基因工程期末復(fù)習(xí)_第1頁
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文檔簡介

1、基因工程第一章:1.基因工程:在分子水平上進行的遺傳操作,指將一種或多種生物體的基因或基因組提取出來,或者人工合成的基因,按照人們的愿望進行嚴密的設(shè)計,經(jīng)過體外加工重組,轉(zhuǎn)移到另一種生物體的細胞內(nèi),使之能在受體細胞遺傳并獲得新的遺傳性狀的技術(shù)。供體、受體、載體是重組DNA技術(shù)的三大基本元件。(工具酶也是必備元件)基本用途:大規(guī)模生產(chǎn)生物活性物質(zhì),設(shè)計、構(gòu)建生物的新性狀甚至新物種。2.基因工程研究的主要內(nèi)容:目的基因的分離與制備,基因工程

2、研究的主要內(nèi)容:目的基因的分離與制備,DNA片段和載體的連接,外源片段和載體的連接,外源DNA片段引入受體細胞,選擇目的基因,目的基因表達。片段引入受體細胞,選擇目的基因,目的基因表達。3.基因工程的意義:大規(guī)模生產(chǎn)生物分子,設(shè)計構(gòu)建新物種,搜尋、分離和鑒定生物體?;蚬こ痰囊饬x:大規(guī)模生產(chǎn)生物分子,設(shè)計構(gòu)建新物種,搜尋、分離和鑒定生物體。發(fā)展前景:農(nóng)林牧漁業(yè)中的應(yīng)用,工業(yè)中的應(yīng)用,在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用。發(fā)展前景:農(nóng)林牧漁業(yè)中的應(yīng)用,工業(yè)中的

3、應(yīng)用,在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用。第二章:(結(jié)合課本劃線內(nèi)容)第二章:(結(jié)合課本劃線內(nèi)容)1.限制性核酸內(nèi)切酶的發(fā)現(xiàn)及其生物功能:識別雙鏈限制性核酸內(nèi)切酶的發(fā)現(xiàn)及其生物功能:識別雙鏈DNA分子中的特定序列,并切割分子中的特定序列,并切割DNA雙鏈,主要存在于原核細菌中,幫助細菌限制外來雙鏈,主要存在于原核細菌中,幫助細菌限制外來DNA的入侵;(發(fā)現(xiàn)的現(xiàn)象:寄的入侵;(發(fā)現(xiàn)的現(xiàn)象:寄主細胞的限制和修飾作用。主細胞的限制和修飾作用。)hsdR:編碼限制

4、性核酸內(nèi)切酶,:編碼限制性核酸內(nèi)切酶,hsdM:編碼限制性甲基化:編碼限制性甲基化酶,酶,hsdS:編碼限制性酶和甲基化酶的協(xié)同表達。:編碼限制性酶和甲基化酶的協(xié)同表達。(限制核酸內(nèi)切酶類型:(限制核酸內(nèi)切酶類型:I型,型,II型,型,III型;)型;)2.屬名屬名種名種名株名株名Haemophilusinfluenzaed嗜血流感桿菌嗜血流感桿菌d株先后分離出先后分離出3種限種限制酶:制酶:HindIHindIIHindIII,EcI

5、在抗藥性在抗藥性R質(zhì)粒上發(fā)現(xiàn)的第一個酶。質(zhì)粒上發(fā)現(xiàn)的第一個酶。同尾酶:識別不同的序列,能產(chǎn)生相同的黏性末端的酶;同位酶:不同微生物來源的酶,同尾酶:識別不同的序列,能產(chǎn)生相同的黏性末端的酶;同位酶:不同微生物來源的酶,能識別相同的序列,切割方式相同或不相同。能識別相同的序列,切割方式相同或不相同。3.II型限制性核酸內(nèi)切酶的切割方式:在識別序列的對稱軸上同時切割形成平末端如型限制性核酸內(nèi)切酶的切割方式:在識別序列的對稱軸上同時切割形成平

6、末端如EcV在識別序列的雙側(cè)末端進行切割,若于對稱軸在識別序列的雙側(cè)末端進行切割,若于對稱軸5‘端突出的末端如‘端突出的末端如EcI反之產(chǎn)生反之產(chǎn)生3’端突出的末端如端突出的末端如PstI。限制性核酸內(nèi)切酶反應(yīng)的注意事項:限制性核酸內(nèi)切酶為濃縮酶;濃縮的酶液要用核酸內(nèi)限制性核酸內(nèi)切酶反應(yīng)的注意事項:限制性核酸內(nèi)切酶為濃縮酶;濃縮的酶液要用核酸內(nèi)切酶緩沖液稀釋,切酶緩沖液稀釋,(不能用水稀釋,以免酶變性)(不能用水稀釋,以免酶變性);核酸

