基因芯片數(shù)據(jù)歸一化處理的幾點研究.pdf

1、隨著近代分子生物學(xué)實驗技術(shù)和計算機技術(shù)的迅猛發(fā)展,以及人類基因組草圖繪制的順利完成,標志著現(xiàn)代生命科學(xué)研究已經(jīng)進入了后基因組時代?；蛐酒鳛橐环N新型的高通量的檢測技術(shù)方法,可以同時測量成千上萬個基因的表達水平,已成為后基因組時代研究基因與基因間相互作用的一個強有力的工具。而在分析微陣列數(shù)據(jù)的早期階段,遇到的一個基本問題就是數(shù)據(jù)的歸一化。歸一化的目的就是要消除基因芯片實驗過程中系統(tǒng)變異對基因表達水平所帶來的影響,它對基因芯片數(shù)據(jù)的后續(xù)分

2、析起著重要的作用。使用一個恰當(dāng)?shù)臍w一化方法能保證歸一化后的數(shù)據(jù)真實反映了生物學(xué)的意義。 本文是在參照了Lowess歸一化方法以及Huang,J.et al.(2005)提出的TW-SLM歸-化方法的基礎(chǔ)上,鑒于穩(wěn)健性方面的考慮分別對它們作了一些改進,如針對Lowess的局部加權(quán)最小二乘法,我們考慮改用局部加權(quán)最小一乘回歸。而對于TW-SLM歸一化方法的改進,則是考慮運用加權(quán)最小二乘回歸來估計參數(shù)并把已估計出來的誤差方差作為其權(quán)重