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文檔簡介
1、家蠶(Bombyxmori)是重要的鱗翅目模式昆蟲,家蠶基因組測序工作在2003年10月即已完成,并于2008年8月完成家蠶bHLH家族成員的鑒定。家蠶有52個bHLH基因,系統(tǒng)進化樹分析把它們分成39個家族,六個組。然而,有關家蠶bHLH基因及其功能的研究報道較少。迄今為止,只有ASCa家族的4個成員和Twist家族、AP4家族、Bmal家族、Trh家族各有1個成員的基因得到克隆,并檢測了它們在家蠶不同組織中的表達情況。
2、 atonal基因屬于bHLH轉錄因子的Atonal家族,最早于1993年在果蠅中被發(fā)現(xiàn),隨后在赤擬谷盜,河豚魚,雞,小鼠以及人中相繼發(fā)現(xiàn)了該基因,然而關于家蠶atonal基因的研究仍報道較少。
本文利用生物信息學和實驗方法得到了家蠶bHLH轉錄因子基因atonal,并對其進行了分析和鑒定,為進一步研究atonal的功能積累了一些基礎信息資料。實驗研究的主要結果如下:
1.生物信息學分析表明,家蠶atonal
3、基因全長644bp,包括60bp的5'-UTR,170bp的3'-UTR,414bp的開放閱讀框(ORF),編碼138個氨基酸,預計相對分子質量為15.5kDa。從獲得的基因結構來看,該基因在編碼區(qū)內沒有內含子,有轉錄起始位點和poly(A)加尾信號,編碼區(qū)內存在一個保守的功能結構域bHLH基序,位于cDNA的No.301-No.459。多序列比對分析發(fā)現(xiàn),Bmatonal的氨基酸序列和其他物種在bHLH基序區(qū)有較高保守性。系統(tǒng)發(fā)生分析
4、結果表明,家蠶atonal序列與大紅斑蝶的atonal序列形成單進化枝。
2.根據(jù)cDNA序列設計引物擴增出家蠶atonal編碼序列,利用pGEX-4T-2表達系統(tǒng)在大腸桿菌BL21中進行了表達,得到了分子量約41.5kDa的融合蛋白,westernblotting鑒定正確。通過割膠對目的蛋白純化回收后免疫新西蘭大白兔,制備抗家蠶Atonal蛋白的血清。
3.對家蠶不同發(fā)育階段和組織進行RT-PCR分析,結果
5、表明atonal在家蠶各個發(fā)育階段和幼蟲不同組織都有表達,其中神經(jīng)節(jié)及五齡幼蟲的表達量相對較高。提取五齡幼蟲各組織蛋白進行westernblotting分析,其結果與RT-PCR的分析結果一致即atonal在各組織均有表達。細胞免疫熒光顯示家蠶Atonal蛋白主要定位在細胞質中,細胞核膜中少量表達。
4.利用家蠶桿狀病毒表達系統(tǒng),在家蠶BmN細胞系中成功過表達了重組的Atonal蛋白,westernblotting鑒定條帶
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