7、內(nèi)切酶在含有;核酸內(nèi)切酶在含有50%甘油的緩沖液甘油的緩沖液中,于中,于20度穩(wěn)定保存;反應(yīng)中盡可能少加水,使反應(yīng)體積減到最小;延長反應(yīng)時間,使度穩(wěn)定保存;反應(yīng)中盡可能少加水,使反應(yīng)體積減到最小;延長反應(yīng)時間,使所需酶量減少。所需酶量減少。影響限制性核酸內(nèi)切酶活性的因素:影響限制性核酸內(nèi)切酶活性的因素:DNA樣品的純度;樣品的純度;DNA樣品的甲基化程度;核酸內(nèi)樣品的甲基化程度;核酸內(nèi)切酶的緩沖液性質(zhì);切酶的緩沖液性質(zhì);4.DNA連接酶

8、基本性質(zhì):修復(fù)雙鏈連接酶基本性質(zhì):修復(fù)雙鏈DNA上缺口處的磷酸二酯鍵;修復(fù)與上缺口處的磷酸二酯鍵;修復(fù)與RNA鏈結(jié)合的鏈結(jié)合的DNA鏈上缺口處的磷酸二酯鍵;連接多個平頭雙鏈鏈上缺口處的磷酸二酯鍵;連接多個平頭雙鏈DNA分子。分子。(注意:(注意:DNA連接酶所連連接酶所連接的是接的是DNA分子上相鄰核苷酸之間的切口,即分子上相鄰核苷酸之間的切口,即Nick鏈接,不能鏈接兩條單鏈鏈接,不能鏈接兩條單鏈DNA或環(huán)或環(huán)化的單鏈化的單鏈DNA分

9、子。分子。)DNA連接酶的種類:連接酶的種類:T4噬菌體噬菌體DNA連接酶(最常連接酶(最常用)用)、大腸桿菌、大腸桿菌DNA連接酶(最常見)連接酶(最常見)、T4噬菌體噬菌體RNA連接酶。連接酶。5.DNA聚合酶:⑴大腸桿菌聚合酶:⑴大腸桿菌DNA聚合酶聚合酶I的基本性質(zhì):的基本性質(zhì):5‘→3‘的DNA聚合酶活性;聚合酶活性;5‘→3‘的核酸外切酶活性;的核酸外切酶活性;3‘→5‘的核酸外切酶活性。用途:主要用于雜交探針的制備。的核酸

10、外切酶活性。用途:主要用于雜交探針的制備。切口平移法是目前實驗室中最常用的一種脫氧核糖核酸探針標記法。切口平移法是目前實驗室中最常用的一種脫氧核糖核酸探針標記法。⑵Klenow酶的基本性質(zhì):大腸桿菌酶的基本性質(zhì):大腸桿菌DNA聚合酶聚合酶I經(jīng)枯草桿菌蛋白酶處理,獲得經(jīng)枯草桿菌蛋白酶處理,獲得N端三分端三分之二的大肽段,即為之二的大肽段,即為Klenow酶;酶;Klenow酶仍擁有酶仍擁有5‘→3‘的DNA聚合酶活性和聚合酶活性和3‘→5

11、‘的核酸外切酶活性,但失去了酸外切酶活性,但失去了5‘→3‘的核酸外切酶活性。的核酸外切酶活性。Klenow酶的基本用途:補平由核酸內(nèi)酶的基本用途:補平由核酸內(nèi)切酶產(chǎn)生的切酶產(chǎn)生的5‘粘性末端;粘性末端;DNA片段的同位素末端標記;片段的同位素末端標記;cDNA第二鏈的合成;雙脫氧末端第二鏈的合成;雙脫氧末端質(zhì)粒。質(zhì)粒。雖然帶有自我復(fù)制所必需的遺傳信息,但失去了控制細菌配對和質(zhì)粒接合轉(zhuǎn)移的基因,因雖然帶有自我復(fù)制所必需的遺傳信息,但失去

