2023年全國碩士研究生考試考研英語一試題真題(含答案詳解+作文范文)_第1頁
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文檔簡介

1、鄰苯二甲酸二丁酯(DBP)是鄰苯二甲酸酯類化合物(Phthalic acid esters,PAEs)中常見的一種的塑料增塑劑,被普遍用在家具和汽車內(nèi)飾等的生產(chǎn)和使用中。由于DBP與PVC樹脂間是以氫鍵或者范德華力連接,因此DBP在產(chǎn)品中很容易擴(kuò)散到環(huán)境中。DBP具有生殖毒性,且具有致癌性、致畸性、致突變性,因此DBP已被美國環(huán)保局(USEPA)列為優(yōu)先控制污染物。由于DBP的性質(zhì)穩(wěn)定,在自然環(huán)境中不易降解,而微生物降解是降解DBP的主

2、要方式。
  目前,國內(nèi)外已有大量研究者成功篩選到DBP高效降解菌株,并且也有學(xué)者對降解菌的代謝路徑和降解基因展開了研究。但在以往的研究中,研究者通常選用傳統(tǒng)的研究方法如基因文庫、基因克隆等方法來挖掘功能基因,這些方法往往耗時長且僅能獲取很少的功能基因。隨著第二代測序技術(shù)的發(fā)展,RNA-seq測序技術(shù)逐漸得到了研究者的關(guān)注,該方法不僅運(yùn)行成本低,通量高,精確性高,而且可以對無參考基因組信息的物種進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,已被大量研究者使用來

3、研究生物的轉(zhuǎn)錄表達(dá)譜、功能基因的挖掘及差異表達(dá)基因分析。
  本研究采用HiSeq2000測序系統(tǒng)的Illumina/Solexa技術(shù)對500、1000和1500 mg/L的DBP處理分別與葡萄糖作為對照(CK)的DBP降解菌株Novosphingobium aromaticivoransDNB-S1進(jìn)行RNA-seq測序和差異表達(dá)基因分析,對降解菌株DNB-S1中的功能基因進(jìn)行深度挖掘。
  通過RNA-seq測序,我們得

4、到了DBP降解菌DNB-S1轉(zhuǎn)錄組的全面豐富的Unigenes信息。采用Trinity短序列組裝軟件對reads進(jìn)行序列組裝和拼接,CK與不同濃度DBP處理分別獲得不同數(shù)量的Unigene,分別是23287(CK)、9402(500 mg/L)、9209(1000 mg/L)、9576(1500 mg/L)。在500、1000和1500 mg/L DBP處理與CK的差異表達(dá)基因中,差異基因的個數(shù)分別是8166、8895和8467,其中上

5、調(diào)基因個數(shù)分別是751,752和747個,而相應(yīng)的下調(diào)基因個數(shù)分別為7414、7642和7719。差異基因的GO功能顯著性富集分析表明,Unigene占主導(dǎo)的是“催化活性”,“代謝過程”,“細(xì)胞生理過程”和“結(jié)合功能”。KEGG注釋結(jié)果顯示,Unigene富集的主要的路徑是“代謝途徑”,“次生代謝產(chǎn)物的生物合成”和“不同環(huán)境中的微生物代謝”。對功能基因的挖掘,發(fā)現(xiàn)了26個轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子,35個趨化蛋白,47個降解相關(guān)基因和2個解毒酶基因顯

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