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文檔簡(jiǎn)介
1、染色體異常是與遺傳相關(guān)最常見(jiàn)的出生缺陷。由于染色體是基因的載體,因而染色體發(fā)生異常,將會(huì)導(dǎo)致基因增加或缺失,從而出現(xiàn)智力低下、多種器官、組織畸形,表現(xiàn)出多種癥狀和體征,它是造成出生缺陷的主要原因之一。影響嚴(yán)重的是迄今為止,尚無(wú)有效治療方法。唯一有效措施是在孕期及早發(fā)現(xiàn),及早處理,避免此類患者出生。
染色體異常分為數(shù)目異常和結(jié)構(gòu)異常。胎兒常見(jiàn)的染色體異常發(fā)生在21,18,13號(hào)常染色體和性染色體X、Y的非整倍體異常,該類異常
2、占活產(chǎn)兒染色體異常的95%,臨床主要表現(xiàn)為21-三體綜合征(DownSyndrome,DS),18-三體綜合征(EdwardSyndrome),13-三體綜合征(PatauSyndrome),45,X(TurnerSyndrome),47,XXY(KlinefelterSyndrome)等。在所有染色體異常中,DS是最常見(jiàn)染色體異常,沒(méi)有產(chǎn)前診斷和治療性流產(chǎn)干預(yù)的情況下,其出生率約為1.5‰。眾所周知,DS是一種中度~重度智力低下,機(jī)體
3、功能缺陷,器官多發(fā)畸形等的綜合癥候群,先天性心臟病患兒中有15~50%是DS。至今尚無(wú)有效的治療方法,DS的醫(yī)療看護(hù)、康復(fù)、特殊教育與培訓(xùn)是個(gè)漫長(zhǎng)的過(guò)程,需要有大量的投入,而且絕大多數(shù)病人喪失工作能力,只能被動(dòng)地依靠社會(huì)、家庭的撫養(yǎng)。它給家庭和社會(huì)帶來(lái)巨大痛苦和負(fù)擔(dān)。
由于染色體異常無(wú)法治療,因而孕期通過(guò)產(chǎn)前診斷,阻止異常的胎兒出生是降低染色體異常出生缺陷率的有效措施。產(chǎn)前診斷如果發(fā)生錯(cuò)誤會(huì)導(dǎo)致患兒出生或正常胎兒流產(chǎn),造成
4、嚴(yán)重后果。所以應(yīng)用于產(chǎn)前診斷的檢測(cè)技術(shù)要求技術(shù)成熟、診斷準(zhǔn)確率高,最大程度避免誤診和漏診。20世紀(jì)70年代,首例羊水細(xì)胞培養(yǎng)、核型分析的成功,實(shí)現(xiàn)了在妊娠中期對(duì)染色體異常胎兒做出明確診斷,標(biāo)志著產(chǎn)前診斷技術(shù)的建立。幾十年來(lái),傳統(tǒng)的細(xì)胞遺傳學(xué)技術(shù)曾是檢測(cè)染色體異常的唯一方法。近十余年,隨著各種分子生物學(xué)技術(shù)的飛速發(fā)展,很多新的染色體異常診斷技術(shù)開(kāi)始發(fā)展和成熟。目前,用于產(chǎn)前診斷染色體異常的檢測(cè)技術(shù)主要有3類技術(shù),一是細(xì)胞遺傳學(xué)技術(shù)即核型分
5、析;二是快速染色體異常檢測(cè)(rapidaneuploidydetection,RAD)技術(shù),主要有熒光原位雜交技術(shù)(fluorescenceinsituhybridization,F(xiàn)ISH)和定量熒光多聚酶鏈反應(yīng)技術(shù)(quantitativefluorescencepolymerasechainreaction,QF-PCR);三是分子核型技術(shù)即微陣列比較基因組雜交技術(shù)(array-basedcomparativegenomichybr
6、idization,array-CGHoraCGH)。由于任何一種檢測(cè)技術(shù)都不可能完全診斷染色體異常,面對(duì)眾多的檢測(cè)技術(shù),如何兼顧效益和檢出率選擇合適的檢測(cè)技術(shù)用于產(chǎn)前診斷,關(guān)鍵是充分研究和了解各種染色體檢測(cè)技術(shù)的局限性。
核型分析技術(shù)是非常成熟的技術(shù),一直以來(lái)都是診斷染色體異常的金標(biāo)準(zhǔn)。它需要通過(guò)細(xì)胞培養(yǎng)后,再進(jìn)行核型分析。產(chǎn)前診斷的絨毛、羊水細(xì)胞有兩種培養(yǎng)方法:原位法和培養(yǎng)瓶?jī)煞N方法。原位培養(yǎng)方法培養(yǎng)時(shí)間短,成功率高,
