胃癌的診斷后,由于胃鏡活檢以及病理學(xué)檢查受限于取樣醫(yī)師的技術(shù)熟練程度和病理醫(yī)生的判斷等諸多主觀因素,術(shù)前胃癌的漏診率仍可達(dá)10％~20%。發(fā)展新的基于分子水平的胃癌早期輔助診斷系統(tǒng)對(duì)胃癌的防治至關(guān)重要。因此本課題通過(guò)比較胃鏡下采集的病理診斷

2、分別為胃粘膜良性和惡性病變組織的表達(dá)差異基因,尋找有效區(qū)分兩者的分子標(biāo)志組合。胃鏡下取35對(duì)有病理診斷的病變胃粘膜和正常對(duì)照組織,提取總RNA,經(jīng)RNA放大處理后和含有1299個(gè)基因的Oligo芯片進(jìn)行雜交,局部加權(quán)回歸法(LOWESS)進(jìn)行數(shù)據(jù)歸一化處理,SAM法鑒別組內(nèi)差異基因,t檢驗(yàn)法(P＜0.01)篩查惡性和良性組間的差異基因,Real-time PCR驗(yàn)證候選基因的在良、惡性表達(dá)差異。惡性病變粘膜組織分別與自身正常組織作對(duì)照進(jìn)

3、行比較,367個(gè)基因上調(diào),261個(gè)基因下調(diào);良性病變和分別與自身正常組織作對(duì)照比較,496個(gè)基因上調(diào),252基因下調(diào);組間具有極明顯差異的基因共49個(gè)。49個(gè)基因組間差異基因的組合可100%成功區(qū)分胃粘膜良性和惡性病變組織。隨機(jī)抽取49個(gè)基因中的6個(gè)基因,mRNA定量表達(dá)檢測(cè)結(jié)果與芯片一致。應(yīng)用49個(gè)基因組合對(duì)6例新的胃組織進(jìn)行盲法檢測(cè),預(yù)測(cè)準(zhǔn)確率達(dá)85%。因此,寡核苷酸基因芯片進(jìn)行基因表達(dá)譜檢測(cè)方法可以用于區(qū)分胃粘膜良、惡性病變的分子