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1、1第一章第一章緒論緒論1.基因工程的定義:基因工程的定義:在體外對(duì)不同生物的遺傳物質(zhì)(基因)進(jìn)行剪切、重組、連接,然后插入到載體分子中(細(xì)菌質(zhì)粒、病毒或噬菌體DNA),轉(zhuǎn)入微生物、植物或動(dòng)物細(xì)胞內(nèi)進(jìn)行無(wú)性繁殖,并表達(dá)出基因產(chǎn)物。2.基因工程理論上的三大發(fā)現(xiàn)和技術(shù)上的三大發(fā)現(xiàn)基因工程理論上的三大發(fā)現(xiàn)和技術(shù)上的三大發(fā)現(xiàn)3.基因工程的基本步驟基因工程的基本步驟(1)目的基因的獲?。簭膹?fù)雜的生物基因組中,經(jīng)過(guò)酶切消化或PCR擴(kuò)增等步驟,分離出帶
2、有目的基因的DNA片斷。(2)重組體的制備:將目的基因的DNA片斷插入到能自我復(fù)制并帶有選擇性標(biāo)記(抗菌素抗性)的載體分子上。(3)重組體的轉(zhuǎn)化:將重組體(載體)轉(zhuǎn)入適當(dāng)?shù)氖荏w細(xì)胞中。(4)克隆鑒定:挑選轉(zhuǎn)化成功的細(xì)胞克?。ê心康幕颍#?)目的基因表達(dá):使導(dǎo)入寄主細(xì)胞的目的基因表達(dá)出我們所需要的基因產(chǎn)物。4.基因工程的意義基因工程的意義(1)基因工程在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中的應(yīng)用:提高植物的光合作用率;提高豆科植物的固氮效率;轉(zhuǎn)基因植物;轉(zhuǎn)基
3、因動(dòng)物。(2)基因工程在工業(yè)中的應(yīng)用:1)纖維素的開(kāi)發(fā)利用:克隆各種參與纖維素降解的酶的基因,導(dǎo)入釀酒酵母,就可能利用廉價(jià)的纖維素來(lái)生產(chǎn)葡萄糖,發(fā)酵成酒。2)釀酒工業(yè):用外源基因改造釀酒酵母,產(chǎn)生優(yōu)質(zhì)的啤酒。或用釀酒酵母生產(chǎn)蛋白質(zhì)等。(3)基因工程在醫(yī)藥上的應(yīng)用:用微生物生產(chǎn)藥物;用轉(zhuǎn)基因植物或動(dòng)物生產(chǎn)藥物;設(shè)計(jì)高效高特異性的生物制劑疫苗;制造新型疫苗;基因診斷;法醫(yī)鑒定;基因治療。(4)基因工程在環(huán)境保護(hù)中的作用:1)檢測(cè)水污染:用重
4、組細(xì)菌或轉(zhuǎn)基因魚(yú)等檢測(cè)水污染2)生物降解:用帶有重組質(zhì)粒的“超級(jí)菌”分解油(烷烴類(lèi))、有機(jī)農(nóng)藥污染。(5)基因工程商業(yè)化的發(fā)展第二章第二章基因工程主要技術(shù)原理基因工程主要技術(shù)原理1質(zhì)粒和基因組質(zhì)粒和基因組DNA的提取方法與純化步驟,主要試劑是什么的提取方法與純化步驟,主要試劑是什么質(zhì)粒的提取和純化方法質(zhì)粒的提取和純化方法最常用的為堿抽提法:原理:閉合環(huán)狀的質(zhì)粒DNA,在變性后不會(huì)分離,復(fù)性快。染色體線性DNA和或有缺口的質(zhì)粒DNA變性后
5、雙鏈分離,難以復(fù)性而形成纏繞的結(jié)構(gòu),與蛋白質(zhì)SDS復(fù)合物結(jié)合在一起,在離心的時(shí)候沉淀下去。步驟:1)溶菌:溶液I(50mM葡萄糖,25mMTrisHCl,10mMEDTA45mgml溶菌酶)2)破膜:溶液II(0.2NNaOH1.0%SDS)3)中和:溶液III(3M醋酸鈉pH4.8)4)離心5)轉(zhuǎn)移:將上清轉(zhuǎn)移到一個(gè)新的離心管中6)抽提:酚氯仿抽提,酚氯仿異戊醇—252417)沉淀:用0.6倍體積的異戊醇或2倍體積的乙醇(可以加入11
6、0體積的3M醋酸銨輔助沉淀)基因組基因組DNA的提取純化方法的提取純化方法3Tm也受介質(zhì)中離子強(qiáng)度的影響,離子強(qiáng)度低,熔解溫度也低。復(fù)性復(fù)性:在適當(dāng)條件下,變性DNA的兩條互補(bǔ)單鏈重新結(jié)合,形成雙鏈的過(guò)程稱為復(fù)性。在熱變性后,當(dāng)溫度緩慢冷卻至比Tm值低2030℃時(shí),變性的單鏈DNA即可恢復(fù)雙鏈螺旋結(jié)構(gòu),這樣的復(fù)性又稱為退火。預(yù)雜交:預(yù)雜交:為了減少探針與廣泛存在的非互補(bǔ)核酸的非特異性結(jié)合,在雜交前可用封閉物將這些非特異位點(diǎn)封閉。在雜前的