12、了控制細菌配對和質(zhì)粒接合轉(zhuǎn)移的基因,因此不能從一個細胞轉(zhuǎn)移到另一個細胞。在天然條件下不能自己轉(zhuǎn)移到另一個細胞中。大部此不能從一個細胞轉(zhuǎn)移到另一個細胞。在天然條件下不能自己轉(zhuǎn)移到另一個細胞中。大部分屬于松弛型質(zhì)粒,符合基因工程的安全要求。注:基因工程中所用的非接合型質(zhì)粒載體分屬于松弛型質(zhì)粒,符合基因工程的安全要求。注:基因工程中所用的非接合型質(zhì)粒載體缺乏轉(zhuǎn)移所必須的缺乏轉(zhuǎn)移所必須的mob基因,所以不能發(fā)生自我轉(zhuǎn)移?;?,所以不能發(fā)生自我轉(zhuǎn)

13、移。質(zhì)粒的復(fù)制類型:質(zhì)粒的復(fù)制類型:1.嚴緊型質(zhì)粒:拷貝數(shù)少,只有嚴緊型質(zhì)粒:拷貝數(shù)少,只有1—3份拷貝。份拷貝。2.松弛型質(zhì)粒:拷貝數(shù)松弛型質(zhì)粒:拷貝數(shù)多,有多,有10—60份拷貝。份拷貝。3理想質(zhì)粒載體的必備條件:常見可用于基因工程的天然質(zhì)粒有理想質(zhì)粒載體的必備條件:常見可用于基因工程的天然質(zhì)粒有pSC101、CoLEl。第一個。第一個用于基因克隆的天然質(zhì)粒是用于基因克隆的天然質(zhì)粒是pSC101,是一個嚴緊型質(zhì)粒,每個宿主細胞僅有,

14、是一個嚴緊型質(zhì)粒,每個宿主細胞僅有12個拷貝,個拷貝,具有多個限制性核酸內(nèi)切酶的單一酶切位點;另一個天然質(zhì)粒載體是具有多個限制性核酸內(nèi)切酶的單一酶切位點;另一個天然質(zhì)粒載體是CoLEl,它唯一單酶,它唯一單酶切位點切位點EcI位于大腸桿菌素位于大腸桿菌素EI的編碼基因內(nèi)。的編碼基因內(nèi)。質(zhì)粒載體必須具備的基本條件:(質(zhì)粒載體必須具備的基本條件:(1)具有復(fù)制起點;()具有復(fù)制起點;(2)具有抗菌素抗性基因;()具有抗菌素抗性基因;(3)若

15、)若干限制性內(nèi)切酶的單一位點;(干限制性內(nèi)切酶的單一位點;(4)具有較小的分子量和較高的拷貝數(shù)。)具有較小的分子量和較高的拷貝數(shù)。多克隆位點:指載體上人工合成的含有緊密排列的多種限制性核酸內(nèi)切酶酶切位點的多克隆位點:指載體上人工合成的含有緊密排列的多種限制性核酸內(nèi)切酶酶切位點的DNA片段。片段。抗菌素抗性抗菌素抗性:氨芐青霉素抗性氨芐青霉素抗性(殺死生長的細菌殺死生長的細菌),卡那霉素抗性(殺死細菌),卡那霉素抗性(殺死細菌),四環(huán)素抗

16、性,四環(huán)素抗性(殺死生長的細菌殺死生長的細菌),鏈霉素抗性(殺死細菌),鏈霉素抗性(殺死細菌),氯霉素抗性(殺死生長的細菌),氯霉素抗性(殺死生長的細菌)。3.重要的大腸桿菌質(zhì)粒載體:(重要的大腸桿菌質(zhì)粒載體:(1)pBR322:松弛型復(fù)制、氯霉素可擴增、拷貝數(shù):松弛型復(fù)制、氯霉素可擴增、拷貝數(shù)50100cell、用于基因克隆。、用于基因克隆。(2)pUC1819:拷貝數(shù):拷貝數(shù)20003000cell、裝有多克隆位點、裝有多克隆位點(

