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1、細(xì)胞膜是原核生物細(xì)胞的重要組成結(jié)構(gòu),其功能主要涉及能量轉(zhuǎn)換、物質(zhì)運(yùn)輸以及信息識(shí)別與傳遞等。了解細(xì)胞膜的功能與機(jī)制,特別是物質(zhì)的跨膜運(yùn)輸,具有重要的實(shí)踐意義。
我們分別采用BNE、hrCNE等一維電泳、以及native/native、native/SDS-PAGE等二維電泳方法對(duì)天藍(lán)色鏈霉菌的膜蛋白質(zhì)組進(jìn)行了分析研究。核酸干擾是影響 native電泳的主要因素,為了除去膜組分中核酸成分,在加入DDM抽提膜蛋白之后,我們采用了多種
2、方法去除核酸,結(jié)果表明,超速離心是一種有效地去除核酸方法,native電泳性能有了明顯提高。我們對(duì)BNE、hrCNE-DDM和hrCNE-Triton等三種電泳的最佳上樣量進(jìn)行了比較研究;結(jié)果表明,三種電泳的最適上樣量均為80-100μg。
通過(guò)二級(jí)質(zhì)譜分析,我們鑒定了77個(gè)蛋白質(zhì);其中,61個(gè)蛋白質(zhì)來(lái)自hrCNE-Triton/SDS-PAGE二維凝膠,48個(gè)蛋白質(zhì)來(lái)自hrCNE-DDM/SDS-PAGE二維凝膠,其余來(lái)自h
3、rCNE/hrCNE二維凝膠。根據(jù)這些蛋白質(zhì)的生理功能以及聚合狀態(tài),我們對(duì)這些蛋白質(zhì)進(jìn)行了分類,其中,20個(gè)蛋白質(zhì)分別歸屬于15個(gè)蛋白復(fù)合物,包括完整的ATP合酶,細(xì)胞色素aa3氧化酶核心酶,Tri1六聚體,GlnA同聚體以及BFR同聚體等。另外,我們鑒定了多個(gè)與跨膜運(yùn)輸相關(guān)的蛋白,包括BldKB(SCO5113)、OBP(SCO5477)以及ABP(SCO2008)等;BldKB和OBP與寡肽的運(yùn)輸有關(guān),而ABP與氨基酸的運(yùn)輸有關(guān)。O
4、BP和BldKB是膜組分中含量最豐富的兩個(gè)蛋白質(zhì),它們是OppA家族的成員,而OppA家族在胞外多肽降解、信號(hào)傳導(dǎo)等方面具有重要作用。BldKB可能存在三種聚合狀態(tài),分別是單體,二聚體以及四聚體;OBP也可能存在三種聚合狀態(tài),分別是單體,二聚體以及四聚體;這種多聚體狀態(tài)很可能是它們轉(zhuǎn)運(yùn)胞外復(fù)雜多肽的一種適應(yīng)方式。
天藍(lán)色鏈霉菌編碼223個(gè)脂蛋白,其中40%脂蛋白是溶質(zhì)結(jié)合蛋白,它們與碳水化合物、氨基酸、多肽、核苷以及鐵離子運(yùn)輸
5、等密切相關(guān),我們發(fā)現(xiàn)并鑒定17個(gè)溶質(zhì)結(jié)合蛋白。脂蛋白SCO4884和SCO4885具有PBP1_BmpA_PnrA_like保守區(qū)域,可能與核苷運(yùn)輸有關(guān)。我們首先在大腸桿菌BL21中過(guò)量表達(dá)了脂蛋白SCO4884和SCO4885;根據(jù)hrCNE電泳、分子篩以及粒度測(cè)定結(jié)果,我們確認(rèn)SCO4884和SCO4885在溶液中均以單體存在。利用等溫滴定量熱法,我們發(fā)現(xiàn) SCO4884、SCO4885與腺苷、脫氧腺苷、胞苷、脫氧胞苷以及尿苷等具有
6、親和特性,而與鳥苷、脫氧鳥苷以及胸苷等不具有親和特性。
放線紫紅素是一種II型聚酮化合物,其碳鏈合成由聚酮合酶核心酶(PKS)催化。已有研究表明,參與 II型聚酮化合物合成的各個(gè)酶之間存在相互作用,而且這些酶類可能分布在細(xì)胞的不同部位,比如,SCO5074存在于細(xì)胞壁,SCO5076、SCO5083以及SCO5084存在于細(xì)胞膜,而核心酶SCO5087和SCO5088可能也存在于細(xì)胞膜,組成ActKSαβ膜復(fù)合物。利用載體pS
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