FSHβ基因區(qū)域多態(tài)性與臺灣褐色菜鴨生產(chǎn)性狀關(guān)聯(lián)研究.pdf

1、本實驗以臺灣褐色菜鴨為試驗材料，通過 PCR-SSCP和測序技術(shù)對臺灣褐色菜FSHβ基因進行SNP檢測同時分析其多態(tài)性與各性狀的關(guān)聯(lián)；通過實時熒光定量PCR技術(shù)，通過使用2-ΔΔCt換算法對FSHβ基因拷貝數(shù)進行定量，并分析其多態(tài)性與生產(chǎn)性能的關(guān)聯(lián)。
　　（1）在臺灣褐色菜鴨FSHβ基因擴增序列的第106bp、第266bp和第267bp位點發(fā)現(xiàn)堿基替換（分別為A106C、C266T和A267G），并產(chǎn)生了HH、Hh和hh三種基因型

2、，其中HH型為野生型，共有7個個體，Hh型共有46個個體，hh型共有41個個體；h等位基因頻率是0.6809，H等位基因頻率是0.3191；該基因座位的雜合度為0.4346；其多態(tài)信息含量為0.3401；FSHβ基因多態(tài)位點經(jīng)χ2適應(yīng)性檢驗表明處于平衡狀態(tài)。經(jīng)關(guān)聯(lián)發(fā)現(xiàn)，基因型Hh和基因型hh的個體的四周齡體重均顯著低于基因型HH的個體(P<0.05)；基因型Hh和基因型hh的個體的蛋重均顯著高于基因型HH的個體(P<0.05)；基因型H

3、h的個體蛋殼厚度極顯著低于基因型HH的個體(P<0.01)，同時基因型hh的個體也顯著低于基因型HH的個體(P<0.05)。
　?。?）將FSHβ-F/FSHβ-R和Anpl-DRA-F/Anpl-DRA-R兩對引物進行定量PCR的擴增，應(yīng)用熒光定量PCR儀自帶系統(tǒng)，繪制標準曲線。FSHβ基因引物的曲線相關(guān)系數(shù)R2=0.996，擴增效率E=108.337％，斜率為-3.137；Anpl-DRA基因引物的曲線相關(guān)系數(shù)R2=0.990

4、，擴增效率E=106.068%，斜率為-3.185。其中斜率差為0.048，擴增效率差為2.269%。
　?。?）本試驗利用熒光定量PCR技術(shù)檢測鴨FSHβ基因拷貝數(shù)變異情況，共檢測五種變異類型，個體數(shù)分別為42、26、15、7、4。關(guān)聯(lián)分析顯示，臺灣褐色菜鴨FSHβ基因CNVs位點的五種拷貝數(shù)變異與其蛋殼厚度和蛋白高度均存在顯著相關(guān)(P<0.05)，在蛋殼厚度中五種拷貝數(shù)變異存在兩兩顯著差異，其中拷貝數(shù)為1的個體蛋殼厚度極顯著高