6個(gè)染色體區(qū)域的基因多態(tài)性與冠心病易感性的關(guān)聯(lián)性研究.pdf_第1頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

1、背景:
  冠心?。–oronary artery disease,CAD)是一種由冠狀動(dòng)脈器質(zhì)性狹窄或阻塞引起的心肌缺血缺氧或心肌壞死的心臟病,又稱缺血性心臟病。作為一種嚴(yán)重危害全球健康的常見慢性疾病,CAD的致病率和致死率極高。在中國(guó),CAD是造成人們死亡的首要原因。CAD的發(fā)病機(jī)制現(xiàn)在還不完全清楚。目前可以確定的是CAD是一種復(fù)雜的多基因遺傳病,其發(fā)病原因包括環(huán)境因素、遺傳因素以及二者之間的相互作用。近年來,世界范圍內(nèi)對(duì)心血

2、管疾病尤其是CAD等復(fù)雜性疾病的全基因組關(guān)聯(lián)研究(Genome-wide association study,GWAS)迅速發(fā)展,發(fā)現(xiàn)了CAD的一系列相關(guān)基因或位點(diǎn),將人類基因組研究推向了一個(gè)新的階段。本文根據(jù)近年來國(guó)內(nèi)外與CAD相關(guān)的GWAS研究結(jié)果,選擇了位于1號(hào)、6號(hào)、10號(hào)、12號(hào)、17號(hào)和19號(hào)共6個(gè)染色體區(qū)域的rs413582、rs693758、rs9349379、rs1004467、rs17115149、rs1241340

3、9、rs3519、rs1169310、rs9899364和rs428253等10個(gè)位點(diǎn),通過病例對(duì)照研究,探討位于以上染色體區(qū)域的位點(diǎn)與CAD易感性和嚴(yán)重程度的關(guān)聯(lián)。
  第一部分6個(gè)染色體區(qū)域的基因多態(tài)性與冠心病易感性的關(guān)聯(lián)性研究
  目的:
  通過研究GWAS曾經(jīng)報(bào)道過的6個(gè)染色體區(qū)域中的 rs413582、rs693758、rs9349379、rs1004467、rs17115149、rs12413409、rs

4、3519、rs1169310、rs9899364和rs428253位點(diǎn)基因型及其等位基因在重慶地區(qū)漢族人群中C AD患者和對(duì)照人群的頻率分布情況,探索這些染色體區(qū)域SNPs與CAD發(fā)病的易感性關(guān)系,從而為CAD高危人群的早期篩檢和預(yù)防治療提供新的靶點(diǎn)和依據(jù)。
  方法:
  (1)采用病例-對(duì)照研究的方法,在重慶地區(qū)選擇符合CAD診斷標(biāo)準(zhǔn)的928例患者作為CAD組,選擇同一時(shí)期內(nèi)的928例非CAD人群作為Control組;<

5、br>  (2)采用TiangenDP318 DNA離心柱型試劑盒進(jìn)行外周血細(xì)胞基因組DNA的提取,并用SequenomMassArray系統(tǒng)對(duì) rs413582、rs693758、rs9349379、rs1004467、rs17115149、rs12413409、rs3519、rs1169310、rs9899364和rs428253位點(diǎn)進(jìn)行SNPs分型檢測(cè);
 ?。?)研究人群的基本情況、SNPs的基因型和等位基因在各組的頻率分

6、布與CAD的關(guān)聯(lián)性分析均采用SPSS20.0進(jìn)行。
  結(jié)果:
  (1)與TT基因型相比,rs413582的CC基因型可減少CAD、早發(fā)CAD和女性CAD的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(CAD:OR=0.696,95%CI:0.496-0.975;早發(fā)CAD:OR=0.480,95%CI:0.245-0.942;女性CAD:OR=0.624,95%CI:0.395-0.988);rs413582的CT基因型則與降低CAD和男性CAD發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相

7、關(guān)(CAD:OR=0.785,95%CI:0.627-0.982;男性CAD:OR=0.682,95%CI:0.493-0.943)。C等位基因與減少CAD、早發(fā)CAD、遲發(fā)CAD和男性CAD發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)均存在統(tǒng)計(jì)學(xué)關(guān)聯(lián)(P<0.05)
 ?。?)與 G等位基因相比,rs9349379的A等位基因可降低CAD和女性CAD的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(CAD:OR=0.853,95%CI:0.738-0.986;女性CAD:OR=0.802,95%CI:

8、0.652-0.986)。
 ?。?)rs9899364的AG基因型頻率在CAD組和Control組的分布中有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(p=0.036);A等位基因?qū)AD、遲發(fā)CAD和女性CAD的發(fā)病均有保護(hù)作用(CAD:OR=0.855,95%CI:0.750-0.975;遲發(fā)CAD:OR=0.830,95%CI:0.707-0.974;女性CAD:OR=0.828,95%CI:0.689-0.995)
 ?。?)遺傳模型分析結(jié)果顯示

9、:在顯性模型中,rs413582(p=0.014)和rs9899364(p=0.038)的野生型純合子均為CAD的危險(xiǎn)因素。
  結(jié)論:
 ?。?)rs413582與CAD易感性有顯著性關(guān)聯(lián);
  (2)rs9349379的A等位基因可降低CAD和女性人群CAD的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn);
  (3)rs9899364的AG基因型和CAD易感性有關(guān),A等位基因可降低CAD、
  遲發(fā)CAD和女性人群CAD的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。

10、>  第二部分6個(gè)染色體區(qū)域的基因多態(tài)性與冠心病嚴(yán)重程度的關(guān)聯(lián)性研究
  目的:
  在診斷為CAD的患者中選取接受了冠脈造影術(shù)(Coronary angiography,CAG)的患者共400例進(jìn)行SNPs多態(tài)性與CAD嚴(yán)重程度的分析,以探討基因多態(tài)性對(duì)CAD嚴(yán)重程度的影響。
  方法:
  (1)在重慶市的六所醫(yī)院中選擇確診為CAD且接受過CAG治療或檢查的患者400例作為病例組,選擇同一時(shí)期在這6所醫(yī)院進(jìn)行

11、健康體檢的參與人員作為對(duì)照組。
 ?。?)所有患者的CAG造影結(jié)果均由兩位以上經(jīng)驗(yàn)豐富的心內(nèi)科醫(yī)生進(jìn)行判定,并采用Gensini積分評(píng)分系統(tǒng)對(duì)判定結(jié)果進(jìn)行Gensini評(píng)分。
  結(jié)果:
 ?。?)與TT基因型相比,rs413582的CT基因型可降低右冠(Right coronary artery,RCA)病變和左前降支(Left anterior descending artery,LAD)病變的風(fēng)險(xiǎn)(RCA:OR=

12、0.559,95%CI:0.362-0.861;LAD:OR=0.578,95%CI:0.409-0.819);rs9349379的AG基因型攜帶者發(fā)生LAD病變的風(fēng)險(xiǎn)為GG基因型攜帶者的0.63倍(OR=0.630,95%CI:0.446-0.889);rs9899364的AG基因型則與降低RCA病變、LAD病變和左回旋支(Left circumflex,LCX)病變有統(tǒng)計(jì)學(xué)關(guān)聯(lián)(RCA:OR=0.550,95%CI:0.359-0.

13、842;LAD:OR=0.586,95%CI:0.409-0.839;LCX:OR=0.531,95%CI:0.327-0.863),且攜帶rs9899364的AA基因型者 RCA病變風(fēng)險(xiǎn)比攜帶 GG基因型者低(OR=0.350,95%CI:0.185-0.665)。
 ?。?)rs413582、rs9349379和rs9899364的基因型頻率在2支血管病變(Vessel disease,VD)組與Control組中的分布差異均

14、有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p值分別為0.041,0.022和0.036),rs9899364的基因型還與1VD相關(guān)(p=0.023)。
 ?。?)rs9349379的G等位基因頻率和Gensini評(píng)分等級(jí)呈正相關(guān)關(guān)系,隨著其頻率增加,相應(yīng)的Gensini評(píng)分等級(jí)也升高(ptrend=0.026)。
  結(jié)論:
 ?。?)rs413582、rs9349379和rs9899364的雜合子基因型均與中國(guó)漢族人群的C AD病變部位相關(guān);<

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