綿羊Hoxc8和Hoxd11基因甲基化和突變位點的研究.pdf

1、本研究測定了綿羊Hoxc8和Hoxd11基因，比對了蒙古羊和德國美利奴肉羊，道塞特肉羊、澳洲美利奴細毛羊的Hoxc8基因的甲基化位置、數(shù)量、穩(wěn)定程度、世代間的傳遞特征、配子與合子的基因序列甲基化的狀態(tài)差異、性別之間的甲基化的特點、甲基化的遺傳方式、單倍體和二倍體甲基化的差異，討論了甲基化的功能和機理，以及甲基化的量子力學性質(zhì)，甲基化上述特點與胸椎和腰椎數(shù)變異之間的關系，甲基化特征作為分子標記應用于綿羊育種的可能性和可行性等。
　　

2、綿羊的Hoxc8基因exon-1為436 bp，exon-2為293 bp，intron為1379bp，全長2108 bp(GenBank Accession No：GU479925)。Hoxc8 exon-1序列共有35個CpG，C+G=61.01％。其中位于密碼第1-2位的CpG共2個，全部編碼精氨酸。位于密碼第2-3位的CpG共13個，位于密碼3-1位的CpG有20個。Hoxc8 exon-1的CpG數(shù)量明顯高于第二外顯子（12個

3、）。
　　綿羊Hoxd11基因exon-1為778 bp，exon-2為236 bp，intron為762 bp，全長為1776 bp(GenBank Accession No.GU059862)。Hoxd11 exon-1序列共有120個CpG，C+G=76.74%。其中位于密碼第1-2位的CpG共8個，全部編碼精氨酸。位于密碼的第2-3位的CpG共47個，位于密碼3-1位的CpG有65個。Hoxd11 exon-1的CpG數(shù)量

4、明顯高于第二外顯子（12個）。這些特征與 Hoxc8基因非常接近。Hoxc8和Hoxd11 exon-1序列中的高密度CpG，提示這兩個序列有可能是甲基化的高發(fā)區(qū)。
　　德國美利奴、道塞特、澳洲美利奴等國外品種的Hoxc8和Hoxd11，與蒙古羊相比，存在品種差異。蒙古羊Hoxc8基因發(fā)現(xiàn)5個突變位點（494 b，插入一個C；1120 b，C→T；1528 b，T→C；1922 b，A→G；2063 b，A→G），Hoxd11基因

5、發(fā)現(xiàn)3個突變位點（471 b，C→T；693 b，C→A；1034 b，G→A）。外國綿羊Hoxc8基因發(fā)現(xiàn)1個突變位點（1528 b，T→C），Hoxd11基因未發(fā)現(xiàn)突變位點。
　　Hoxc8基因exon-1的BSP結(jié)果，表明純種蒙古羊甲基化率與胸椎數(shù)有關；國外品種和雜交后代胸椎數(shù)與甲基化率無關；合子的甲基化率顯著高于精子甲基化率；表明了Hoxc8基因具有基因組印記特征。
　　外顯子序列的甲基化在轉(zhuǎn)錄和翻譯過程中的功能，與