XRCC1基因多態(tài)性與賁門癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)研究.pdf_第1頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

1、目的:環(huán)境致癌物及/或機(jī)體代謝產(chǎn)物攻擊細(xì)胞時(shí),可以起DNA損傷,生物體能夠保持遺傳信息的完整和穩(wěn)定,主要依賴體內(nèi)-系列DNA修復(fù)系統(tǒng)。X-射線交錯(cuò)互補(bǔ)修復(fù)基因1(X-ray repair cross complementing gene1,XRCC1)是一種DNA損傷修復(fù)基因,它編碼的蛋白質(zhì)在堿基切除修復(fù)和DNA單鏈斷裂修復(fù)過程中都發(fā)揮重要作用。XRCC1基因多態(tài)性可導(dǎo)致DNA損傷修復(fù)能力的個(gè)體差異,從而影響個(gè)體的腫瘤易感性。本研究旨在

2、探討XRCC1基因Arg194Trp、Arg280His、Arg399Gln單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)與賁門癌(gastric cardiac adenocarcinoma,GCA)遺傳易感性的關(guān)系。
   方法:采用基于醫(yī)院的病例-對(duì)照研究方法,收集455例賁門癌患者和650例健康對(duì)照個(gè)體的靜脈抗凝血5ml,同時(shí)記錄其病史、個(gè)人相關(guān)資料及上消化道腫瘤家族史。以蛋白

3、酶K消化-飽和氯化鈉鹽析法提取外周血白細(xì)胞DNA,采用聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性分析(restriction fragment length polymorphism analysis,RFLP)方法分別對(duì)XRCC1 Arg194Trp、Arg280His、Arg399Gln三個(gè)SNP位點(diǎn)進(jìn)行基因分型。
   數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析采用SPSS11.5版軟件包(SPSS

4、 Company,Chicago,Illinois,USA)進(jìn)行,P<0.05認(rèn)為有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。病例組與對(duì)照組的年齡差異行t檢驗(yàn)。用卡方檢驗(yàn)比較基因頻率的觀察值與預(yù)期值,并進(jìn)行Hardy-Weinberg平衡分析。病例組與對(duì)照組的基因型分布比較采用行×列表卡方檢驗(yàn)。以非條件Logistic回歸法計(jì)算經(jīng)年齡、性別校正的相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)度比值比(odds ratio,OR)及其95%可信區(qū)間(confidence interval,CI)。單體型頻

5、率及連鎖不平衡分析采用EH軟件(1.2version,Rockefeller University,New York)。
   結(jié)果
   1.健康對(duì)照組中的XRCC1第6外顯子Arg194Trp,第9外顯子Arg280His,第10外顯子處Arg399Gln三個(gè)多態(tài)位點(diǎn)的基因型分布頻率均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。
   2.XRCC1基因Arg194Trp多態(tài)Arg、Trp等位基因頻

6、率在GCA組和對(duì)照組分別為67.6%、32.4%和68.8%、31.2%,兩組相比無顯著差異(P>0.05);Arg/Arg、Arg/Trp、Trp/Trp基因型頻率分布在GCA(47.5%,40.2%和12.3%)和對(duì)照組(48.8%,40.2%和11.O%)間也無差異(P>0.05);與Arg/Arg基因型相比,Arg/Trp和Trp/Trp基因型不增加GCA的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),OR值分別為1.02(95%CI=0.79~1.32)和1.1

7、3(95%CI=0.76~1.68)。根據(jù)個(gè)體吸煙狀況以及上消化道腫瘤(upper gastrointestinal cancer,UGIC)家族史分層分析的統(tǒng)計(jì)學(xué)結(jié)果均未發(fā)現(xiàn)XRCC1基因Arg194TrpSNP與GCA發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)有明顯的相關(guān)性。
   3.XRCC1基因Arg280His多態(tài)Arg、His等位基因頻率在GCA組和對(duì)照組分別為89.3%、10.7%和90.5%、9.5%,兩組相比無顯著差異(P>0.05);Arg

8、/Arg、Arg/His、His/His基因型頻率分布在GCA(79.6%,19.6%和0.9%)和對(duì)照組(82.0%,16.9%和1.1%)間也無差異(P>0.05);與Arg/Arg基因型相比,攜帶His等位基因個(gè)體不增加GCA的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.14,95%CI=0.84~1.55)。根據(jù)個(gè)體吸煙狀況分層分析發(fā)現(xiàn),與Arg/Arg基因型相比,攜帶His等位基因(Arg/His+His/His)可能增加吸煙個(gè)體GCA的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(O

9、R=1.57,95%CI=1.00~2.52)。根據(jù)UGIC家族史分層分析的統(tǒng)計(jì)學(xué)結(jié)果未發(fā)現(xiàn)XRCC1基因Arg280His SNP對(duì)GCA發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的影響。
   4.XRCC1基因Arg399Gln多態(tài)Arg、Gln等位基因頻率在GCA組和對(duì)照組分別為74.0%、26.0%和73.8%、26.2%,兩組相比無顯著差異(P>0.05);Arg/Arg、Arg/Gln、Gln/Gln基因型頻率分布在GCA(53.0%,42.0%和

10、5.0%)和對(duì)照組(53.1%,41.5%和5.4%)間也無差異(P>0.05);與Arg/Arg基因型相比,Arg/Gln和Gln/Gln基因型與GCA的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)沒有明顯的相關(guān)性,OR分別為值為0.80(95%CI=0.60~1.06)和1.31(95%CI=0.74~2.33)。根據(jù)個(gè)體吸煙狀況以及UGIC家族史分層分析的統(tǒng)計(jì)學(xué)結(jié)果均未發(fā)現(xiàn)XRCC1基因Arg399Gln SNP對(duì)GCA發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的影響。
   5.應(yīng)用EH軟

11、件對(duì)XRCC1基因Arg194Trp、Arg280His、Arg399Gln三個(gè)SNP位點(diǎn)進(jìn)行的聯(lián)合分析顯示,CGG、TGG、CGA、CAG是最常見的四種單倍體型。單體型分布在GCA患者組與健康對(duì)照組間無顯著性差異(P>0.05)。與CGG單體型相比,其他單體型與CCA的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)無關(guān)。
   結(jié)論
   1.本研究結(jié)果提示XRCC1基因Arg194Trp、Arg399Gln多態(tài)位點(diǎn)可能與GCA的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)無關(guān)。
  

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