7、對(duì)細(xì)胞培養(yǎng)中的嵌合問(wèn)題容易判斷。培養(yǎng)瓶法現(xiàn)在國(guó)際上已摒棄不用,絕大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室都使用原位細(xì)胞培養(yǎng)方法。大多數(shù)使用平皿蓋玻片的原位細(xì)胞培養(yǎng)方法,操作繁瑣,對(duì)技術(shù)要求高,因此在國(guó)內(nèi)尚未推廣應(yīng)用。很多國(guó)內(nèi)實(shí)驗(yàn)室還是使用培養(yǎng)瓶法進(jìn)行細(xì)胞培養(yǎng)。為解決此問(wèn)題,需要找到一種操作簡(jiǎn)單、容易掌握、培養(yǎng)時(shí)間短的原位培養(yǎng)方法,來(lái)推廣此培養(yǎng)技術(shù)在國(guó)內(nèi)的應(yīng)用,從而保證產(chǎn)前診斷的準(zhǔn)確性。
盡管核型分析是診斷染色體異常的金標(biāo)準(zhǔn),但由于細(xì)胞培養(yǎng)時(shí)間長(zhǎng),診斷
8、周期長(zhǎng),一般需要2、3周,給孕婦及家屬帶來(lái)很大的精神壓力。而且在細(xì)胞培養(yǎng)過(guò)程中,可能污染等原因?qū)е屡囵B(yǎng)失敗,或受分裂相數(shù)量、質(zhì)量、顯帶技術(shù)及操作人員技能的影響導(dǎo)致分析失敗。且染色體核型分析分辨率低,對(duì)<5M的片段的缺失和重復(fù)等無(wú)法檢測(cè)。因此還需要發(fā)展其他的產(chǎn)前診斷技術(shù)來(lái)彌補(bǔ)核型分析報(bào)告時(shí)間過(guò)長(zhǎng)和分辨率不高的不足。
以熒光原位雜交技術(shù)、定量熒光多聚酶鏈反應(yīng)技術(shù)的分子細(xì)胞遺傳技術(shù)為代表的快速染色體異常檢測(cè)(rapidaneup
9、loidydetection,RAD)。實(shí)現(xiàn)了在1~3天內(nèi)診斷包括DS在內(nèi)的常見(jiàn)染色體數(shù)目異常,顯著縮短了報(bào)告時(shí)間。它對(duì)常見(jiàn)21,18,13號(hào)常染色體和性染色體X、Y的非整倍體異常檢測(cè)的靈敏度和特異度已為許多大規(guī)模的研究證實(shí)。盡管RAD無(wú)法對(duì)所有染色體進(jìn)行檢測(cè),但是在診斷常見(jiàn)的染色體異常方面如DS等,他們可與傳統(tǒng)的核型分析技術(shù)相媲美,且方法簡(jiǎn)單、容易操作。并且它們的分辨率高于核型分析技術(shù),可以檢測(cè)3M左右已知位點(diǎn)的染色體微結(jié)構(gòu)異常,是核
10、型分析技術(shù)的有力補(bǔ)充。美國(guó)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)學(xué)院(AmericanCollegeofMedical)對(duì)RAD技術(shù)評(píng)價(jià),為“相對(duì)成熟的技術(shù)、在某種程度上是和常規(guī)染色體分析作用相同的技術(shù)”。2004年,英國(guó)國(guó)家篩查委員會(huì)(UKNationalScreeningCommittee,UKNSC)宣布對(duì)于DS篩查高風(fēng)險(xiǎn)孕婦可以不采用核型分析的方法,直接通過(guò)FISH或QF-PCR確診胎兒是否有DS。各國(guó)對(duì)于RAD技術(shù)的選擇有所不同,歐洲廣泛應(yīng)用QF-PCR
11、技術(shù),而在美國(guó)、澳大利亞應(yīng)用FISH技術(shù)較多。盡管RAD技術(shù)已經(jīng)非常成熟,但在我國(guó)產(chǎn)前診斷臨床應(yīng)用領(lǐng)域并不普及,只有少數(shù)大的產(chǎn)前診斷中心逐步開(kāi)始在臨床應(yīng)用。主要有3個(gè)問(wèn)題未解決,一是RAD技術(shù)診斷的敏感性和特異性是否可以被接受;二是檢測(cè)費(fèi)用高,如何降低價(jià)格;三是,RDA是否可以作為一種診斷方法單獨(dú)應(yīng)用于胎兒染色體異常的產(chǎn)前診斷或如何應(yīng)用于臨床。我國(guó)對(duì)RAD技術(shù)的研究缺乏大樣本臨床資料,且相關(guān)這方面評(píng)價(jià)研究報(bào)道也非常少。因此需要針對(duì)這3個(gè)
12、問(wèn)題,評(píng)價(jià)RAD技術(shù)在國(guó)內(nèi)產(chǎn)前診斷的臨床應(yīng)用效果,降低檢測(cè)價(jià)格,評(píng)估FISH和QF-PCR這兩種技術(shù)的區(qū)別,哪種技術(shù)更適合國(guó)內(nèi)實(shí)驗(yàn)室發(fā)展,評(píng)估是否能夠用RAD技術(shù)取代傳統(tǒng)核型分析技術(shù)。
