豬GSTM2，TGF-β1基因的多態(tài)性及與生產(chǎn)性狀相關(guān)性分析.pdf

1、母豬產(chǎn)仔性狀是評價豬場效益的重要指標(biāo)，也是豬育種工作的重點。谷胱甘肽-硫-轉(zhuǎn)移酶mu亞基基因（glutathione S-transferase Mu2，GSTM2）和轉(zhuǎn)化生長因子β1（transfonminggrowth factor beta type one，TGF-B1）基因是與母豬生殖系統(tǒng)免疫和生長發(fā)育有關(guān)的基因。分析GSTM2基因和TGF-β1基因的多態(tài)性，并與生產(chǎn)性狀進(jìn)行相關(guān)性分析，可以檢測GSTM2基因和TGF-β1基因

2、的單堿基改變對母豬生產(chǎn)性狀的影響，通過合并基因型的方法，可以同時檢測兩個基因的不同多態(tài)位點對生產(chǎn)性狀的影響。本研究以野豬、民豬、北京黑豬豬、長白豬和法系大白為實驗材料，克隆野豬基因的全長編碼區(qū)序列；用生物信息學(xué)的方法對其結(jié)構(gòu)功能域及分子進(jìn)化進(jìn)行分析；采用PCR-SSCP的方法分析GSTM2基因和TGF-β1基因的單核苷酸多態(tài)性，檢測了不同等位基因在豬種中的分布規(guī)律；分析了每個多態(tài)位點對母豬繁殖性狀的影響，并利用最小二乘法估算了合并基因型

3、對母豬繁殖性狀的影響。獲得的主要研究結(jié)果如下：
　　 1獲得了野豬的GSTM2基因的全長編碼區(qū)序列，序列全長683bp，編碼188個氨基酸。同時獲得野豬的TGF-β1基因的全長編碼序列，序列全長1172bp，編碼390個氨基酸。采用生物信息學(xué)方法對其編碼的多肽鏈進(jìn)行了結(jié)構(gòu)和功能域的初步分析，GSTM2編碼蛋白的功能域中含有2個結(jié)構(gòu)蛋白：GST-NTER和GST-CTER。TGF-β1編碼蛋白的功能域中含有多個功能結(jié)構(gòu)：EGF-1

4、，2FE2S-FER-1，VWFC-1，ANAPHYLATOXIN-1，CTCK-1，DEFENSIN，4FE4S-FER-1，INTEGRIN-BETA。
　　 2 PCR-SSCP分析發(fā)現(xiàn)，在GSTM2基因中內(nèi)含子存在3個單核苷酸突變：370G→370A，2395C→2395T，2406A→2406G。外顯子中存在9個單核苷酸突變，其中5個：390G→390A，884G→884C，929G→929A，1274G→1274A，

5、1289A→1289G屬于同義突變。4個：1435T→1435C，2290A→2290C，2466C→2466A.2486A→2486T屬于錯義突變。TGF-β1基因中發(fā)現(xiàn)2個內(nèi)含子單核苷酸突變，第四內(nèi)含子33bpC→T和第六內(nèi)含子179bpA→G處。
　　 3基因多態(tài)單點分析表明，GSTM2基因中G2位點的AB型總產(chǎn)仔數(shù)最高、G5位點的AB型總產(chǎn)仔數(shù)最高、G7位點的AB型總產(chǎn)仔數(shù)最高，這三個位點的突變對母豬生產(chǎn)性狀的影響極顯著