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文檔簡介
1、中國海洋大學(xué)博士學(xué)位論文牙鲆免疫相關(guān)基因的克隆與表達(dá)分析姓名:李朔申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:博士專業(yè):海洋生物學(xué)指導(dǎo)教師:張全啟200906012牙鲆免疫相關(guān)基因l(Polivaceusimmunerelatedgene1,PolRl)的克隆及分析通過DDPCR和RACE技術(shù),拼接得到了長度為997bp的牙鲆免疫相關(guān)基因l(EU224373)全長cDNA,其中5’UTR為523bp,ORF為300bp,3’UTR為174bp,可編碼99個(gè)氨基酸,預(yù)
2、測(cè)的分子量約為1046KD,等電點(diǎn)為814?;蚪MDNA序列共含有2個(gè)內(nèi)含子,3個(gè)外顯子。編碼的蛋白含有一個(gè)19個(gè)氨基酸組成的信號(hào)肽,為分泌型蛋白。通過結(jié)構(gòu)功能域的查找,發(fā)現(xiàn)此蛋白一個(gè)原核生物膜脂蛋白的附著點(diǎn)。經(jīng)NCBI數(shù)據(jù)庫比對(duì)后并沒有發(fā)現(xiàn)與之相似的序列,因此給此基因命名為牙鲆免疫相關(guān)基因1(Polivaceusimmunerelatedgene1,PolRl)。半定量RTPCR結(jié)果表明,對(duì)照組中,在所有的組織器官(肝臟、腎臟、脾臟、
3、鰓、小腸、心臟、肌肉)中均未檢測(cè)到PolRl的表達(dá)。鰻弧菌注射后,在所有的組織中均檢測(cè)到了PolRl的表達(dá),且隨著時(shí)間的延長,表達(dá)量有明顯上升的趨勢(shì)。推測(cè)該基因的編碼產(chǎn)物可能是抗菌肽類似的小分子直接參與消滅病原生物或者作為信號(hào)分子通過與病原生物的膜結(jié)合識(shí)別出外界的入侵從而引起機(jī)體內(nèi)部的級(jí)聯(lián)免疫反應(yīng)。以pET32a為表達(dá)質(zhì)粒,將PolRl的成熟肽基因序列插入其中構(gòu)建了pET32aPolRl重組質(zhì)粒,并在BL21(DE3)pLysS中進(jìn)行融
4、合表達(dá)。SDSPAGE蛋白電泳和WesternBlot分析發(fā)現(xiàn)重組質(zhì)粒在相對(duì)分子量29kDa處出現(xiàn)一條特異條帶,正好是標(biāo)簽蛋白TrxTag相對(duì)分子質(zhì)量(20kDa)與PolR2的成熟肽相對(duì)分子質(zhì)量(9kDa)的總和,與預(yù)期融合蛋白相對(duì)分子質(zhì)量相符,表明成功構(gòu)建了TrxPolRl融合蛋白重組原核表達(dá)系統(tǒng),且大部分以可溶性蛋白形式存在,為進(jìn)一步從分子水平探討新基因PolRI成熟肽的研究奠定了基礎(chǔ)。3牙鲆免疫相關(guān)基因2(Polivaceusi
5、mmulaerelatedgene2,PolR2)的克隆及分析通過DDPCR和RACE技術(shù),拼接得到了長度為1061bp的牙鲆免疫相關(guān)基因2(EU224372)全長cDNA,其中5’UTR為169bp,ORF為336bp,3UTR為556bp,可編碼1l1個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)的分子量約為1384KD,等電點(diǎn)為8Ol?;蚪MDNA序列共含有5個(gè)內(nèi)含子,6個(gè)外顯子。編碼的蛋白含有一個(gè)26個(gè)氨基酸組成的信號(hào)肽,為分泌型蛋白。經(jīng)NCBI數(shù)據(jù)庫比對(duì)后并
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