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文檔簡介
1、煙堿型乙酰膽堿受體(nAChR)的兩種亞型α7-nAChR和α9α10-nAChR參與機體內(nèi)重要的生理與病理過程調(diào)控,常被作為重要的藥物作用靶點。本文首先對α7-nAChR和α9α10-nAChR進(jìn)行了同源模建,隨后對四個激動劑和兩個拮抗劑與兩個受體模型分別進(jìn)行了分子對接的研究。
同源模建的結(jié)果表明:采用2QC1和2BYR組合成的多模板模建的α7-nAChR和α9α10-nAChR的二聚體,經(jīng)過優(yōu)化和分子動力學(xué)模擬,以PR
2、OCHECK、ERRAT及PROSA程序?qū)ζ溥M(jìn)行評價,證明模建的α7-nAChR和α9α10-nAChR是合理的。
分子對接的結(jié)果表明:Ach和Nicotine與兩個受體模型的作用模式與文獻(xiàn)報道的結(jié)果在整體上具有一致性,進(jìn)一步驗證了模型的合理性;通過對激動劑和拮抗劑分別與α7-nAChR和α9α10-nAChR的作用模式進(jìn)行分析,預(yù)測了α7-nAChR主鏈上的Trp149和相對應(yīng)于α9α10-nAChR主鏈上的Trp150
3、是激動劑與受體結(jié)合的關(guān)鍵氨基酸;α7-nAChR主鏈的Glu189以及α9α10-nAChR主鏈上的Tyr192和輔鏈的Arg58可能是拮抗劑與受體結(jié)合的關(guān)鍵氨基酸,其中α7-nAChR主鏈上的關(guān)鍵氨基酸殘基Trp149與文獻(xiàn)報道的一致。另外,通過從G-score,C-score,氫鍵作用,靜電作用和疏水作用五個方面進(jìn)行綜合分析,發(fā)現(xiàn)本實驗的計算機模擬結(jié)果與生物活性數(shù)據(jù)整體上具有一致性,并對配體分子生物活性的差異以及選擇性的不同給出了理
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