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文檔簡(jiǎn)介
1、第一部分 CAPON在非酒精性脂肪肝發(fā)病中的影響
目的:探討CAPON基因多態(tài)性對(duì)肝臟基因表達(dá)的影響作用,通過(guò)對(duì)差異基因的分析,探索CAPON在非酒精性脂肪肝發(fā)病的作用。
方法:Western Blot檢測(cè)人肝臟及其他組織CAPON表達(dá)。病理學(xué)方法診斷脂肪肝。肝臟全基因表達(dá)篩查采用Affymetrix公司Human Genome4302.0表達(dá)譜芯片進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果進(jìn)行SAM檢驗(yàn)及功能分析(gene ontology分
2、析和pathway分析),篩選2組間的差異基因。差異基因采用Real time PCR驗(yàn)證。
結(jié)果:Western Blot結(jié)果顯示CAPON在人肝臟中高度表達(dá)。CAPON rs12742393位點(diǎn)C攜帶組(n=26)脂肪肝患病比率(69.2%)高于AA攜帶組(n=60)患病比率(40%),結(jié)果具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.009)。10例人肝臟標(biāo)本(5例CAPON rs12742393位點(diǎn)AA等位基因攜帶者,5例C攜帶者),其全基
3、因組差異表達(dá)檢測(cè)結(jié)果顯示共得到164個(gè)基因在SAM檢驗(yàn)中P<0.05及差異倍數(shù)(C攜帶組/AA攜帶組)>1.4或小于0.7?;蚋患治觯╣ene ontology,GO)顯示48.8%差異基因參與生物學(xué)過(guò)程,其中60%參與代謝過(guò)程。Kegg通路分析顯示谷胱甘肽代謝通路顯著下調(diào),丙酮酸代謝通路上調(diào)。Real time PCR驗(yàn)證結(jié)果顯示谷胱甘肽代謝通路關(guān)鍵基因GSTM1以及其他抗氧化基因HBA1與HBB在C攜帶組中表達(dá)顯著下調(diào)。參與丙
4、酮酸代謝相關(guān)基因(PC及PDK4)則上調(diào)。
結(jié)論:CAPON在人肝臟中表達(dá),并參與NAFLD的發(fā)生。CAPON rs12742393位點(diǎn)SNP與肝臟參與抗氧基因表達(dá)下降及參與糖異生通路基因表達(dá)上調(diào)相關(guān)。這可能是CAPON rs12742393位點(diǎn)SNP與NAFLD相關(guān)的可能分子基礎(chǔ)。
第二部分早期單純性脂肪肝基因組學(xué)改變
目的:檢測(cè)輕微脂肪肝患者全基因組表達(dá),探索早期非酒精性脂肪肝(NAFLD)相關(guān)基因的改
5、變。
方法:肝外科收集肝臟良性疾病的手術(shù)標(biāo)本,肝細(xì)胞脂肪變性少于5%作為正常對(duì)照組,肝細(xì)胞脂肪變性15-25%(輕微脂肪肝)作為脂肪肝組。對(duì)照組(n=4)與脂肪肝組(n=4)進(jìn)行基因芯片檢測(cè),差異基因進(jìn)行生物學(xué)分析及實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證。
結(jié)果:在P<0.05及差異倍數(shù)(脂肪肝組/對(duì)照組)大于1.4或小于0.7時(shí),得到162條探針,代表128個(gè)差異基因?;蚋患治鲲@示53個(gè)基因參與代謝過(guò)程。Kegg通路顯示脂肪
6、肝組肝臟甘油三酯合成關(guān)鍵酶1?;视?磷酸O?;D(zhuǎn)移酶2(AGPAT2)、甘油激酶(GK)及脂肪酸攝取膜蛋白CD36表達(dá)上調(diào),而脂肪酸從頭合成通路關(guān)鍵酶乙酰COA酶羧化酶(ACACA)、脂肪酸合成酶(FASN)及脂肪酸延長(zhǎng)酶(ELOVL6)表達(dá)下調(diào)。調(diào)控因子——FGF21及C1orf85在脂肪肝組顯著上調(diào)。脂肪酸β氧化及VLDL分泌通路均無(wú)改變。
結(jié)論:?jiǎn)渭冃灾靖卧缙跁r(shí),脂肪攝取及甘油三酯合成基因上調(diào),但脂肪酸從頭合成基因下
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