家兔IRS-1和BMPR1B基因多態(tài)性及其與部分生產(chǎn)性能的相關(guān)性分析.pdf

1、IRS蛋白是IR/IGF受體酪氨酸激酶的底物，是連接IR/IGF信號通路中上下游信號分子的重要介質(zhì)，在調(diào)節(jié)機體的生長、發(fā)育中起到非常重要的作用。骨形態(tài)發(fā)生蛋白受體(BMPR)，它可通過參與BMP-2，BMP-4，BMP-6，BMP-7，BMP-15和GDF-5的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)，從而在調(diào)節(jié)顆粒細(xì)胞分化、促進(jìn)卵泡發(fā)育，增加卵泡數(shù)及促進(jìn)骨骼生長中發(fā)揮著重要作用。本研究以家兔IRS-1和BMPR1B基因為候選基因，以新西蘭、天府黑兔、艾格、香檳兔4個

2、品種共785只肉兔（其中幼兔587只、能繁母兔198只）為實驗研究對象，采用PCR產(chǎn)物直接測序的方法檢測IRS-1和BMPR1B編碼區(qū)SNPs位點，并應(yīng)用RFLP及HRM技術(shù)對每個基因候選靶SNPs位點進(jìn)行基因分型，分析每個靶SNPs位點不同基因型與家兔生產(chǎn)性能的相關(guān)性，同時利用熒光定量技術(shù)分析不同生長階段新西蘭兔肝臟組織及70日齡時C.189G＞T位點不同基因型個體IRS-1基因表達(dá)量變化。獲得的實驗結(jié)果如下:
　　1.經(jīng)直接測

3、序發(fā)現(xiàn)IRS-1基因編碼區(qū)存在9個SNPs位點，分別為c.189G＞T、c.337C＞T、c.1341C＞T、c.2541T＞A、c.2574G＞A、 c.2811C＞T、 c.3234G＞A、c.3508T＞C和c.3636C＞T，且9個突變位點均為同義突變。
　　2.對IRS-1基因c.189G＞T和c.2574G＞A兩個位點基因分型結(jié)果顯示，在新西蘭和天府黑兔中c.189G＞T(GG、GT、TT)和c.2574G＞A(GG、

4、AG、AA)均檢測到三種基因型，在艾格和香檳兔中c.189G＞T(GG、GT)和c.2574G＞A(GG、AG)只檢測到兩種基因型。遺傳多態(tài)信息含量(PIC)分析表明兩個候選靶位點在新西蘭和天府黑兔中處于中度多態(tài)(0.25＜PIC＜0.5)，在艾格和香檳兔中處于低度多肽(PIC＜0.25);卡方檢驗結(jié)果顯示在4個家兔品種中兩個位點均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P＞0.05)。
　　3.對IRS-1基因c.189G＞T

5、和c.2574G＞A位點與家兔生產(chǎn)性能關(guān)聯(lián)性分析結(jié)果顯示:IRS-1基因c.189G＞T和c.2574G＞A位點不同基因型個體之間均與新西蘭兔56、70、84日齡個體重及35-84日齡平均日增重顯著(P＜0.05)或極顯著相關(guān)(P＜0.01)。對艾格、香檳、天府黑兔三個家兔品種混合群體合拼分析結(jié)果表明，c.189G＞T位點GT基因個體84日齡體重、35-84日齡平均日增重及后腿肌肉pH24值顯著高于GG基因型個體(P＜0.05)，其他性

6、狀在兩種基因型之間差異不顯著(P＞0.05);c.2574G＞A位點GG基因型個體和GT基因型個體之間不同日齡體重、屠宰率、肌內(nèi)脂肪含量等性狀均無顯著性關(guān)聯(lián)(P＞0.05)。
　　4.單倍型分析結(jié)果顯示:IRS-1基因c.189G＞T和c.2574G＞A位點共構(gòu)建成四種單倍型h1(GA)、h2(GG)、h3(TA)、h4(TG)，在新西蘭兔(N=280)中共檢測到七種單倍型組合，分別h1h2(GGAG)、h1h3(GTAA)、h1

7、h4(GTAG)、h2h2(GGGG)、h2h4(GTGG)、h3h3(TTAA)、h3h4(TTAG);在艾格、香檳、天府黑兔三個品種共計214只肉兔中共檢測到四種單倍型組合，分別為h1h2(GGAG)、h1h4(GTAG) h2h2(GGGG)、h2h4(GTGG)。在新西蘭兔群體中單倍型組合h3h3個體56、70、84日齡體重及35-84日齡平均日增重均顯著(P＜0.05)或極顯著(P＜0.01)高于h1h2、h1h4、h2h2及

8、h2h4組合。對艾格、香檳、天府黑兔三個家兔品種混合群體合拼分析結(jié)果表明,h1h4組合基因型個體84日齡體重、35-84日齡平均日增重顯著高于其他三種組合，背最長肌肌內(nèi)脂肪含量顯著高于h2h2組合和h2h4組合，背最長肌pH24值、后腿肌肉pH24值顯著高于h1h2組合(P＜0.05);h2h4組合后腿肌內(nèi)脂肪含量顯著高于h1h2組合(P＜0.05)。
　　5.家兔肝臟IRS-1基因表達(dá)量研究表明:56日齡肝臟組織IRS-1基因表

9、達(dá)量顯著高于35日齡(P＜0.05);70日齡時IRS-1基因c.189G＞T位點GG基因型個體肝臟組織IRS-1基因表達(dá)量顯著高于TT基因型個體(P＜0.05)。
　　6.經(jīng)混合測序發(fā)現(xiàn)BMPR1B基因編碼區(qū)存在13個同義SNPs位點(c.9C＞T、c.54C＞T、 c.75T＞A、 c.88C＞T、 c.96T＞C、 c.117G＞A、 c.384A＞G、 c.540C＞T、c.603T＞C、c.1254T＞A、c.1332A

10、＞G、c.1356A＞G、c.1436A＞G)和一個錯義SNPs位點(leu131 ser)。
　　7.對BMPR1B基因c.117G＞A位點基因分型結(jié)果顯示，在新西蘭和天府黑兔中該位點均存在GG、GA及AA三種基因型。遺傳多態(tài)信息含量(PIC)分析表明c.117G＞A位點在新西蘭和天府黑兔兩個品種中均處于中度多態(tài)(0.25＜PIC＜0.5);卡方檢驗結(jié)果顯示該位點在新西蘭和天府黑兔兩個品種中均處于Hardy-Weinberg平衡