死亡受體4基因啟動(dòng)子區(qū)功能性遺傳變異與肺癌易感性相關(guān).pdf

1、背景和目的:腫瘤壞死因子相關(guān)凋亡誘導(dǎo)配體(TNF-related apoptosis-inducing ligand，TRAIL)特異性引發(fā)腫瘤細(xì)胞凋亡的特性受到了研究人員的廣泛關(guān)注。本研究探討TRAIL及其受體基因單核苷酸多態(tài)(single nucleotide polymorphism，SNP)對(duì)漢族人群肺癌發(fā)生發(fā)展的影響以及與之有關(guān)聯(lián)的SNP的生物學(xué)功能。 方法:我們根據(jù)NCBI和HapMap SNP數(shù)據(jù)庫(kù)信息，選擇有潛在

2、功能改變的13個(gè)SNP進(jìn)行研究。關(guān)聯(lián)分析采用兩階段病例-對(duì)照研究方法，先期研究在小樣本量的肺癌病例(n=323)和對(duì)照(n=331)中進(jìn)行，然后在大樣本量的病例(n=1304)和對(duì)照(n=1491)中驗(yàn)證先期研究中發(fā)現(xiàn)有關(guān)聯(lián)的SNP。以多變量logistic回歸計(jì)算的比值比(OR)及其95％可信區(qū)限(CI)評(píng)估SNP與肺癌風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)。以雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)和凝膠遷移率變動(dòng)實(shí)驗(yàn)檢測(cè)基因啟動(dòng)子區(qū)SNP對(duì)基因轉(zhuǎn)錄功能的影響。統(tǒng)計(jì)學(xué)檢驗(yàn)均為雙

3、側(cè)檢驗(yàn)，P<0.05為差異有顯著性。 結(jié)果:小樣本前期病例-對(duì)照分析表明，在所研究的13個(gè)SNP中，只有DR4基因啟動(dòng)子區(qū)的-972A→G和-397C→A多態(tài)與肺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)。在大樣本量驗(yàn)證中，我們發(fā)現(xiàn)-397 SNP 3種基因型頻率分布在肺癌病人組和對(duì)照組有顯著差異，病人中-397AA基因型頻率顯著高于對(duì)照(16.1％比8.9％，P<0.001)。與攜帶-397CC基因型者比較，攜帶-397AA基因型者患肺癌的風(fēng)險(xiǎn)增加到1.

4、94倍(95％CI=1.51-2.51,P<0.001)；然而攜帶-397CA基因型者的肺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)并不增加(OR=1.06，95％CI=0.90-1.25，P=0.495)。分層分析表明，吸煙和-397AA基因型之間存在高于相乘的交互作用。雖然大樣本量驗(yàn)證未發(fā)現(xiàn)-972 SNP與肺癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)，但單體型分析顯示該兩個(gè)SNP在單體型范疇有協(xié)同作用。測(cè)序發(fā)現(xiàn)DR4啟動(dòng)子區(qū)存在5個(gè)變異等位基因頻率>5％的SNP，即-1501G→A、-12

5、62G→T、-972A→G、-441T→A和-397C→A，其中-1501G→A在NCBI SNP庫(kù)中未有記載，-1262G→T和-972A→G、-441T→A和-397C→A處于完全連鎖不平衡。功能實(shí)驗(yàn)表明，含-397A的單體型驅(qū)動(dòng)的基因轉(zhuǎn)錄活性顯著低于含-397C的單體型；-397A等位基因與核蛋白結(jié)合的親和力低于-397C等位基因，但結(jié)合的是何種核蛋白還有待闡明。 結(jié)論: DR4基因啟動(dòng)子區(qū)存在-397C→A功能性多態(tài)，可