7、這些處理過(guò)程稱為預(yù)雜交類(lèi)型類(lèi)型:根據(jù)核酸的來(lái)源、種類(lèi)和形式分為Southernblot,Nthernblot,菌落原位雜交,斑點(diǎn)雜交,組織原位雜交Southernblot:DNA分子—限制性酶切為限制片段—瓊脂糖凝膠電泳—NaOH變性—轉(zhuǎn)膜固定—雜交—顯影Nthernblot:提取T、Cell總RNA—提純分離mRNA—瓊脂糖凝膠電泳分離RNA—轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜—雜交檢測(cè)斑點(diǎn)雜交:斑點(diǎn)雜交:其原理與步驟與Southern印跡雜交相似,
8、所不同的是不進(jìn)行核酸的酶解和電泳分離,直接將變性的DNA或RNA加到固相載體上。菌落菌落噬菌斑原位雜交:噬菌斑原位雜交:直接將菌落(噬菌斑)原位轉(zhuǎn)移到固相載體上,不必進(jìn)行核酸的分離純化、酶解和電泳分離。溶菌(噬菌斑)變性后直接進(jìn)行特異核酸(DNA或RNA)分子的雜交技術(shù),結(jié)果直接找出相應(yīng)的陽(yáng)性重組子菌落(噬菌斑)。組織組織細(xì)胞原位雜交:細(xì)胞原位雜交:用標(biāo)記的已知核酸序列為探針,使其與細(xì)胞、組織、染色體或切片中核酸進(jìn)行雜交檢測(cè)的方法稱為原
9、位雜交。原位雜交的類(lèi)型:DNADNA、DNARNA、RNARNA雜交?;蛐酒夯蛐酒夯蛐酒侵笇⒋罅刻结?lè)肿庸潭ㄓ谥С治锷希缓笈c標(biāo)記的樣品進(jìn)行雜交,通過(guò)檢測(cè)雜交信號(hào)的強(qiáng)度及分布進(jìn)而獲取樣品中靶分子的數(shù)量和序列信息。6.PCR概念、概念、PCR技術(shù)的基本原理及特點(diǎn)、引物設(shè)計(jì)要求及常見(jiàn)問(wèn)題技術(shù)的基本原理及特點(diǎn)、引物設(shè)計(jì)要求及常見(jiàn)問(wèn)題PCR概念:概念:應(yīng)用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PolymeraseChainReaction,PCR)技術(shù),
10、在體外特異性地?cái)U(kuò)增某個(gè)基因。PCR技術(shù)的基本原理:技術(shù)的基本原理:類(lèi)似于DNA的天然復(fù)制過(guò)程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補(bǔ)的寡核苷酸引物。PCR由變性退火延伸三個(gè)基本反應(yīng)步驟構(gòu)成。變性:升高溫度使模板DNA變性、雙鏈分開(kāi)。退火:再降低溫度使引物與模板DNA配對(duì)互補(bǔ)結(jié)合。延伸:然后升溫到聚合酶反應(yīng)適宜的溫度,此時(shí)在聚合酶催化下,從引物3’羥基端開(kāi)始,與模板DNA上的堿基配對(duì)逐個(gè)加上核苷酸,合成新的DNA鏈。循環(huán):其后再按高溫變性、低溫退
11、火、適溫合成三步反復(fù)循環(huán),新合成的DNA在下一循環(huán)中又作為模板使用,每循環(huán)一次,合成的目的序列擴(kuò)增一倍。經(jīng)過(guò)多次循環(huán)使DNA含量顯著提高。特點(diǎn):特點(diǎn):靈敏度高、特異性強(qiáng)、快速檢測(cè)、定量準(zhǔn)確、重復(fù)性好特異性強(qiáng)PCR反應(yīng)的特異性決定因素為:①引物與模板DNA特異正確的結(jié)合;②堿基配對(duì)原則;③TaqDNA聚合酶合成反應(yīng)的忠實(shí)性;④靶基因的特異性與保守性。引物設(shè)計(jì)要求:引物設(shè)計(jì)要求:?引物長(zhǎng)度(length):20~30bp?GC含量以4060
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