基于質(zhì)譜技術(shù)對免疫球蛋白N-糖基化定量分析方法建立與應(yīng)用.pdf

1、繼核酸和蛋白質(zhì)組學(xué)研究之后，人類又發(fā)現(xiàn)了承載著生物信息的大分子——聚糖，它被稱作是“DNA-mRNA-蛋白質(zhì)”遺傳信息流的延續(xù)。在生命體內(nèi)，蛋白質(zhì)糖基化作為翻譯后修飾的一部分，在生命過程中發(fā)揮了非常重要的作用，因此對聚糖的研究吸引了人們的目光。但是由于糖鏈結(jié)構(gòu)非常復(fù)雜而且它不是由基因直接翻譯表達(dá)的產(chǎn)物，因此對糖生物功能的系統(tǒng)分析困難重重，為了解決這一難題，科學(xué)家們提出糖組學(xué)這一全新研究理論。
　　在糖組學(xué)研究中，人們試圖通過對機(jī)體

2、內(nèi)糖鏈、糖蛋白等進(jìn)行研究以闡明基因功能及細(xì)胞功能。研究表明，蛋白糖基化現(xiàn)象與腫瘤的形成與發(fā)展有一定相關(guān)性，因此分析蛋白糖基化修飾對于研究腫瘤的機(jī)制及臨床診斷治療意義重大，這極大地推動(dòng)了腫瘤早期診斷技術(shù)的進(jìn)步。
　　本課題在加州大學(xué)戴維斯分校Lebrilla B.Carlito課題組完成，采用該課題組創(chuàng)建的糖蛋白定量測定方法，即采用超高效液相色譜聯(lián)合三重四級桿質(zhì)譜(UPLC-QqQ-MS/MS)對生物血清中免疫球蛋白IgG、IgA和

3、IgM上的糖蛋白進(jìn)行定量測定。該方法與之前常用的糖鏈定量方法相比，具有以下優(yōu)點(diǎn):(1)減少了分析樣品的取樣量。由于糖鏈在整個(gè)蛋白中所占比例極低，而且糖鏈在質(zhì)譜中的響應(yīng)較差，極易受到其他物質(zhì)的干擾，因此傳統(tǒng)方法中對糖鏈進(jìn)行分析時(shí)，需要加大樣品取樣量。而在本方法中我們是對N-糖肽進(jìn)行分析，即對糖鏈及其連接的肽段進(jìn)行同時(shí)測定，從而大大增加了待測物在整個(gè)樣品中所占比例，而且N-糖肽在質(zhì)譜中響應(yīng)較好。在該方法中，樣品取樣量由傳統(tǒng)的50μL減少到2

4、μL，大大縮減了取樣量，降低了基質(zhì)等對樣品測定時(shí)信號響應(yīng)的干擾，更重要的是減少了取樣對機(jī)體造成的損傷;(2)前處理方法節(jié)約成本，操作簡便，重現(xiàn)性好。由于該方法是對糖蛋白進(jìn)行定量，因此不需要PNGaseF等糖苷酶進(jìn)行糖鏈釋放等前處理，從而縮減了研究成本，省略了糖鏈提取所需要的固相萃取、上清液揮干等復(fù)雜且費(fèi)時(shí)的操作步驟，在簡化操作的同時(shí)，克服了由于PNGase F酶切不完全導(dǎo)致糖鏈定量重現(xiàn)性低等缺點(diǎn);(3)同時(shí)得到糖基化位點(diǎn)與糖蛋白信息。由

5、于傳統(tǒng)的糖鏈分析是將糖鏈從糖蛋白上釋放出來，丟失了糖鏈所連接的糖蛋白與糖基化位點(diǎn)信息，僅僅對同類的糖鏈進(jìn)行定量。新定量方法提供了對蛋白的絕對定量及帶有蛋白位點(diǎn)信息糖基化譜，這為判斷糖譜的變化是由蛋白糖基化引起還是由蛋白濃度變化引起提供了重要的依據(jù)，增加分析結(jié)果的可信度。對同一肽段連接的相同糖鏈以及不同肽段連接的相同糖鏈進(jìn)行比較，通過細(xì)化的分類，使可能存在的具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異的糖蛋白更容易被發(fā)現(xiàn)。經(jīng)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證，該方法操作簡便、結(jié)果穩(wěn)定可靠、重現(xiàn)

6、性好，為尋找疾病中糖蛋白相關(guān)的生物分子標(biāo)志物提供了重要的方法支持。
　　在本課題研究中，我們采用以上建立的N-糖肽定量新方法，對胃癌N-糖肽生物分子標(biāo)志物進(jìn)行研究。在本研究中，我們選用兩組生物樣品（兩組生物樣品均含有胃炎患者血清與胃癌患者血清），首先對兩組生物樣品同時(shí)進(jìn)行分析測定，通過對第一組數(shù)據(jù)進(jìn)行t-檢驗(yàn)分析，得到胃炎患者血清與胃癌患者血清中IgG、IgA和IgM上具有顯著性差異的蛋白與N-糖肽，作為潛在的胃癌生物標(biāo)志物;然后

