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文檔簡介
1、目的:腎小球腎炎發(fā)病機(jī)制的研究目前仍停留在體內(nèi)免疫功能紊亂上,且發(fā)病機(jī)制之間尚存在一些相互矛盾之處。本實驗擬對控制免疫應(yīng)答的基因-Ir基因(immuneresponsegeneI-Eβ片段)進(jìn)行研究,探討其與小鼠膜性腎小球腎炎(membranousglomerulonephritis,MGN)發(fā)病機(jī)制的關(guān)系,以期論證Ir基因在腎炎發(fā)病中的重要地位和作用,揭示其分子病理學(xué)發(fā)病機(jī)制。 方法:1、復(fù)制與鑒定小鼠膜性腎小球腎炎動物模型:
2、按照Border[1]方法,制備陽離子化牛血清白蛋白(cationicbovineserumalbumin,C-BSA)。選用近交系BLAB/c小鼠30只,20±2g,雌雄對半,隨機(jī)分為實驗組和對照組二組,實驗組隔日尾靜脈注射C-BSA0.2ml,于注藥三周始每周每只檢測2次小鼠尿蛋白,四周末殺檢,進(jìn)行光鏡、電鏡、免疫熒光染色鑒定。對照組小鼠隔日注射0.2ml磷酸鹽緩沖溶液(phosphatebufferedsolution,PBS液)
3、,進(jìn)行全程對照。 2、以逆轉(zhuǎn)錄多聚酶鏈反應(yīng)(reversetranscriptionpolymerizechainreaction,RT-PCR)方法擴(kuò)增并鑒定I-Eβ基因:隨機(jī)選取上述膜性腎病動物模型實驗組和對照組小鼠,分別作為檢測I-Eβ基因序列的實驗組和對照組,取每只小鼠脾臟組織50mg,充分搗碎,加入Trizol試劑提取總核糖核酸(ribonucleicacid,RNA),經(jīng)紫外分光光度計測定光密度(opticalden
4、sity,OD)OD260/OD280的比值,計算出各組的RNA的濃度與純度,并用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測RNA分子的完整性,利用RT-PCR技術(shù)和隨機(jī)引物將總RNA逆轉(zhuǎn)錄成反向轉(zhuǎn)錄脫氧核糖核酸(complementarydeoxyribonucleicacid,cDNA),選取I-Eβ基因cDNA全序列,設(shè)計基因特異性引物在PCR儀上進(jìn)行體外擴(kuò)增。以小鼠磷酸甘油醛脫氫酶(gluceraldehydephosphatedehydrogen
5、ase,GAPDH)基因進(jìn)行對比。 3、設(shè)計擴(kuò)增產(chǎn)物內(nèi)部特異性引物,以測序儀檢測PCR產(chǎn)物,得出I-Eβ基因序列。 4、測序結(jié)果與DNA序列峰圖核對后,在BLAST上進(jìn)行雙重序列對比,以及clustalx1.83多重序列對比。以雜合突變數(shù)進(jìn)行統(tǒng)計處理。 結(jié)果:1、以Border方法制備陽離子化牛血清白蛋白,小鼠尾靜脈注射制備動物模型穩(wěn)定可靠; 2、用Trizol試劑提取總RNA,所提RNAOD2一OD28
6、0在1.8~2.0之間,濃度在542.0ng/μl左右。1%瓊脂糖凝膠電泳顯示RNA電泳圖的5S、18S、28S三條帶型整齊,無明顯拖尾及彌散,說明RNA結(jié)構(gòu)完整,無明顯降解。 3、逆轉(zhuǎn)錄PCR擴(kuò)增實驗組和對照組均有目的基因I-Eβ基因和內(nèi)參對照GAPDH基因的cDNA產(chǎn)生,PCR產(chǎn)物電泳與脫氧核糖核酸(deoxyribonucleicacid,DNA)分子Marker相比示:擴(kuò)增產(chǎn)物大小分別在750~1000bp和100~25
7、0bp之間,與預(yù)定理論值849bp和201bp大小符合。 4、PCR產(chǎn)物檢測序列,送檢20例,其中16例峰圖明顯,雜帶較少,可獲得清晰序列,其序列在BLAST上與正常序列對比,結(jié)果符合率100%;以clustalx1.83進(jìn)行多重序列對比,結(jié)果也無明顯差異性。另外4例雜峰、雜帶突出,無法辨認(rèn)序列。 5、雜合突變分析顯示:實驗組共測出堿基3704bp,其中有8bp發(fā)生雜合突變,突變率為1.890‰;對照組測出3755bp,
8、其中有1bp發(fā)生雜合突變,突變率為0.266‰。 6、雜合突變情況與PCR擴(kuò)增致突變率1/105比較,實驗結(jié)果符合Poisson分布,根據(jù)Poisson分布的小概率事件原理,作出統(tǒng)計推斷,實驗數(shù)據(jù)以SPSS11.5forwindows進(jìn)行處理,結(jié)果:實驗組P(x≥8)=1.11E-16,P遠(yuǎn)小于0.01,差異有統(tǒng)計學(xué)意義,故可認(rèn)為實驗組雜合突變率高于PCR擴(kuò)增所致突變率,其原因可能為實驗組在實驗過程中發(fā)生了突變;對照組P(x≥1
9、)=0.007,P小于0.01,差異有統(tǒng)計學(xué)意義,故可認(rèn)為對照組雜合突變率高于PCR擴(kuò)增所致突變率,其原因可能為對照組可能在實驗過程中發(fā)生了突變。實驗組和對照組進(jìn)行對比,結(jié)果進(jìn)行四格表X2檢驗,實驗數(shù)據(jù)用SPSS11.5forwindows進(jìn)行處理,結(jié)果X2為5.553,P值為0.018(α<0.05),差異有統(tǒng)計學(xué)意義。故可認(rèn)為實驗組雜合突變率高于對照組,其原因可能與膜性腎病的發(fā)生有關(guān)。7、對9例雜合突變進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),實驗組8例突變中
10、,有2例雜合突變同時發(fā)生在I-Eβ基因β1外顯子第20位堿基上,均為胸腺嘧啶/腺嘌呤(thymine/adenine,T/A)雜合突變。而正常該位點應(yīng)為胸腺嘧啶。對照組該位點無突變發(fā)生。進(jìn)一步對該位點進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),實驗組和對照組該位點T峰均有降低。測出的16例序列,T峰下的干擾峰中12例均有腺嘌呤(adenine,A)干擾峰的出現(xiàn),其中實驗組6例,占實驗組總測出例數(shù)的85.71%;對照組6例,占對照組66.67%??梢钥闯鲈撐稽cA堿基干
11、擾峰發(fā)生率實驗組高于對照組,由于例數(shù)不多,統(tǒng)計上無意義,需要進(jìn)一步的研究證實。而9例序列該位點干擾峰中7例有胞嘧啶(cytosine,C)的出現(xiàn),發(fā)生率為77.78%;而實驗組中6例僅有1例有C的出現(xiàn),發(fā)生率為16.67%,列出四格表,進(jìn)行X2檢驗,X2=6.349,P=0.012(α<0.05),差異有統(tǒng)計學(xué)意義,故可認(rèn)為該位點C干擾峰發(fā)生率實驗組低于對照組。 結(jié)論:1、小鼠I-Eβ基因的分離和鑒定是許多后續(xù)研究的前提。
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