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1、包涵體的純化和復(fù)性總結(jié)(二)包涵體的純化和復(fù)性總結(jié)(二)關(guān)于包涵體的純化是一個令人頭疼的問題,包涵體的復(fù)性已經(jīng)成為生物制藥的瓶頸,關(guān)于包涵體的處理一般包括這么幾步:菌體的破碎、包涵體的洗滌、溶解、復(fù)性以及純化,內(nèi)容比較龐雜一、菌體的裂解1、怎樣裂解細(xì)菌?細(xì)胞的破碎方法1.高速組織搗碎:將材料配成稀糊狀液,放置于筒內(nèi)約13體積,蓋緊筒蓋,將調(diào)速器先撥至最慢處,開動開關(guān)后,逐步加速至所需速度。此法適用于動物內(nèi)臟組織、植物肉質(zhì)種子等。2.玻璃
2、勻漿器勻漿:先將剪碎的組織置于管中,再套入研桿來回研磨,上下移動,即可將細(xì)胞研碎,此法細(xì)胞破碎程度比高速組織搗碎機(jī)為高,適用于量少和動物臟器組織。3.超聲波處理法:用一定功率的超聲波處理細(xì)胞懸液,使細(xì)胞急劇震蕩破裂,此法多適用于微生物材料,用大腸桿菌制備各種酶,常選用50100毫克菌體毫升濃度,在1KG至10KG頻率下處理1015分鐘,此法的缺點(diǎn)是在處理過程會產(chǎn)生大量的熱,應(yīng)采取相應(yīng)降溫措施,時間以及超聲間歇時間、超聲時間可以自己調(diào)整,
3、超聲完全了菌液應(yīng)該變清亮,如果不放心可以在顯微鏡下觀察。對超聲波及熱敏感的蛋白和核酸應(yīng)慎用。4.反復(fù)凍融法:將細(xì)胞在20度以下冰凍,室溫融解,反復(fù)幾次,由于細(xì)胞內(nèi)冰粒形成和剩余細(xì)胞液的鹽濃度增高引起溶脹,使細(xì)胞結(jié)構(gòu)破碎。5.化學(xué)處理法:有些動物細(xì)胞,例如腫瘤細(xì)胞可采用十二烷基磺酸鈉(SDS)、去氧膽酸鈉等細(xì)胞膜破壞,細(xì)菌細(xì)胞壁較厚,可采用溶菌酶處理效果更好,我用的濃度一般為1mgml。無論用哪一種方法破碎組織細(xì)胞,都會使細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)或核
4、酸水解酶釋放到溶液中,使大分子生物降解,導(dǎo)致天然物質(zhì)量的減少,加入二異丙基氟磷酸(DFP)可以抑制或減慢自溶作用;加入碘乙酸可以抑制那些活性中心需要有疏基的蛋白水解酶的活性,加入苯甲磺酰氟化物(PMSF)也能清除蛋白水解酶活力,但不是全部,而且應(yīng)該在破碎的同時多加幾次;另外,還可通過選擇pH、溫度或離子強(qiáng)度等,使這些條件都要適合于目的物質(zhì)的提取。這是標(biāo)準(zhǔn)配方:裂解液:50mMTrisHCl(pH8.5~9.0)2mMEDTA100mMN
5、aCl0.5%TritonX1001mgml溶菌酶。(溶菌酶在這個pH范圍內(nèi)比較好發(fā)揮作用)但我個人的經(jīng)驗(yàn)是:如果你裂解細(xì)菌是為了提取蛋白的話而且蛋白的分子量又小于20kd的話盡量減少溶菌酶的用量會引入溶菌酶這種雜蛋白.一般配60ml裂解液用藥匙匙柄盛一點(diǎn)就夠.判斷裂解好壞的標(biāo)準(zhǔn)是溶液很粘.protocol是10ml50ml緩沖液(菌體洗滌液裂解液等)1g濕菌體.如果只做一個鑒定我覺得100200ml菌就夠了.但凡超聲我都用60ml裂解
6、液因?yàn)槲覀兊某晝x(現(xiàn)代分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)錄象里的那種)很適合用100ml小燒杯裝60ml裂解液這樣能讓超聲頭離液面不高不低不會冒泡泡也不會灑出來.菌多我就延長超聲時間.沉淀也就是包涵體沉淀了如果要上柱純化一定要先用4M尿素洗滌一下再用8M尿素溶解.如果不上柱只是跑跑電泳可以直接用8M尿素溶解以后離心取上清加入適量體積的loadingbuffer.loadingbuffer對于包涵體的溶解能力是較弱的.“取200微升菌液,離心后直接加上