17、MCS)正選擇顏色標記正選擇顏色標記lacZ、用于基因克隆和測序。注:、用于基因克隆和測序。注:pUC7是最早構(gòu)建的一種是最早構(gòu)建的一種PUC質(zhì)粒載質(zhì)粒載體。體。pGEM3Z:多拷貝、裝有多克隆位點(:多拷貝、裝有多克隆位點(MCS)、正選擇顏色標記、正選擇顏色標記lacZ、用于外源基因的高、用于外源基因的高效表達。效表達??寺≥d體:指專用于基因或克隆載體:指專用于基因或DNA片段無性繁殖的質(zhì)體載體。片段無性繁殖的質(zhì)體載體。(名詞解(名

18、詞解釋)釋)4.容菌周期(裂解周期):感染細菌后立即在菌體內(nèi)復(fù)制和合成蛋白質(zhì)外殼,重新組裝成容菌周期(裂解周期):感染細菌后立即在菌體內(nèi)復(fù)制和合成蛋白質(zhì)外殼,重新組裝成噬菌體顆粒,并導(dǎo)致細菌細胞解體,釋放出大量子代噬菌體。容原性周期:感染細菌后,噬菌體顆粒,并導(dǎo)致細菌細胞解體,釋放出大量子代噬菌體。容原性周期:感染細菌后,將自己的將自己的DNA整合到細菌的染色體整合到細菌的染色體DNA中。形成這一過程稱為溶源化。中。形成這一過程稱為溶源

19、化。5.單鏈環(huán)狀單鏈環(huán)狀DNA的絲狀大腸桿菌噬菌體:的絲狀大腸桿菌噬菌體:M13、f1、fd噬菌體。噬菌體。特點:單鏈特點:單鏈DNA;復(fù)制型(;復(fù)制型(RF)是雙鏈環(huán)狀)是雙鏈環(huán)狀DNA;RFDNA和ssDNA都能轉(zhuǎn)染感受態(tài)都能轉(zhuǎn)染感受態(tài)大腸桿菌。并產(chǎn)生噬菌斑;不存在包裝限制;可產(chǎn)生大量的含有外源大腸桿菌。并產(chǎn)生噬菌斑;不存在包裝限制;可產(chǎn)生大量的含有外源DNA插入片插入片斷的單斷的單鏈分子,便于作探針或測序。鏈分子,便于作探針或測序

20、。(1)M13噬菌體基本特性:寄主;噬菌體基本特性:寄主;DNA長度:長度:6407bp;DNA提純:容易提??;沒有包提純:容易提??;沒有包裝限制。優(yōu)點:(裝限制。優(yōu)點:(1)有)有MCS,便于克隆不同的酶切片段(,便于克隆不同的酶切片段(2)Xgal顯色反應(yīng),可供直接顯色反應(yīng),可供直接選擇(選擇(3)無包裝限制,克隆能力大()無包裝限制,克隆能力大(4)可以克隆雙鏈)可以克隆雙鏈DNA分子中的每一條鏈。缺點:分子中的每一條鏈。缺點:插

21、入外源插入外源DNA后,遺傳穩(wěn)定性顯著下降。后,遺傳穩(wěn)定性顯著下降。人工染色體:酵母人工染色體(人工染色體:酵母人工染色體(YAC)、細菌人工染色體(、細菌人工染色體(BAC)、P1派生人工染色體、派生人工染色體、哺乳動物人工染色體(哺乳動物人工染色體(MAC)。第四章第四章1.基因組基因組DNA提取方法:堿抽提法(最常用)提取方法:堿抽提法(最常用)、煮沸法、去污劑裂解法。、煮沸法、去污劑裂解法。堿抽提法提取質(zhì)粒堿抽提法提取質(zhì)粒DNA

22、原理:閉合環(huán)狀的質(zhì)粒原理:閉合環(huán)狀的質(zhì)粒DNA,在變性后不會分離,復(fù)性快,染色,在變性后不會分離,復(fù)性快,染色體線性體線性DNA和或有缺口的質(zhì)粒和或有缺口的質(zhì)粒DNA變性后雙鏈分離,難以復(fù)性而形成纏繞的結(jié)構(gòu),與蛋變性后雙鏈分離,難以復(fù)性而形成纏繞的結(jié)構(gòu),與蛋白質(zhì)白質(zhì)—SDS復(fù)合物結(jié)合在一起,在離心的時候沉淀下去。復(fù)合物結(jié)合在一起,在離心的時候沉淀下去。堿抽提法提取質(zhì)粒堿抽提法提取質(zhì)粒DNA的步驟:溶菌;破膜,蛋白質(zhì)和的步驟:溶菌;破膜,

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