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1、一、焦磷酸測(cè)序技術(shù)行宮頸脫落細(xì)胞Hr-HPV(高危型HPV)分型檢測(cè)
目的:評(píng)價(jià)焦磷酸測(cè)序技術(shù)在Hr-HPV分型檢測(cè)中的應(yīng)用價(jià)值,分析此方法的準(zhǔn)確性、檢出高級(jí)別宮頸病變的有效性,及應(yīng)用于臨床檢查和大規(guī)模篩查的可行性。同時(shí)獲取以陰道鏡門診患者為研究人群的Hr-HPV感染比例及所感染病毒型別的分布。
內(nèi)容:以200名陰道鏡門診患者為研究對(duì)象,所有患者均接受宮頸液基細(xì)胞學(xué)檢查(TCT)、HC-Ⅱ檢測(cè)、焦磷酸測(cè)序Hr
2、-HPV分型檢查。評(píng)估焦磷酸測(cè)序技術(shù)在宮頸Hr-HPV檢測(cè)中的應(yīng)用價(jià)值;分析焦磷酸測(cè)序Hr-HPV檢查結(jié)果與HC-Ⅱ檢測(cè)的一致性;評(píng)價(jià)焦磷酸測(cè)序技術(shù)檢出宮頸高級(jí)別病變(CINⅡ及以上病變)的價(jià)值;分析研究人群中Hr-HPV型別分布。
方法:應(yīng)用焦磷酸測(cè)序法檢測(cè)12型Hr-HPV(包括HPV16,18,31,33,35,39,45,51,52,56,58和59)感染。自宮頸液基細(xì)胞學(xué)檢查剩余細(xì)胞中提取DNA,經(jīng)HPV通用型引
3、物擴(kuò)增后,行焦磷酸測(cè)序檢測(cè)以上12型Hr-HPV,其中每四種型別測(cè)序引物至于同一反應(yīng)池中,僅需10分鐘即可完成測(cè)序反應(yīng)。分析此種檢測(cè)技術(shù)與美國(guó)FDA唯一認(rèn)證的HPV臨床檢測(cè)手段-HC-Ⅱ方法檢測(cè)出Hr-HPV感染的一致性;評(píng)價(jià)其作為宮頸癌及宮頸癌前病變篩查手段的有效性;根據(jù)測(cè)序結(jié)果確定標(biāo)本中特異型別的Hr-HPV感染,了解研究人群中Hr-HPV感染的型別分布。并將通用型引物PCR陽(yáng)性而焦磷酸測(cè)序陰性標(biāo)本的PCR產(chǎn)物純化、克隆后行傳統(tǒng)測(cè)序
4、分型檢測(cè),確定所感染的HPV型別。
結(jié)果:經(jīng)焦磷酸測(cè)序檢測(cè),發(fā)現(xiàn)200例研究對(duì)象中Hr-HPV感染98例,其中單一感染88例,雙重感染10例,檢測(cè)出9種Hr-HPV感染(HPV16,HPV18,HPV31,HPV33,HPV39,HPV45,HPV52,HPV58和HPV59)。Hr-HPV感染中,HPV16感染率為69.4%,占第一位;HPV-58感染率為16.3%,占第二位。焦磷酸測(cè)序檢測(cè)出的Hr-HPV感染率與宮頸病
5、變呈正相關(guān)關(guān)系(Kendall值為0.704,P<0.001);此方法檢出高級(jí)別宮頸疾患的敏感性和特異性分別為95%和65.1%,ROC曲線下面積為0.80;焦磷酸測(cè)序檢測(cè)Hr-HPV與HC-Ⅱ方法有高度的一致性(Kappa值為0.791,P<0.001)。
結(jié)論:焦磷酸測(cè)序檢測(cè)技術(shù)應(yīng)用于Hr-HPV檢測(cè)與HC-Ⅱ方法有很好地一致性,并可以進(jìn)行HPV分型檢測(cè)。其對(duì)宮頸CINⅡ及以上病變具有很好的檢出率。是宮頸癌及癌前病變篩
6、查的有效手段。
二、應(yīng)用焦磷酸測(cè)序技術(shù)對(duì)HPV16 L1片段3’端和LCR上CpG位點(diǎn)甲基化水平行定位、定量檢測(cè)并分析與HPV16致宮頸癌作用相關(guān)性
目的:應(yīng)用焦磷酸測(cè)序技術(shù)定位、定量檢測(cè)位于HPV16 L1片段3’端和LCR上的21個(gè)甲基化位點(diǎn)的甲基化率,分析比較無(wú)宮頸病變攜帶者、CIN患者和宮頸癌患者間各甲基化位點(diǎn)甲基化率差異,了解HPV16甲基化與其致病性的關(guān)系。
內(nèi)容:以HPV16陽(yáng)性的
7、無(wú)宮頸病變病毒攜帶者、CIN患者和宮頸癌患者各30例為研究對(duì)象,研究各組患者所感染HPV16病毒L1片段3’端和LCR片段甲基化位點(diǎn)的甲基化狀念,分析評(píng)價(jià)HPV16甲基化與其致病性間關(guān)系。
方法:選擇HPV16陽(yáng)性的無(wú)宮頸病變病毒攜帶者、CIN患者和宮頸癌患者各30例,使用宮頸液基細(xì)胞學(xué)檢查剩余細(xì)胞提取DNA,經(jīng)重亞硫酸鹽處理后,分7個(gè)片段擴(kuò)增HPV16 L1片段3’端和LCR區(qū)域(此區(qū)域包含E6/E7啟動(dòng)子增強(qiáng)子及E2結(jié)
8、合位點(diǎn)),應(yīng)用焦磷酸檢測(cè)技術(shù)經(jīng)測(cè)序分析檢測(cè)研究片段所涉及的21個(gè)CpG位點(diǎn)甲基化狀態(tài),比較每一個(gè)甲基化位點(diǎn)甲基化率在三組患者間是否存在差異,評(píng)價(jià)HPV16甲基化與其致病性間的關(guān)系。
結(jié)果:經(jīng)定位、定量檢測(cè)HPV16目的片段上21個(gè)CpG位點(diǎn)甲基化水平,發(fā)現(xiàn)位于E6/E7啟動(dòng)子的5個(gè)甲基化位點(diǎn)均存在隨病情進(jìn)展甲基化率逐漸減低趨勢(shì),在無(wú)宮頸病變病毒攜帶者、CIN患者和宮頸癌患者三組間存在顯著性差異。位于L1片段3’端7032,
9、7019,7136三個(gè)位點(diǎn)的甲基化率在三組間存在顯著性差異,7032和7019位點(diǎn)無(wú)病變攜帶者甲基化率最低,宮頸癌者甲基化率最高,7136位點(diǎn)CIN組甲基化率最高,宮頸癌組次之,無(wú)病變者最低。
結(jié)論:HPV16 L1片段3’端及E6/E7啟動(dòng)子CpG位點(diǎn)甲基化率在三組患者中存在顯著性差異,這種甲基化差異可促進(jìn)HPV16與宿主基因整合、E6/E7癌基因表達(dá)從而導(dǎo)致宮頸癌的發(fā)生。HPV16甲基化狀況可能成為鑒別HPV16自愈性
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