利用SNP標(biāo)記構(gòu)建油菜品種指紋圖譜及定位下卷葉性狀基因的研究.pdf

1、單核苷酸多態(tài)性(SNP)是指在基因組水平上由單個(gè)堿基的突變所引起的一種DNA序列多態(tài)性，是目前最精確的檢測(cè)物種間多態(tài)性的分子標(biāo)記技術(shù)。在構(gòu)建遺傳圖譜、分子標(biāo)記輔助育種等方面均有廣泛的應(yīng)用。本研究利用新興的油菜SNP標(biāo)記構(gòu)建了油菜指紋圖譜，并且定位了下卷葉基因，主要研究結(jié)果如下:
　　1.指紋圖譜構(gòu)建:利用SNP標(biāo)記及SSR標(biāo)記，獲得了總計(jì)57份油菜材料的指紋圖譜。
　　(1)利用SSR標(biāo)記構(gòu)建指紋圖譜:利用40對(duì)核心SSR標(biāo)

2、記構(gòu)建的22個(gè)品種（系）指紋圖譜各不相同?；赟SR標(biāo)記帶型的遺傳相似性系數(shù)結(jié)果表明，Tapidor和鎮(zhèn)油7號(hào)之間的遺傳相似性系數(shù)最小，為0.52，鎮(zhèn)油6號(hào)與7號(hào)之間的遺傳相似性系數(shù)最大，為0.87;南農(nóng)油系列的3個(gè)品種之間的遺傳相似性系數(shù)在0.70-0.77，鎮(zhèn)油系列的4個(gè)品種之間的相似性系數(shù)在0.64-0.87，史力佳和史力豐之間的相似性系數(shù)為0.76。這些遺傳系數(shù)信息為育種親本選配提供了一定的有益信息。
　　(2)利用SNP

3、標(biāo)記構(gòu)建指紋圖譜:利用52157個(gè)SNP標(biāo)記構(gòu)建了44個(gè)品種（系）的指紋圖譜。SNP標(biāo)記得到的遺傳相似性系數(shù)結(jié)果表明，鎮(zhèn)油5號(hào)與中雙11號(hào)兩個(gè)品種之間的相似性系數(shù)為0.56，是所有系數(shù)中最小的。東油1號(hào)和鎮(zhèn)油6號(hào)與鎮(zhèn)油7號(hào)和東油1號(hào)之間的相似性系數(shù)同為0.78，是所有系數(shù)中最大的;鎮(zhèn)油系列四個(gè)品種與中雙11號(hào)之間的相似性系數(shù)在0.56-0.59，南農(nóng)油2號(hào)和南農(nóng)油3號(hào)與中雙11號(hào)的相似性系數(shù)都為0.61，史力佳與秦優(yōu)九號(hào)的相似性系數(shù)為0

4、.62，由此可知，當(dāng)品種來(lái)自不同地域時(shí)，品種間遺傳相似系數(shù)較小，說(shuō)明不同的地域環(huán)境對(duì)品種間遺傳關(guān)系的遠(yuǎn)近有一定的影響。
　　(3)兩種標(biāo)記的指紋圖譜比較:用SSR和SNP標(biāo)記所得9個(gè)品種油菜指紋圖譜，計(jì)算遺傳相似性系數(shù)，并且計(jì)算兩種相似系數(shù)間的相關(guān)系數(shù)，為0.3269(p=0.0517)，說(shuō)明二者之間一致性比較好;同時(shí)，9個(gè)品種用兩種標(biāo)記的聚類結(jié)果差別不大。SNP標(biāo)記為52157個(gè)，SSR標(biāo)記的引物為40對(duì)，因而SNP標(biāo)記計(jì)算的遺

5、傳相似系數(shù)更精確，結(jié)果更可靠。
　　2.下卷葉性狀的基因定位:利用本實(shí)驗(yàn)室突變體庫(kù)內(nèi)的卷葉突變體M423，構(gòu)建了一個(gè)F2代分離群體。得到266株下卷葉個(gè)體，78株正常葉片個(gè)體，經(jīng)過(guò)卡方測(cè)驗(yàn)，符合3∶1的孟德?tīng)栠z傳比例，推測(cè)下卷突變?yōu)轱@性單基因控制。利用CTAB法隨機(jī)提取了80個(gè)單株的DNA樣品，得到了SNP標(biāo)記數(shù)據(jù)。52157個(gè)SNP標(biāo)記數(shù)據(jù)中，多態(tài)性標(biāo)記10013個(gè)。采用關(guān)聯(lián)分析方法，掃描分析后，找到與突變性狀連鎖的16個(gè)SNP