歐芹不同逆境條件下適宜內參基因的篩選.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、歐芹(Petroselinum crispum L.),又名洋芫荽和法國香菜等,屬于傘形科歐芹屬一二年生草本植物。作為香辛蔬菜,食用嫩葉,鮮根、莖汁可供藥用。非生物脅迫,包括溫度(高溫、低溫)、鹽害和干旱等,是導致歐芹減產(chǎn)的重要因素之一。分離歐芹相關的抗性基因,篩選與抗性性狀緊密連鎖的分子標記,對于歐芹抗逆品種的選育有重要的意義。qRT-PCR是定量基因轉錄水平的主要方法之一,需要使用內參基因(Reference gene)校正目標基因

2、的表達量。
  本實驗克隆了歐芹相關內參基因的部分片段,使用qRT-PCR技術建立每個基因相對應實時熒光定量的方法,研究了不同逆境條件下內參基因表達的穩(wěn)定性。同時,為進一步驗證在本研究中確定的內參基因,還對pcDREB1基因在歐芹高溫脅迫下的表達譜進行了研究。具體研究結果如下:
  (1)以歐芹葉片cDNA為模板,篩選了8條內參基因(GAPDH、ACTIN、eIF-4α、SAND、UBC、TIP41、EF-1α和TUB)的中

3、間片段。與其他物種的同源基因進行BLAST比對,結果顯示堿基相似度均在80%以上。
  (2)利用qRT-PCR技術建立了上述8條基因相對應的實時定量方法。結果表明當10倍稀釋cDNA為擴增模板時,標準曲線的敏感性和相關性較高,并且能在高通量范圍內顯示cDNA樣品的起始量,為后續(xù)實驗提供了較為準確的數(shù)據(jù)支持。
  (3)采用不同脅迫和激素處理的定量cDNA為模板,利用qRT-PCR技術,對篩選得到的8條內參基因通過geNor

4、m、BestKeeper及NormFinder三個生物學軟件計算進行穩(wěn)定性分析。不同處理下,歐芹不同內參基因表現(xiàn)出不同的表達穩(wěn)定性。結果表明,TUB和ACTIN在高溫處理中顯示相對最為穩(wěn)定的表達水平;低溫脅迫下eIF-4α和GAPDH均可應用于穩(wěn)定性分析;干旱處理,EF-1α和ACTIN為最佳內參基因;干旱脅迫處理的最佳選擇是EF-1α和GAPDH;GA和ABA處理下均為EF-1α的表達穩(wěn)定性最佳,MeJA和SA處理條件下ACTIN和E

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