一種新的篩選復(fù)雜性狀相關(guān)基因的方法.pdf

1、復(fù)雜性狀由遺傳因素、表觀遺傳因素和環(huán)境因素共同決定，并在群體中呈現(xiàn)連續(xù)性變異。這些變異通常與DNA遺傳多態(tài)有關(guān)，其中最常見(jiàn)的遺傳多態(tài)是單核苷酸多態(tài)(SNP)。目前，復(fù)雜性狀與SNP的關(guān)聯(lián)研究已成熱點(diǎn)，但仍有許多復(fù)雜性狀的遺傳基礎(chǔ)還不是很清楚，這就需要更有效為的研究方法來(lái)推動(dòng)它們的研究。最近，我們研究發(fā)現(xiàn):在人類(lèi)或酵母和線蟲(chóng)等模式生物中，某些復(fù)雜性狀與次要位點(diǎn)含量(Minor Allele Content，MAC)存在很強(qiáng)的相關(guān)性，如在秀

2、麗線蟲(chóng)的HW npr-1 RIAILs(Recombinant Inbred Advanced Intereross Lines)中，MAC同線蟲(chóng)離開(kāi)食物頻率(leaving rate)存在相關(guān)性。這就說(shuō)明MAC通過(guò)某種方式調(diào)控了相關(guān)基因的表達(dá)，從而影響相應(yīng)的復(fù)雜性狀。線蟲(chóng)的覓食行為是一種受多基因調(diào)控的復(fù)雜性狀，以往的研究證實(shí):npr-1、glb-5以及tyra-3等基因參與調(diào)控這一行為，但具體的神經(jīng)和分子機(jī)制還不是很清楚。
　　

3、目標(biāo):建立一種新的篩選復(fù)雜性狀相關(guān)基因的方法。
　　方法:本實(shí)驗(yàn)以線蟲(chóng)的覓食行為作為研究性狀。利用基因表達(dá)差異顯著性分析軟件(SAM)，從HW npr-1 RIAILs中篩選mRNA表達(dá)水平同時(shí)與MAC和leaving rate相關(guān)的基因，作為該行為相關(guān)基因的候選基因。然后，隨機(jī)從候選基因中挑選部分基因，通過(guò)RNA干擾技術(shù)對(duì)這些基因的功能進(jìn)行分析和驗(yàn)證，以證實(shí)該方法是否有效和可行。
　　結(jié)果:在HW npr-1 RIAILs

4、的基因表達(dá)譜中，有492個(gè)基因的表達(dá)與MAC相關(guān)，173個(gè)基因的表達(dá)與leaving rate相關(guān)，27個(gè)基因的表達(dá)同時(shí)與MAC和leaving rate相關(guān)。從這27個(gè)基因中隨機(jī)挑選4個(gè)表達(dá)上調(diào)基因(fbxa-103、lnp-1、ZC239.14和F42G2.2)和1個(gè)表達(dá)下調(diào)基因（nspd-7）進(jìn)行RNA干擾驗(yàn)證。與陰性對(duì)照相比，fbxa-103、lnp-1和ZC239.14被干擾后，線蟲(chóng)的leaving rate均顯著降低;nsp