版權(quán)說(shuō)明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請(qǐng)進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)
文檔簡(jiǎn)介
1、本研究利用4種方法,對(duì)桉樹(shù)EST-PCR產(chǎn)物的純化效果和測(cè)序結(jié)果進(jìn)行了比較。對(duì)測(cè)序試劑盒的不同用量的測(cè)序結(jié)果的分析。結(jié)果以乙醇-醋酸鈉法純化和Bigdye 1/1 6或1/32用量的測(cè)序方案,具有成本低和操作簡(jiǎn)便的優(yōu)點(diǎn),適合96孔板或384孔板大規(guī)模EST-PCR產(chǎn)物的測(cè)序。
從NCBI網(wǎng)站下載EST序列,設(shè)計(jì)引物2500對(duì),在尾葉桉中有1684對(duì)成功擴(kuò)增,引物通用率為67.36%。通過(guò)對(duì)EST-PCR產(chǎn)物直接測(cè)序,成功測(cè)
2、序有1197條EST,測(cè)序成功率為71.08%。其中在526條EST中共發(fā)現(xiàn)1456個(gè)SNPs,平均每404 bp有一個(gè)SNP。擴(kuò)增產(chǎn)物序列與原EST序列的同源性在80%以上有719條,占到總測(cè)出序列的60.67%,來(lái)自外顯子區(qū)域發(fā)現(xiàn)有472個(gè)SNPs。比較不同來(lái)源的EST的SNP發(fā)生頻率,初步判斷出尾葉桉與不同桉樹(shù)種的親緣關(guān)系遠(yuǎn)近。本研究表明在桉屬EST中開(kāi)發(fā)SNP的潛力很大。
以尾葉桉×細(xì)葉桉的2親本和132子代為作圖
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無(wú)特殊說(shuō)明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請(qǐng)下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請(qǐng)聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁(yè)內(nèi)容里面會(huì)有圖紙預(yù)覽,若沒(méi)有圖紙預(yù)覽就沒(méi)有圖紙。
- 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 眾賞文庫(kù)僅提供信息存儲(chǔ)空間,僅對(duì)用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對(duì)用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對(duì)任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
- 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請(qǐng)與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對(duì)自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- 葡萄EST-SNP標(biāo)記的開(kāi)發(fā)及應(yīng)用.pdf
- 櫛孔扇貝(Chlamys farreri)EST-SNP的開(kāi)發(fā)及其應(yīng)用.pdf
- 利用EST-CAPS標(biāo)記構(gòu)建桉樹(shù)遺傳圖譜.pdf
- 桉樹(shù)EST-CAPS標(biāo)記的開(kāi)發(fā)及其用于遺傳圖譜構(gòu)建的研究.pdf
- 一組新的桉樹(shù)EST-SSR標(biāo)記開(kāi)發(fā)及遺傳圖譜的整合.pdf
- 高丹草EST-SSR引物設(shè)計(jì)及遺傳圖譜的構(gòu)建.pdf
- 菠蘿蜜EST-SSR標(biāo)記發(fā)掘利用及遺傳圖譜構(gòu)建.pdf
- 芝麻EST-SSR開(kāi)發(fā)、遺傳圖譜構(gòu)建及棉花脂肪酸代謝相關(guān)基因克隆.pdf
- 楊梅果實(shí)EST文庫(kù)構(gòu)建.pdf
- 家蠶EST分析系統(tǒng)的構(gòu)建及初步分析.pdf
- 甘藍(lán)EST-SSR標(biāo)記開(kāi)發(fā)及應(yīng)用.pdf
- 玉米EST文庫(kù)的構(gòu)建、部分EST功能注釋及其數(shù)據(jù)庫(kù)的管理系統(tǒng).pdf
- 福建柏葉片cDNA文庫(kù)的構(gòu)建及EST分析.pdf
- 山西梨屬主要栽培品種EST-SSR指紋圖譜的構(gòu)建.pdf
- 基于大規(guī)模EST序列的SNP發(fā)掘的研究與實(shí)現(xiàn).pdf
- 小麥EST—SSR圖譜構(gòu)建及抗白粉病基因Pm16的SSR標(biāo)記研究.pdf
- 無(wú)患子葉片cDNA文庫(kù)的構(gòu)建及EST分析.pdf
- 49212.est功能注釋及數(shù)據(jù)挖掘平臺(tái)的構(gòu)建
- 山葡萄成熟果皮cDNA文庫(kù)的構(gòu)建及EST分析.pdf
- 烏拉爾甘草cDNA文庫(kù)的構(gòu)建及EST分析.pdf
評(píng)論
0/150
提交評(píng)論