氫鍵系統(tǒng)中質子傳遞和蛋白質中能量傳遞的計算機模擬.pdf

1、本論文包括氫鍵系統(tǒng)中質子傳遞的計算機模擬和蛋白質中生物能量傳遞的計算機模擬。我們首先以龐小峰教授提出的氫鍵系統(tǒng)質子傳遞新理論為基礎,用四階Runge-Kutta方法和Matlab語言數(shù)值模擬了在受到雜質、恒定外場、溫度和阻尼等因素影響下在這個系統(tǒng)中的質子傳遞。模擬結果表明雜質、恒定外場和阻尼系數(shù)能夠改變質子的傳遞速度,但質子仍能夠穩(wěn)定傳遞。溫度對質子傳遞的影響較大,在190K左右質子傳遞速度達到一個最大值,在210K左右達到一個最小值,

2、這與實驗測出的結果完全符合。因此,我們的模擬結果證明龐小峰教授提出的新理論是完全正確的。然后我們以龐小峰教授在蛋白質分子中提出的改進的生物能量傳遞模型為基礎,利用用四階Runge-Kutta方法和Matlab語言數(shù)值模擬了只含有一個量子的波函數(shù)和耦合系數(shù)χ2=0兩種特殊情況下單通道和三通道蛋白質分子中的能量傳遞隨溫度的變化。在模擬過程中,我們綜合考慮了結構無序性、溫度、雜質及綜合因素下的生物能量傳遞的情況。模擬結果表明,在這兩種特殊情況