7、將以上發(fā)現(xiàn)的潛在生物標(biāo)志物應(yīng)用于第二組樣品分析中，采用R Language進(jìn)行最小二乘法(PartialLeast Squares，PLS)分析，觀察潛在的生物標(biāo)志物能否將胃炎與胃癌兩組病人分開。分析結(jié)果表明，通過對約60種不同的糖蛋白進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析，找到7個(gè)具有顯著性差異的糖蛋白，通過應(yīng)用這7種糖蛋白對測試組進(jìn)行PLS分析，結(jié)果表明，胃炎患者與胃癌患者之間已出現(xiàn)一定的分離趨勢。
　　在本研究中，我們不僅僅對胃癌血清免疫球蛋白N-糖

8、肽分子生物標(biāo)志物進(jìn)行分析，同時(shí)對目前治療癌癥具有廣闊發(fā)展前景的的生物藥物重組單克隆抗體（recombinant monoclonal antibody，rMAb）進(jìn)行了N-糖基化研究。重組單克隆抗體藥物作為一種有效治療癌癥和慢性疾病的生物藥物一經(jīng)上市就受到高度重視。該類藥物具有分子靶向性，其抗癌機(jī)理如下:(1)能夠激活人體自身免疫系統(tǒng)殺死腫瘤細(xì)胞;(2)阻斷腫瘤細(xì)胞的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)，改變細(xì)胞基因表達(dá)，從而抑制或殺死腫瘤細(xì)胞;(3)能夠攜帶放射

9、性抗腫瘤藥物靶向性地抵達(dá)腫瘤細(xì)胞，從而殺死腫瘤細(xì)胞。目前，已有30多種重組單克隆抗體經(jīng)FDA批準(zhǔn)進(jìn)入市場，同時(shí)有上百種候選藥物正在進(jìn)行臨床實(shí)驗(yàn)。由此可見，該類藥物在抗腫瘤等慢性疾病治療上表現(xiàn)出色，具有很大發(fā)展空間，這也吸引了眾多藥企對rMAbs藥物的開發(fā)與生產(chǎn)。到目前為止，所有經(jīng)批準(zhǔn)的rMAbs藥物都屬于免疫球蛋白IgG，但是IgG的四個(gè)亞型IgG1、IgG2、IgG3和IgG4都具有不同的藥效，因此根據(jù)疾病來選擇IgG亞型給藥對于該類

10、藥物的使用至關(guān)重要。同時(shí)，有研究表明，該類藥物的N-糖基化直接影響到藥物特性，甚至影響到該類藥物與細(xì)胞結(jié)合、激活等作用，而且rMAbs作為生物藥物，其批間與批內(nèi)穩(wěn)定性非常關(guān)鍵。因此對IgG亞型的快速鑒定以及對藥物中N-糖鏈的種類與N-糖基化位點(diǎn)定量測定是rMAbs藥物在研發(fā)與生產(chǎn)過程的關(guān)鍵步驟。在這類藥物快速發(fā)展的背景下，建立對其進(jìn)行N-糖基化譜與N-糖基化位點(diǎn)相關(guān)的定量分析高通量方法成為亟待解決的問題。
　　在本課題研究中，我們

11、采用UPLC-QqQ-MS/MS建立了對rMAbs藥物中N-糖肽進(jìn)行定量的高通量分析方法。在該方法中，省略了蛋白的富集與N-糖鏈釋放等步驟，對N-糖肽直接分析，建立了rMAbs藥物的N-糖肽譜，并且通過MRM質(zhì)譜分析方法對藥物中的N-糖肽進(jìn)行快速測定。方法驗(yàn)證結(jié)果表明，該方法操作簡便、快速、可靠、重現(xiàn)性好。在該方法基礎(chǔ)上，我們對六種已上市的rMAbs藥物的N-糖肽進(jìn)行定量分析，結(jié)果表明，雖然構(gòu)成藥物的IgG亞型不同，但是各亞型中包含的主

12、要糖鏈及其含量基本一致。
　　進(jìn)一步地，我們建立了rMAbs藥物N-糖基化位點(diǎn)定量分析方法。當(dāng)使用PNGaseF酶切N-糖鏈后，與該糖鏈相連的肽段中的Asn(114.043Da)殘基轉(zhuǎn)變?yōu)锳sp殘基(115.027Da)，分子量增加0.984Da，從而可以通過測定這種分子量上的變化對肽段進(jìn)行定量分析。本研究根據(jù)這一特性，對rMAbs藥物中的糖鏈采用PNGase F進(jìn)行酶解，對殘留的肽段進(jìn)行MRM質(zhì)譜分析，通過對肽段標(biāo)準(zhǔn)品進(jìn)行線性回

13、歸，得到藥物中N-糖基化與未糖基化的肽段的絕對質(zhì)量。在本課題中，我們對六種rMAbs中N-糖基化位點(diǎn)進(jìn)行定量測定，實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明，不論藥物屬于何種IgG亞型，N-糖基化的糖蛋白在97％以上，說明rMAbs藥物中絕大多數(shù)N-糖基化位點(diǎn)都被N-糖鏈所占據(jù)。
　　本課題建立了快速、高效、準(zhǔn)確、可靠的N-糖肽定量分析MRM方法，主要對胃癌與目前有效的抗癌藥物重組單克隆抗體的N-糖肽進(jìn)行定量分析，為后續(xù)的疾病N-糖肽分子標(biāo)志物的探索以及重組單