條斑紫菜基因組FOSMID文庫構(gòu)建及MAPK基因克隆與表達(dá)分析.pdf

1、中國海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文條斑紫菜基因組FOSMID文庫構(gòu)建及MAPK基因克隆與表達(dá)分析姓名：崔菁菁申請學(xué)位級別：碩士專業(yè)：遺傳學(xué)指導(dǎo)教師：茅云翔200806011 5 1 5 b p 的O R F 和2 4 5 b p 的內(nèi)含子序列。O R F 的G C 堿基含量為6 4 ．2 9 ％，內(nèi)含子的G C 堿基含量為5 6 ．6 9 ％，比外顯子的G C 堿基含量低7 ．6 ％。密碼子分析發(fā)現(xiàn)，P y M A P K 2 基因密碼子第三位偏

2、向于堿基C 。通過對P y M A P K 2 蛋白的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測分析有1 9 個a 螺旋、1 0 個p 折疊。對P y M A P K l 和P y M A P r d 蛋白分析發(fā)現(xiàn)了M A P K 基因的1 1 個保守結(jié)構(gòu)域。通過功能位點(diǎn)預(yù)測發(fā)現(xiàn)它們含有胱氨酸結(jié)信號域、與激活細(xì)胞增殖及D N A 合成信號傳導(dǎo)相關(guān)的E G F 結(jié)構(gòu)、蛋白激酶A T P 結(jié)合特征序列等。其中，P y M A P Y d 蛋白屬于D 組M A P K ，

3、為植物所特有，不僅含有D 組M A P K 特征區(qū)域K D 區(qū)，而且含有D 組M A P K 通常不具有的C D區(qū)。蛋白系統(tǒng)發(fā)生樹分析發(fā)現(xiàn)，D 組M A P K 在進(jìn)化上相對于其它植物M A P K 是單獨(dú)進(jìn)化的。而P y M A P K l 蛋白含特征基序r r I Y ，則為一種新類型的M A P K 蛋白。蛋白系統(tǒng)發(fā)生樹分析發(fā)現(xiàn)，P y M A P K l 不同于其他類型M A P K ，在進(jìn)化上單成一支。。本研究還對機(jī)械創(chuàng)傷和活

4、性氧脅迫下的條斑紫菜的P y M A P K l 及P y M A P K 2表達(dá)進(jìn)行檢測，檢測結(jié)果發(fā)現(xiàn)，P y M A P K l 和P y M A P K 2 基因在機(jī)械創(chuàng)傷脅迫下都有明顯的增加，但開始增加的時間和增加量不同。P y M A P K l 轉(zhuǎn)錄量增加比P y M A P K 2 慢且少。在活性氧脅迫下，P y M A P K l 轉(zhuǎn)錄量有明顯增加，開始增加的時間比機(jī)械創(chuàng)傷脅迫下早。因此，I P y M A P K l