酵母基因組coiled-coil結(jié)構(gòu)域的系統(tǒng)研究.pdf

1、生物體中，蛋白質(zhì)通過它們之間或與核酸之間的相互作用來控制細胞多種生命活動。研究表明，大多數(shù)蛋白質(zhì)，特別是調(diào)節(jié)蛋白，通常由兩個或更多結(jié)構(gòu)域組成，通過結(jié)構(gòu)域所介導(dǎo)的多肽之間或者多肽與磷脂，小分子和核酸的結(jié)合來調(diào)節(jié)細胞行為。Coiled coil是蛋白質(zhì)中一個介導(dǎo)蛋白質(zhì)相互作用的結(jié)構(gòu)域，我們以coiled coil為模型，研究酵母基因組coiled coil結(jié)構(gòu)域的相互作用網(wǎng)絡(luò)。 通過預(yù)測，得到了酵母基因組810個蛋白質(zhì)基因中的899

2、個可能形成coiled coil的序列，克隆得到了其中的890多個。用酵母雙雜交的方法對這些coiled coil進行一對一大規(guī)模的相互作用篩選，得到一個酵母全基因組水平coiled coil間的相互作用網(wǎng)絡(luò)。網(wǎng)絡(luò)中大多數(shù)結(jié)構(gòu)域間緊密連接，網(wǎng)絡(luò)中少數(shù)高連接度的coiled coil作為中心將網(wǎng)絡(luò)連接組織起來。 用生物信息學方法分析coiled coil蛋白的分子功能特征發(fā)現(xiàn)：在分子功能上coiled coil更傾向于分布在與DN