BRM基因啟動(dòng)子區(qū)插入-缺失多態(tài)與肝細(xì)胞肝癌易感性的關(guān)聯(lián)研究及功能分析.pdf

1、碩士學(xué)位論文論文題目BRM基因啟動(dòng)子區(qū)插入缺失多態(tài)與肝細(xì)胞肝癌易感性的關(guān)聯(lián)研究及功能分析研究生姓名高學(xué)仁指導(dǎo)教師姓名高玉振副教授專業(yè)名稱細(xì)胞生物學(xué)研究方向腫瘤分子遺傳學(xué)論文提交日期2013年4月BRM基因啟動(dòng)子區(qū)插入缺失多態(tài)與肝細(xì)胞肝癌易感性的關(guān)聯(lián)研究及功能分析中文摘要I中文摘要目的：研究BRM基因啟動(dòng)子區(qū)域的兩個(gè)插入缺失多態(tài)BRM1321（rs3832613）和BRM741（rs34480940）與中國人群肝細(xì)胞肝癌（HCC）易感性的

2、關(guān)聯(lián)，并利用基因型表型關(guān)聯(lián)研究及生物信息學(xué)方法探討多態(tài)參與肝細(xì)胞肝癌發(fā)生的功能及意義。方法：（1）運(yùn)用生物信息學(xué)工具篩選出BRM基因啟動(dòng)子區(qū)域內(nèi)的多態(tài)，并從中選取兩個(gè)具有潛在功能的插入缺失(Indel)多態(tài)位點(diǎn)BRM1321和BRM741作為候選多態(tài)；（2）基于第一步預(yù)測結(jié)果，采用病例對(duì)照研究方法（796HCC病例和806例正常對(duì)照），PCR擴(kuò)增結(jié)合聚丙烯酰胺凝膠電泳技術(shù)對(duì)候選多態(tài)進(jìn)行基因分型，Logistic回歸統(tǒng)計(jì)分析基因多態(tài)位點(diǎn)與

3、HCC的關(guān)聯(lián)性，SHEsis軟件分析BRM1321和BRM741組成的單倍型與HCC的關(guān)聯(lián)性；（3）對(duì)發(fā)現(xiàn)的陽性關(guān)聯(lián)位點(diǎn)，運(yùn)用RealtimeRTPCR和WesternBlotting方法研究肝細(xì)胞肝癌組織、癌旁組織和肝癌細(xì)胞系中BRM1321多態(tài)及其單倍型與BRM表達(dá)量的基因型表型關(guān)聯(lián)；（4）運(yùn)用生物信息學(xué)的方法預(yù)測多態(tài)位點(diǎn)BRM1321可能結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子。結(jié)果：（1）基因分型結(jié)果顯示，位于BRM基因啟動(dòng)子區(qū)域內(nèi)的位點(diǎn)BRM1321和

4、BRM741具有較好的多態(tài)性。BRM1321位點(diǎn)6bp插入缺失(InsDel)的基因型頻率在病例組中分別為0.418（DelDel），0.451（InsDel），0.131（InsIns）；在正常組中分別為0.540（DelDel），0.395（InsDel），0.066（InsIns）。BRM741位點(diǎn)7bp插入缺失（InsDel）的基因型頻率在病例組中分別為0.198（DelDel），0.467（InsDel），0.334（InsI

5、ns）；在正常組中分別為0.228（DelDel），0.479（InsDel），0.293（InsIns）。BRM1321位點(diǎn)和BRM741位點(diǎn)在對(duì)照組中的基因型頻率分布均符合HardyWeinberg平衡（P0.05）；（2）調(diào)整性別、年齡、吸煙、飲酒、HBV感染等主要風(fēng)險(xiǎn)因素后，運(yùn)用Logistic回歸分析的方法對(duì)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析，統(tǒng)計(jì)結(jié)果顯示：與BRM1321位點(diǎn)DelDel基因型相比，InsDel基因型和InsIns基因型個(gè)