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文檔簡介
1、目的:
心房顫動(Atrial Fibrillation,AF)簡稱房顫,是臨床上最常見的心律失常之一。近年來,研究者已發(fā)現(xiàn)多個單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs)與房顫的發(fā)生相關(guān)。本研究目的是通過全基因組關(guān)聯(lián)研究(Genome-wideAssociation Study,GWAS)驗(yàn)證及候選基因選點(diǎn)的方法探索某些SNPs與中國漢族人群房顫發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)之間的關(guān)系。
方
2、法:
研究采用病例-對照研究方法,納入中國漢族人群房顫患者1150例(病例組),以年齡、性別為匹配因素進(jìn)行1:1的對照匹配。第一部分采用改進(jìn)的多重高溫連接酶檢測反應(yīng)(iLMDR)基因分型技術(shù)對所有選定的SNPs基因分型。第二部分采用TaqMan分型技術(shù)對rs2200733分型驗(yàn)證。采用logistic回歸模型,計(jì)算各SNPs與房顫的關(guān)聯(lián)性O(shè)R值、95%置信區(qū)間及關(guān)聯(lián)性P值;分層分析采用于x2分布的Q檢驗(yàn)進(jìn)行異質(zhì)性檢驗(yàn)。
3、 結(jié)果:
在中國漢族人群中共收集樣本2300例,包括1150例房顫患者(病例組)及1150例非房顫患者(對照組)。兩組研究對象在匹配變量年齡、性別間差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(男女比例均為65.8%,P=1;平均年齡分別為58.66±11.50歲vs.59.06±10.48歲,P=0.379)。房顫組中罹患高血壓病、2型糖尿病、冠心病等房顫的常見危險(xiǎn)因素的患者比例明顯高于對照組(P<0.05)。最終,包括GWAS驗(yàn)證8個SNPs和候選
4、基因PITX2的5個SNPs共計(jì)13個SNPs位點(diǎn)用于基因分型。GWAS驗(yàn)證的8個SNPs分析結(jié)果顯示:相加遺傳模型下,調(diào)整年齡、性別、高血壓病、2型糖尿病及冠心病等相關(guān)變量后4個SNPs(rs6584555、rs10507248、rs13216675及rs11047543)與房顫發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)之間存在相關(guān)性(P<0.05)。其余4個SNPs與房顫發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)無關(guān)聯(lián)性(P>0.05)。經(jīng)多重假設(shè)檢驗(yàn)分析后,NEURL rs6584555與房顫發(fā)病
5、風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)性仍存在顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(OR值為1.51,95%CI:1.27-1.78,PFDR=1.56×10-5)。然而rs10507248、rs13216675及rs11047543與房顫的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)失去相關(guān)性。PITX2基因上的5個SNPs結(jié)果提示:在相加遺傳模型下,調(diào)整年齡、性別、高血壓病、2型糖尿病及冠心病等相關(guān)變量后rs1982361及rs2200733與房顫發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)之間存在顯著相關(guān)性(rs1982361,OR值為0.75,95
6、%CI0.66-0.85,P=1.1×10-6; rs2200733,OR值為2.10,95%CI1.85-2.40,P=2.53×10-29)。其余3個SNPs與房顫發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)關(guān)聯(lián)性P>0.05,不具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。進(jìn)一步多重假設(shè)檢驗(yàn),rs1982361及rs2200733與房顫的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)之間關(guān)聯(lián)性P值(PFDR)分別為2.75×10-6及1.26×10-28,仍有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。采用TaqMan基因分型技術(shù)對位點(diǎn)rs2200733進(jìn)行驗(yàn)證,
7、基因分型成功率為99.7%。同樣發(fā)現(xiàn)rs2200733與房顫發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)存在顯著關(guān)聯(lián)(OR值為2.10,95%CI:1.84-2.40,P=6.59×10-29)。本研究進(jìn)一步對rs6584555、rs1982361及rs2200733在年齡、性別、高血壓病和2型糖尿病情況分層與房顫的易感性進(jìn)行了關(guān)聯(lián)性分析,并進(jìn)行異質(zhì)性檢驗(yàn)。3個陽性SNPs與房顫發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)關(guān)聯(lián)強(qiáng)度在各層間無顯著差異(異質(zhì)性P>0.05)。然而,因?qū)φ战M中沒有冠心病患者,未進(jìn)
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