集胞藻PCC6803生物燃料乙醇丁醇?jí)毫Ψ磻?yīng)的蛋白組學(xué)分析.pdf

1、丁醇和乙醇是很有潛力的二代生物能源,最近已有研究采用合成生物學(xué)方法構(gòu)建生產(chǎn)丁醇乙醇的藍(lán)藻系統(tǒng)。然而,藍(lán)藻對(duì)生物燃料的耐受性非常低,限制了這種可再生生產(chǎn)宿主的經(jīng)濟(jì)適用性。而且,目前藍(lán)藻對(duì)生物燃料的耐受機(jī)理還不是很清楚。本研究中,為了更加深入的了解藍(lán)藻對(duì)乙醇丁醇的耐受機(jī)制,我們使用iTRAQ標(biāo)記LC-MS/MS技術(shù)對(duì)集胞藻在乙醇丁醇條件下的壓力反應(yīng)進(jìn)行定量蛋白組學(xué)分析,以便可以建立生產(chǎn)生物燃料的穩(wěn)健的宿主。
　　對(duì)于丁醇處理實(shí)驗(yàn),本研

2、究得到了25347個(gè)高質(zhì)量肽段的數(shù)據(jù)集,對(duì)應(yīng)1452個(gè)特定蛋白質(zhì),覆蓋了大約40％的集胞藻所有可預(yù)測(cè)蛋白。蛋白質(zhì)豐度的比較分析識(shí)別到303個(gè)蛋白差異表達(dá)。對(duì)于乙醇處理實(shí)驗(yàn),共得到24887個(gè)高質(zhì)量肽段,對(duì)應(yīng)1509個(gè)特定蛋白質(zhì),覆蓋了集胞藻全基因組預(yù)測(cè)蛋白的42%。其中乙醇處理樣和對(duì)照樣在24h和48h差異表達(dá)蛋白分別有135和293個(gè)。
　　本研究的蛋白組學(xué)功能分析表明,集胞藻采用聯(lián)合機(jī)制來(lái)應(yīng)對(duì)乙醇丁醇?jí)毫Α６〈紬l件下,主要的保