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文檔簡介
1、第一部分血漿循環(huán)miRNA分析用于結直腸癌診斷的研究
研究目的:
微小RNA(miRNA)是一類潛力巨大的腫瘤診斷標志物,但血循環(huán)miRNA在腫瘤診斷中的價值尚不清楚,本研究初步評估了血漿循環(huán)miRNA分析在結直腸癌(CRC)分子診斷中的價值,為尋找新的CRC無創(chuàng)性早期診斷方法提供新的思路。
研究方法:
以14例CRC和10例正常對照者血漿總RNA為材料,采用Agilent miRNA表達譜芯片進
2、行miRNA表達譜分析,篩選在CRC患者血漿中上調的miRNA分子。用實時定量逆轉錄聚合酶鏈反應(qRT-PCR)技術在新的樣本組中進行進一步篩選和驗證。采用ROC曲線分析血漿miRNA對CRC及進展期腺瘤的診斷價值;并選擇20例CRC患者,分別收集手術前后的血漿標本,分析手術前后血漿差異表達miRNA的變化。
研究結果:
血漿miRNA表達譜分析結果顯示,在CRC血漿中上調的靶點有26個,下調的靶點29個。運用qR
3、T-PCR技術(以miR-16為內參照)對32個候選靶點進行了驗證,發(fā)現(xiàn)與正常對照組相比,CRC組及進展期腺瘤組血漿miR-29a和miR-92a水平均顯著上調(P<0.001)。ROC曲線分析顯示,血漿miR-29a和miR-92a診斷CRC的ROC曲線下面積(AUC)分別為0.844和0.838,診斷進展期腺瘤的AUC分別為0.769和0.749。聯(lián)合這兩個靶點診斷CRC的AUC為0.883,敏感度和特異度分別為83.0%和84.7
4、%,診斷進展期腺瘤的AUC為0.773,敏感度和特異度分別為73.0%和79.7%。此外,還發(fā)現(xiàn)手術后CRC患者血漿miR-29a和miR-92a含量均顯著下降(P<0.05)。
結論:
血漿miR-29a和miR-92a是潛在的CRC診斷分子標志物;血漿miRNA分析有可能發(fā)展成為一種新的非侵入性CRC早期診斷方法。
第二部分miR-95促進結直腸癌生長的研究
研究目的:
研究miR-
5、95對CRC細胞惡性表型的影響;并分析miR-95和CRC患者預后及腫瘤臨床病理表型的關系,評估m(xù)iR-95表達在CRC診斷、預后判斷中的應用價值。
研究方法:
采用Agilent miRNA表達譜芯片分析10對CRC組織(與癌旁正常組織比較)的miRNA表達譜。選擇在CRC中上調的miR-95進行分子機制研究,利用慢病毒載體構建了miR-95的穩(wěn)定細胞株,運用細胞培養(yǎng)、生長曲線分析、克隆形成實驗、細胞轉染、裸鼠成瘤
6、等技術分析miR-95對CRC腫瘤生長的影響。同時使用qRT-PCR技術檢測臨床CRC標本中miR-95的表達,分析miR-95和CRC患者預后及腫瘤臨床病理表型的關系。
研究結果:
miRNA表達譜分析結果顯示,CRC組織的miRNA表達譜式與對應正常粘膜組織相比存在顯著差異,共篩選出49個差異表達基因,其中miR-95等26個靶點在CRC中顯著上調。細胞增殖實驗、克隆形成實驗和裸鼠成瘤等實驗均表明miR-95高表
7、達可顯著促進CRC細胞(HCT-116和LoVo)的生長,抑制其凋亡。而利用siRNA抑制miR-95表達后,HCT-8細胞的生長速率顯著下調。運用qRT-PCR技術進一步分析了87例CRC組織中miR-95的表達,發(fā)現(xiàn)miR-95確實在腫瘤組織中顯著上調(P<0.0001),但與腫瘤分期、分化、大小及總生存均無顯著相關性。
結論:
與正常結直腸組織相比,CRC組織的miRNA表達譜存在顯著差異;miR-95能夠促進
8、CRC的生長,是潛在的CRC癌基因。
第三部分miR-95靶基因的篩選及鑒定
研究目的:
篩選并鑒定miR-95的靶基因,并探討miR-95如何通過其靶基因參與CRC的發(fā)生發(fā)展。
研究方法:
采用基因芯片技術分析miR-95穩(wěn)定細胞株的表達譜與對照細胞的差異,同時運用miRNA靶基因預測軟件TargetScan和miRanda對miR-95的靶基因進行生物信息學預測。根據芯片分析及軟件預
9、測篩選出miR-95的候選靶基因,克隆其3'-UTR,運用熒光素酶試驗初步分析miR-95對這些基因的表達是否具有調控作用,對miR-95的潛在靶基因做進一步篩選。最后,運用qRT-PCR和Western blot技術驗證候選靶基因在CRC細胞中的表達情況,用IHC技術檢測靶基因在臨床CRC標本中的表達情況。
研究結果:
根據軟件預測及基因芯片預測,篩選出9個候選靶基因進行驗證。熒光素酶試驗顯示,SNX1、PTPN3
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