7、樣buffer,100度3分鐘后上樣,然后SDSPAGE.這個方法到底能不能溶解細(xì)菌中的包涵體“tmd了。見鬼了。我的操作有什么地方不妥當(dāng),請各位指正。溶菌酶的廠商要求是否很重要?我的誘導(dǎo)物來自1:20過夜培養(yǎng)物接種,37C生長3小時后30C誘導(dǎo)2小時(0.8mMIPTG)。是否菌液太濃,Pharmacia的說明書200ml培養(yǎng)物用10ml重懸,我用20ml,仍然不夠???有人告訴我菌液應(yīng)該稀一些,200ml用30-40ml重懸。但實(shí)際操
8、作也不夠理想SDSPAGE總是觀察到細(xì)胞破碎效果不夠徹底。超聲那么多次,蛋白都要被超碎變性了。3、酵母的破碎酵母是一類單細(xì)胞真菌的總稱,其成員分別屬于不同的真菌綱,細(xì)胞壁成分是否會有較大差別,這些都是做破碎酵母細(xì)胞前要考慮的。我歸納了一下,做破碎酵母的幾種方法:1機(jī)械的方法:一般的PROTOCOL都是用glassbeads:如sigmaG8772,加玻璃珠后超聲,蛋白活性保持較好。2化學(xué)裂解的方法:10g酵母加1ml的乙酸乙酯,充分?jǐn)嚢?/p>
9、至液體狀(希望高手點(diǎn)評)3尿素裂解液(尿素8molLNaCl0.5molLTris20mmolLEDTA20mmolL2%SDSPH值8.0)高壓勻漿。(這個好象也該在方法2中)4液氮凍融并研磨酵母破壁,我認(rèn)為這種可能在小試中比較合適。5溫和的酶法,可能不會會破壞酵母原生質(zhì)體酶法裂解主要用兩種酶:1。蝸牛酶,可以直接從蝸牛的胃液中獲得;2。lyticase,可以從sigma定購。這兩種酶解法都可以和上面的幾種方法結(jié)合使用,尤其是glas
10、sbeads方法,效果很好。我用過化學(xué)裂解的方法,10g酵母加1ml的乙酸乙酯,充分?jǐn)嚢柚烈后w狀。此法的裂解效果不錯的,不妨試一下。一篇文章是加尿素裂解液(尿素8molLNaCl0.5molLTris20mmolLEDTA20mmolL2%SDSPH值8.0),據(jù)說效果可以酵母破碎效果好的我所做過的方法中還是玻璃珠,就象microbe和rongjunli所說的那樣,效率很高的,而且對目的蛋白活性不會有什么影響。一般應(yīng)該用這個方法。4、超
11、聲破碎的條件選擇超聲破碎的條件不能一概而論,要看你的實(shí)驗(yàn)要求,有的是細(xì)菌破碎,有的是對組織細(xì)胞進(jìn)行破碎,要掌握好功率和每次超聲時間,功率大時,每次超聲時間可縮短,不能讓溫度升高,必要時在冰浴條件下進(jìn)行超聲破碎。至于每次超聲時是否起泡沫到不是關(guān)鍵的問題,這與你超聲的量明顯有關(guān)。5、如何鑒定細(xì)菌超聲破碎的程度最簡單的方法:涂片革蘭氏結(jié)晶紫溶液染色0.5分鐘顯微鏡觀察切記:只用結(jié)晶紫染色,別忘了染色后再用水稍沖洗一下6、細(xì)菌裂解的DNaseI
12、不同純度的酶換算標(biāo)準(zhǔn)不同,所以你最好查查是哪個公司的酶?仔細(xì)看說明書,可能會有換算說明。另外看一下參考文獻(xiàn)所用的酶是哪個公司的,到該公司的主頁也可能有收獲。我用過華美和TAKARA的DNA酶,華美的是用mgml。華美也有RNasefree的DNA酶,定量用活性單位。TAKARA的兩種酶都是用活性單位定量的。我在超聲裂解細(xì)菌時加入一些DNA酶,一般用超聲液加不同量的酶做一個預(yù)實(shí)驗(yàn),選取符合你需要的酶量。其實(shí)根據(jù)目的和方法的不同,所需要的酶
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