單純病例研究

1、1,病例-病例研究（單純病例研究）,2,主要內(nèi)容,,3,一、基本概念、原理及特點,,基本概念,單純病例研究(case only study) 是近年來被廣泛應(yīng)用于疾病病因研究中評價基因與環(huán)境交互作用的一種方法, 該方法僅通過某一疾病患者群體來評價二者間的交互作用, 但不能評價二者各自的主效應(yīng)。 單純病例研究應(yīng)用的前提條件是: 在正常人群中基因型與環(huán)境暴露各自獨立發(fā)生; 且所研究疾病為罕見病(此時可用OR 來估計RR 值)。,4,一、基

2、本概念、原理及特點,單純病例研究的基本原理: 擬定某一患病人群作為研究對象(無需正常對照組) , 追溯每一成員環(huán)境暴露資料, 并收集病人的一般情況、混雜變量及其它宏觀資料, 采集病人的生物標(biāo)本, 采用分子生物學(xué)技術(shù)檢測基因型。以具有某一基因型的病例作為類病例組, 以無該基因型的病例作為類對照組(當(dāng)基因型別較多時, 也可以分成多組資料) , 調(diào)整其他協(xié)變量(如年齡、性別、種族、職業(yè)等) 后, 根據(jù)基因型與環(huán)境暴露情況, 采用標(biāo)準(zhǔn)粗分析或非

3、條件logistic模型等估計二者在疾病發(fā)生中的相乘模型交互作用。,基本原理,5,一、基本概念、原理及特點,圖1 單純病例研究基本原理示意圖,,,,,,,,確定某一患者群體作為研究對象,收集病人的一般情況、協(xié)變量、環(huán)境暴露資料, 并采集生物標(biāo)本,采用分子生物學(xué)技術(shù)檢測基因型,根據(jù)某一基因型的有無將研究對象分為類病例組和類對照組,統(tǒng)計分析,計算OR 值、P 值,判斷有無相乘模型交互作用及顯著性意義,若有, 進一步判斷為正相乘作用, 或負(fù)

4、相乘作用,,,,,,,6,一、基本概念、原理及特點,1　屬于遺傳流行病學(xué)范疇2　僅設(shè)立病例組, 無需正常對照組3　宏觀與微觀相結(jié)合4　調(diào)查方向是縱向的、回顧性的,特點,7,二、單純病例研究的設(shè)計步驟及樣本量的估計,1　確定研究目的2　確定研究對象3　確定研究變量4　資料收集5　資料分析,設(shè)計步驟,8,二、單純病例研究的設(shè)計步驟及樣本量的估計,樣本含量的影響因素：正常人群中估計的環(huán)境暴露率e, 基因型頻率g估計的基因型與

5、環(huán)境暴露的交互作用ORca 無該基因型組環(huán)境暴露作用的OR 值ORe, 無環(huán)境暴露組易感基因型作用的OR值ORg所希望達(dá)到的檢驗顯著性水平, 即統(tǒng)計學(xué)檢驗假設(shè)所允許犯假陽性錯誤的概率A5.所希望達(dá)到的檢驗把握度(1- B) , B為統(tǒng)計學(xué)檢驗假設(shè)所允許犯假陰性錯誤的概率樣本大小計算方法：,樣本量估計,9,,,10,三、資料分析及結(jié)果解釋,,二分變量遺傳與環(huán)境交互作用的估計,11,三、資料分析及結(jié)果解釋,因ORca= ORge/(

6、ORg·ORe) ，當(dāng)ORca> 1 時,有正相乘模型交互作用；當(dāng)ORca= 1 時, 無相乘模型交互作用；當(dāng)ORca< 1 時, 有負(fù)相乘模型交互作用。,12,三、資料分析及結(jié)果解釋,對于二分變量或多項變量資料, 可采用非條件logist ic 回歸模型進行分析。,非條件log istic 回歸模型估計基因型與環(huán)境暴露交互作用,13,四、與病例對照研究交互作用結(jié)果的比較,與病例對照研究交互作用結(jié)果進行比較時

7、, 主要應(yīng)注意的問題： 1.當(dāng)單純病例研究的零假設(shè)完全成立, 即在正常人群中基因型與環(huán)境暴露各自獨立發(fā)生; 且所研究疾病為罕見病時, 單純病例研究估計交互作用比病例對照研究更為精確, 即可信區(qū)間更窄。,14,四、與病例對照研究交互作用結(jié)果的比較,2.當(dāng)疾病頻率較高, 基因型頻率較低, 基因主效應(yīng)作用較大時, 單純病例研究低估了疾病遺傳與環(huán)境交互作用的大小。 因此, 單純病例研究特別適合罕見病的研究, 一般所研究疾病患病率

8、不超過5% , 且基因外顯率不宜過大。,15,五、單純病例研究的優(yōu)缺點(與病例對照研究比較),優(yōu)點?、?特別適合腫瘤及罕見慢性病的研究; ②在檢測基因與環(huán)境交互作用時, 可信區(qū)間更窄; ③所需樣本量小于病例對照研究樣本量的一半; ④因無對照組, 從而避免了對照選擇所引起的偏倚; ⑤節(jié)省人力、物力、時間并較易組織實施。,16,五、單純病例研究的優(yōu)缺點(與病例對照研究比較),缺點　 ①只可以估計遺傳與環(huán)境交互作用(且為相乘作用)

9、, 無法計算二者各自的主效應(yīng); ②不適用于基因外顯率高的疾病的研究; ③所研究疾病患病率不宜超過5%; ④除了可出現(xiàn)病例對照研究的病例選擇所引起的常見偏倚外, 還存在不同亞人群暴露率和基因型頻率不一致所引起的偏倚。,17,實例,Porta 等做了一項關(guān)于咖啡飲用與K-ras 基因突變同胰腺癌關(guān)系的研究(J Epidemiol Community Health. 1999; 53: 702～ 709)1.研究目的　分析咖啡飲用與K

10、-ras 基因突變在胰腺癌發(fā)生中的相互關(guān)系。2.研究方法　應(yīng)用單純病例研究, 采用問卷調(diào)查的方式收集西班牙5所醫(yī)院近3年來新確診的185例胰腺癌病人的一般情況、咖啡飲用情況及其他資料; 共采集121例胰腺癌病人癌腫部位組織; 同時應(yīng)用石蠟包埋組織法擴增DNA ,并用RFLP 法檢測K-ras 基因突變。,18,實例,3　結(jié)果與分析　主要分析咖啡飲用與K-ras 基因突變在胰腺癌發(fā)生中的交互作用(表2)。,19,實例,由表2 可知,