凡納濱對蝦(Litopenaeus vannamei)親蝦性腺轉錄組分析及雌雄性腺差異表達基因鑒定.pdf

1、凡納濱對蝦是我國乃至世界海水養(yǎng)殖的主導品種，但目前凡納濱對蝦的基礎研究薄弱，特別是繁殖分子機理的研究尚缺。本研究對不同發(fā)育時期的凡納濱對蝦雌雄性腺組織進行轉錄組測序和分析，鑒定性別差異表達的功能基因。通過雄性親蝦精巢(Testis)、剪眼柄前雌性親蝦卵巢(Ovary)及剪眼柄后1天（1Day afer Eyestalk Ablation Ovary，1DaEAO）、6天(6Days afer Eyestalk Ablation Ovar

2、y，6DaEAO)的雌性親蝦卵巢等4個樣品的轉錄組測序，共獲得原始序列249，107，536條，經(jīng)質量控制、過濾和de novo組裝后，獲得凡納濱對蝦性腺表達Unigenes65，218個，平均長度1，021bp，N50達到2，000bp。注釋到NR，NT，Swiss-Prot，KEGG，COG，GO庫的Unigenes數(shù)量和比例分別是26，482個(87.39％)，14，626個(48.26％)，23，062個(76.10％)，20，

3、659個(68.17％)，11，935個(39.38％)，12，320個(40.65％)。對GO數(shù)據(jù)庫注釋的12，320個Unigenes進行了GO分類，其中分屬于分子功能、細胞組分和生物過程的Unigenes數(shù)分別為9，884個、19，939個和34，317個。注釋到KEGG庫的20，659個Unigenes映射到258個代謝通路上，定位基因最多的三個通路分別為代謝、RNA轉運和微絲骨架的調控。對卵巢(Ovary)和精巢(Testis

4、)中的基因表達情況進行比較，發(fā)現(xiàn)22，808個Unigenes呈現(xiàn)了性別特異性或差異性表達。其中3，529個在卵巢中上調表達，另外19，279個在精巢中上調表達。經(jīng)過富集分析，得到414個精巢上調表達DEGs(differentially expressed genes)富集的GO terms和646個卵巢上調表達DEGs富集的GO terms，以及34個性別差異基因富集的代謝途徑。通過實時定量PCR驗證，我們鑒定獲得9個卵巢特異表達，