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文檔簡介
1、由 A、T、C、G四種堿基以及表觀修飾堿基5-甲基胞嘧啶等組成的DNA是生命體的遺傳物質(zhì),以往一般認為由 C、H、O、N、P五種元素組成。本研究室在天然 DNA中發(fā)現(xiàn)了第六種元素S,它以由 dnd基因簇編碼的磷硫?;揎椀男问酱嬖?。
DNA的修飾和限制是一對孿生兄弟,在細菌和噬菌體的軍備競賽中,細菌發(fā)展出 DNA甲基化、羥甲基化等修飾依賴型的限制系統(tǒng)即 IV型限制酶,可以對修飾的DNA進行切割以保護細菌自身遺傳穩(wěn)定性。
2、 本研究從 dnd基因簇在天藍色鏈霉菌中的異常表達現(xiàn)象出發(fā),通過實驗發(fā)現(xiàn)其中含有一種磷硫酰化修飾依賴型的IV型限制酶,并且定位了其編碼基因為 scoMcrA,實驗證實了它位于一個可移動的基因組島上。
在體外表達 ScoMcrA的過程中,我們發(fā)現(xiàn)帶有 scoMcrA的表達載體不能導入帶有 Dcm基因型(DNA胞嘧啶甲基化,位點為C5mCA/TGG)的大腸桿菌,說明 ScoMcrA也是一種 Dcm甲基化依賴型限制酶。純化的Sco
3、McrA在錳離子的存在下可以特異性的識別磷硫?;揎椀腄NA并在離修飾位點兩側(cè)17~25個堿基的位置切割磷酸二酯鍵;同時,還可以特異性的識別 Dcm甲基化修飾的DNA并在修飾位點兩側(cè)12~16個堿基的位置進行切割。此外,我們還通過 Footprinting實驗確定了 ScoMcrA對甲基化修飾 DNA的結(jié)合位點。
結(jié)構(gòu)生物學的研究解析了 ScoMcrA單體及其與磷硫?;揎桪NA復合物的結(jié)構(gòu),揭示了 ScoMcrA通過將磷硫酰
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