禽呼腸孤病毒S2、S4基因的克隆與序列分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、分類號S852.4學校代碼10129UDC619學號072010098禽呼腸孤病毒S2、S4基因的克隆與序列分析CloningSequenceAnalysisoftheS2S4GeneofAvianReovirus申請人：何建文學科門類：農(nóng)學學科專業(yè)：預防獸醫(yī)學研究方向：動物傳染病學指導教師：關(guān)平原教授論文提交日期：二〇一二年十二月CloningSequenceAnalysisoftheS2、S4GeneOfAvianReovirusA

2、bstractAccdingtotheS2S4genesequenceofAvianreovirusstrain176(ARV176)publishedinGenBanktwopairsofprimersweresynthesized.ThetotalRNAofARVisolateT98C98isolatedinTianjininnerMongoliawereextracted.TheS2S4geneofviruswasamplific

3、atedbyRTPCRthenclonedintopESAYT1plasthensequenced.TheresultshowedthattheS2genewas1324bpcontainedoneF(161266bp)whichcodes416aminoacidswith1251bptwononcodingregions.theS4genewas1192bpcontainedoneF(241127bp)whichcodes367ami

4、noacidswith1104bptwononcodingregions.ThenucleotidesequencesofS2S4genesreptedinthisstudyhavebeensubmittedtotheGenBanktheaccessionnumbersofS2S4genesinclude:C98S2(JN641886)C98S4(JN641885)T98S2(JN641887)T98S4(JN641884).These

5、quenceswerecomparedwithreferencestrainsgenesequencesbycomputersoftware.ThehomologyofS2genewasabout99.2%to99.8%comparedwithreferencestrainsARV176、ARV918、ARV919、ARV1733、ARVGX2010、ARVS1133、DRVYJLthededucedaminoacidssequence

6、srangedfrom98.1%to99.8%ComparedwithreferencestrainsMRV3、MRV3jin1、MRV3T3DthehomologiesofthenucleotidesequenceofS2generangedfrom2.4%to5.5%thededucedaminoacidssequencesrangedfrom29.1%to29.3%.ThehomologyofS4genewasabout99.0%

7、to99.8%comparedwithreferencestrainsARV176、ARV601SI、ARV919、ARV1733、ARVGX2010、ARVS1133、DRVYJLthededucedaminoacidssequencesrangedfrom98.9%to100.0%ComparedwithreferencestrainsMRV3、MRV3jin1、MRV3T3Dthelowhomologiesofthenucleot

8、idesequenceofS4genewas2.4%thededucedaminoacidssequencesrangedfrom3.6%to9.0%.ResultsofphylogeictressindicatedthatS2geneshavedivergedintothreedistinctlineagesS4geneshavedivergedintofourdistinctlineagesthattherewasnocrelati

9、onbetweenlineagesviralserotypespathotypesiginsbutARVC98、ARVT98、ARV176、ARVS1133、ARV1733、ARV919、ARVGX2010、DRVYJLcontainedtheS2S4geneswhichwereconsistentlylocatedinthesamerespectivelineagestheremainingvirusstrainsdemonstrat

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