中國五個地區(qū)獻血人群HCV基因型-亞型分布及進化分析.pdf

1、目的：研究國內五個地區(qū)血液中心獻血人群中HCV基因型/亞型分布及不同基因型HCV的群體遺傳學特征。
　　方法：收集來自重慶、烏魯木齊、洛陽、綿陽和廣西無償獻血人群的抗-HCV確證實驗陽性的血漿標本802（人）份，并統(tǒng)計出獻血人群的性別、年齡、民族和職業(yè)等人口統(tǒng)計學信息;采用逆轉錄巢式PCR對HCV core基因片段擴增并測序;應用MEGA6.0軟件構建HCV分子進化樹并對其做基因分型和系統(tǒng)發(fā)育分析，用Arlequin、DNAsp和

2、BEAST軟件進行群體遺傳學分析，探討該地區(qū)不同基因型HCV的擴張情況。采用SPSS Statistics17.0軟件來分析HCV基因亞型的分布和人口統(tǒng)計學特征的相關性。
　　結果：重慶(116)、烏魯木齊(104)、綿陽(74)、洛陽(67)和廣西(58)五個地區(qū)血漿標本中獲得陽性擴增的共為419例。共檢測出HCV-1a、1b、2a、3a、3b、6a、6e和6n等8個基因亞型，未發(fā)現(xiàn)4，5型的存在，且各亞型所占比例分別為0.72

3、％(3/419)、59.90％(251/419)、16.95％(71/419)、4.53％(19/419)、3.82％(16/419)、12.41％(52/419)、0.95％(4/419)和0.72％(3/419)。綿陽、烏魯木齊和洛陽地區(qū)獻血人群中比例較高的基因型為1b和2a，而重慶和廣西地區(qū)為1b和6a。HCV1b和6a的Tajima's D值和Fu's Fs值均為負且P值均小于0.05，提示相應的HCV群體正在經(jīng)歷擴張。HCV基

4、因亞型的分布和年齡、民族之間有明顯的統(tǒng)計學意義(P＜0.05)，而與性別、職業(yè)、教育水平、婚姻狀態(tài)無統(tǒng)計學意義。
　　結論：我國獻血人群HCV基因亞型豐度較高，主要以1b為主，其次為2a，也有6a，3a，3b，6e，6n及1a的散在分布。綿陽、烏魯木齊和洛陽地區(qū)獻血人群的優(yōu)勢基因型為1b和2a，而重慶和廣西地區(qū)為1b和6a。HCV6a亞型有顯著擴張的趨勢，1b、3a和3b都有不同程度擴張。HCV基因亞型的分布和年齡、民族存在統(tǒng)計學