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文檔簡介
1、目的:乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)基因的變異在慢性乙型肝炎病毒感染者中較為常見。目前雖然已有很多針對乙肝病毒變異的研究,但HBV逆轉錄酶區(qū)(reverse transcriptase,RT)自然變異的情況仍不清楚。本研究通過對慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)不同時期RT區(qū)自然變異的頻數(shù)、分布及來源的分析,描述HBVRT區(qū)基因自然變異的特點。
方法:共納入28例未經核
2、苷(酸)類似物(nucleot(s)ide analogues, NAs)治療的 C HB患者血清標本,包括免疫耐受期10例(immune-to lerant phase, IT),免疫活動期9例(immune-active phase, IA)以及非活動攜帶期9例(inactive carriers phase, IC)。通過巢式聚合酶鏈反應(nest polymerase chain reaction, Nest-PCR)-克隆法擴
3、增HBV RT區(qū)基因并采用Sanger法測序。運用Contig Express,BLAST, MAFFT,MEGA5.0等軟件及GenBank, Genotyping Tools,HBVSeq, HBVdb等數(shù)據庫分析序列。
結果:從28例C HB患者(男性:53.57%;年齡中位數(shù):28歲;基因B型:75%;基因C型,25%)成功獲得575條HBV RT全長核酸序列(IT:224,IA:196,IC:155)。含RT突變的克
4、隆百分比中位數(shù):IT組為16.07%(范圍:4.17%-52.00%), IA組為44.90%(范圍:16.67%-69.57%),IC組為43.20%(范圍:15.00%-100%)。準種分析顯示IA組和IC組的RT區(qū)變異程度要顯著高于IT組,這種趨勢通過RT蛋白保守性分析也得到進一步證實。在三組中共發(fā)現(xiàn)63個突變位點(IT:19,IA:37,IC:36)。這些變異位點在不同階段不同結構區(qū)(domain區(qū)、inter-domain區(qū))
5、及免疫表位(HLAⅠ表位、HLAⅡ表位以及“a”抗原決定簇)的分布及變異頻數(shù)存在著顯著差異。7.14%(2/28)的人群中檢測到了NAs預存耐藥(rtI169T, A181T,和S202G)。在同一克隆株中,HBsAg區(qū)發(fā)生的變異點數(shù)目總是較RT區(qū)多,且多數(shù)RT區(qū)變異位點與HBsAg區(qū)變異位點相一致。
結論:我們的結果表明:1. C HB自然史各個時期的RT區(qū)自然變異程度及其影響顯著不同;2.HBV RT區(qū)表現(xiàn)出很強的保守傾向
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