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文檔簡介
1、甜瓜DNA指紋圖譜庫的建立對甜瓜品種純度及真實性鑒定、新品種權(quán)保護(hù)等有非常重要應(yīng)用價值,甜瓜遺傳多樣性的分析對雜種優(yōu)勢群劃分、種質(zhì)創(chuàng)新及新品種選育也有非常重要的指導(dǎo)意義。SSR標(biāo)記被認(rèn)為是指紋圖譜構(gòu)建最理想的標(biāo)記。本研究利用SSR標(biāo)記對PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系進(jìn)行了優(yōu)化,初次探討了多重SSR-PCR擴(kuò)增體系在甜瓜上的可行性,旨在提高鑒定效率及節(jié)省時間。在此基礎(chǔ)上,利用13份遺傳差異大的甜瓜種質(zhì)進(jìn)行核心引物的篩選,并通過核心引物對甜瓜種質(zhì)進(jìn)行指
2、紋圖譜構(gòu)建、遺傳多樣性分析以及對甜瓜雜交組合進(jìn)行純度鑒定,主要研究結(jié)果如下:
1.對PCR擴(kuò)增體系中的模板DNA、dNTPs、引物、Taq酶及Mg2+的濃度進(jìn)行梯度設(shè)計,得到了最優(yōu)PCR擴(kuò)增體系,同時建立了適用于甜瓜的雙重SSR-PCR擴(kuò)增體系,使得SSR檢測效率提高了2倍,節(jié)省了成本。
2.從174對SSR引物中篩選了22對核心引物,在13個甜瓜種質(zhì)中共擴(kuò)增了77個多態(tài)性位點,每對引物可以檢測到2~4條數(shù)目不等的多
3、態(tài)性條帶,平均為3.5條,多態(tài)性信息含量(PIC)為0.737~0.839,平均0.806,22對引物中有18對分布在甜瓜的10對染色體上。
3.利用22對核心引物構(gòu)建了52份甜瓜種質(zhì)的指紋代碼,并將其全部轉(zhuǎn)化為二維編碼,其中有7組具有相同指紋代碼的材料,總共涉及23份材料,其余29份甜瓜種質(zhì)的指紋代碼是唯一的。
4.基于20個形態(tài)性狀的聚類分析結(jié)果顯示,遺傳相似系數(shù)為0.07~0.72,平均為0.39,遺傳相似系數(shù)
4、大于0.07時,所有甜瓜種質(zhì)可劃分為9大組群,且組群Ⅰ至組群Ⅳ的多樣性偏低,組群Ⅴ至組群Ⅸ的甜瓜種質(zhì)遺傳多樣性依次增高。
5.基于22對核心引物聚類分析結(jié)果顯示,遺傳相似相系數(shù)在0.55~1.00,平均為0.78。當(dāng)遺傳相似系數(shù)大于0.55時可將95份甜瓜種質(zhì)分為薄皮甜瓜和厚皮甜瓜兩大類,同時這兩大類又可按不同變種分為不同的亞類。
6.用74對SSR引物對16個甜瓜組合進(jìn)行篩選,獲得了10對表現(xiàn)出多態(tài)性和共顯性的引物
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