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文檔簡介
1、普通野生稻(OryzarufipogonGriff.)作為一種非常有價(jià)值的野生種質(zhì)資源,受到科研工作者廣泛地關(guān)注。 本文在水稻基因組12條染色體的兩臂上各隨機(jī)選擇一個(gè)基因位點(diǎn),共24個(gè)位點(diǎn),在22個(gè)普通野生稻(OryzarufipogonGriff.)材料中均測定并獲得清晰的DNA序列18989bp。共發(fā)現(xiàn)了152個(gè)SNPs位點(diǎn),其中轉(zhuǎn)換92個(gè)(占60.5%),顛換60個(gè)(39.5%)。 普通野生稻的SNPs分布頻率為θ
2、:1.84×10-3,π:1.52×10-3?;蚓幋a區(qū)的SNPs頻率θ:1.552×10-3,π:1.66×10-3與基因內(nèi)非編碼區(qū)θ:1.38×10-3,π:1.03×10-3相近,而遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于基因之間非編碼區(qū)SNPs頻率θ:2.54×10-3,π:2.35×10-3。 在普通野生稻中分布最多的是稀有SNPs(頻率<10%),占其總SNPs的59.21%,隨著SNPs次等位基因頻率增加,SNPs數(shù)量呈明顯下降趨勢。 普
3、通野生稻的24個(gè)基因位點(diǎn)上152個(gè)SNPs,共組成172種單倍型,單倍型多樣性為0.5944。按普通野生稻不同地理來源分析單倍型多樣性得出:海南普通野生稻的遺傳多樣性高于兩廣地區(qū),廣東與廣西普通野生稻的遺傳多樣性接近。 從UPMGA聚類中可以看到:海南大多材料聚為一類、江西東鄉(xiāng)單獨(dú)聚為一類,廣東廣西趨向聚在一起。與前人的研究結(jié)果一致,即普通野生稻的分化與其地理分布有關(guān)。 本文還簡單討論了普通野生稻與地方栽培稻之間相同基因
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