朊病毒正常功能與致病機(jī)理的計算化學(xué)研究.pdf

1、該論文首先用量子化學(xué)計算方法對朊病毒(Prion)的正常功能進(jìn)行了研究,確定了PrP<'c>-Cu<'2+>絡(luò)合模式,并通過與Cu,Zn-SOD及其模擬物的抗氧化能力的比較,討論了Prion的正常功能;同時結(jié)合生物信息學(xué)對與銅離子轉(zhuǎn)運相關(guān)的蛋白按銅離子轉(zhuǎn)運順序進(jìn)行分類,通過量化計算確定金屬銅離子與朊病毒結(jié)合在整個銅離子轉(zhuǎn)運過程中的位置.采用分子動力學(xué)模擬方法通過對雞和人的Prion的對比計算研究,探尋PrP<'c>向prp<'sc>轉(zhuǎn)變

2、過程的機(jī)理,理論結(jié)果將對醫(yī)治朊病毒類疾病提供有力的指導(dǎo).Prion是一種新型的蛋白感染因子,能引起人和動物之間的可轉(zhuǎn)移性神經(jīng)退化疾病,研究發(fā)現(xiàn)Prion包括兩種形式:細(xì)胞型(PrP<'c>)和異常型(PrP<'sc>).經(jīng)過近20年的研究,人們在分子水平上認(rèn)識朊病毒已取得了重要進(jìn)展,這包括PrP<'c>的結(jié)構(gòu)等.但這一領(lǐng)域有許多基本問題至今沒有解決,主要存在以下兩方面:Prion致病的根本原因是prp<'c>正常功能的喪失還是prp<'

3、sc>的聚集沉淀具有毒性無法確定;PrP<'c>轉(zhuǎn)化為prp<'sc>的機(jī)理仍然不清楚.該論文選用Gaussian 98程序包中的密度泛函(DFT)方法對prp<'c>-Cu<'2+>的絡(luò)合模式及prp<'c>的正常功能進(jìn)行了計算研究,并對與銅離子轉(zhuǎn)運相關(guān)的蛋白按銅離子轉(zhuǎn)運順序進(jìn)行分類,確定金屬離子與朊病毒結(jié)合在整個銅離子轉(zhuǎn)運過程中的位置.然后在UNIX系統(tǒng)下運用InsightⅡ軟件通過對雞和人的PrP<'c>的對比動力學(xué)模擬計算研究,