盡管RAD彌補(bǔ)了核型分析的一些不足,但RAD只能檢測(cè)已知位點(diǎn)的染色體異常。而臨床上相當(dāng)一部分染色體不平衡畸變患者的染色體組或者基因組大多發(fā)生了未知的細(xì)微不平衡改變,核型檢測(cè)技術(shù)和分子細(xì)胞遺傳技術(shù)均無(wú)法檢測(cè)。1998年研發(fā)出array-CGH
13、技術(shù),為解決這個(gè)問(wèn)題提供了技術(shù)平臺(tái)。它不僅分辨率高,且無(wú)需制備中期染色體,僅需1μg的DNA量,一次實(shí)驗(yàn)即可檢測(cè)全基因組DNA拷貝數(shù)的變化,耗時(shí)僅72小時(shí)。能夠可靠地檢測(cè)出所有因染色體微缺失或微重復(fù)引起的基因組不平衡畸變,定位精確,清楚顯示畸變片段內(nèi)的基因含量,對(duì)發(fā)現(xiàn)、鑒定疾病相關(guān)基因有重要意義。
盡管該技術(shù)對(duì)染色體異常診斷價(jià)值很高,近年來(lái)逐步應(yīng)用于產(chǎn)前診斷,成為熱點(diǎn)技術(shù),但國(guó)內(nèi)將該技術(shù)應(yīng)用于產(chǎn)前診斷臨床的報(bào)道非常少。其原
14、因是由于該方法不能檢測(cè)沒(méi)有發(fā)生基因拷貝數(shù)增減的染色體平衡畸變(平衡易位和平衡倒位)、多倍體和20%以下的嵌合體。由于分辨率過(guò)高,會(huì)檢測(cè)出大量良性和不明臨床意義的拷貝數(shù)變異(copynumbervariation,CNV),給孕婦及其家屬帶來(lái)不必要的焦慮,甚至擔(dān)心胎兒的健康而終止妊娠。而且ArrayCGH的檢測(cè)費(fèi)用比常規(guī)染色體核型分析昂貴。對(duì)于這種非常有價(jià)值技術(shù)該如何應(yīng)用才能發(fā)揮它的優(yōu)越性,幫助診斷胎兒的染色體異常,是國(guó)內(nèi)產(chǎn)前診斷領(lǐng)域需要
15、解決的問(wèn)題。
本課題目的是通過(guò)細(xì)胞核型分析、快速染色體異常檢測(cè)以及array-CGH技術(shù),三類4種染色體檢測(cè)技術(shù)的臨床應(yīng)用研究,綜合評(píng)價(jià)各種技術(shù)的應(yīng)用范圍,為國(guó)內(nèi)醫(yī)療機(jī)構(gòu)了解和開(kāi)展產(chǎn)前診斷檢測(cè)技術(shù)提供一個(gè)參考。
第一部分新型原位培養(yǎng)方法在產(chǎn)前診斷臨床應(yīng)用
目的:
建立一種操作簡(jiǎn)單、培養(yǎng)時(shí)間短、容易掌握的新型原位培養(yǎng)方法,便于在國(guó)內(nèi)產(chǎn)前診斷推廣應(yīng)用。
方法:
16、 1.實(shí)驗(yàn)分組:2009年1月~3月在我院產(chǎn)前診斷中心行羊膜腔穿刺術(shù)的118例孕婦,孕16周~23周之間,沒(méi)有手術(shù)禁忌癥者。抽取的羊水配對(duì)分為兩組分別進(jìn)行培養(yǎng),實(shí)驗(yàn)組為新型原位培養(yǎng)瓶法,對(duì)照組為傳統(tǒng)平皿蓋玻片法。
2.標(biāo)本接種:羊膜腔穿刺抽取21ml羊水,每組8ml配對(duì)分組,實(shí)驗(yàn)組接種到1個(gè)原位培養(yǎng)瓶,對(duì)照組接種到3個(gè)dish中的蓋玻片上分別進(jìn)行培養(yǎng),其余5ml接種于T型培養(yǎng)瓶作為備份培養(yǎng)。
3.核型分析:
17、按常規(guī)培養(yǎng)、收獲、制片和顯帶,進(jìn)行核型分析。
結(jié)果:
1.培養(yǎng)成功率:118例樣本,實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組方法進(jìn)行羊水培養(yǎng),均培養(yǎng)成功。
2.培養(yǎng)時(shí)間:實(shí)驗(yàn)組培養(yǎng)時(shí)間和對(duì)照組相比較明顯縮短,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。
3.細(xì)胞克隆和中期核型分裂相:培養(yǎng)后細(xì)胞克隆數(shù),實(shí)驗(yàn)組只用一個(gè)培養(yǎng)瓶進(jìn)行培養(yǎng),獲得的細(xì)胞克隆數(shù)仍多于對(duì)照組使用3個(gè)平皿進(jìn)行培養(yǎng)獲得的細(xì)胞克隆數(shù),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<
18、0.05)。收獲后獲得的滿意染色體核型分裂相實(shí)驗(yàn)組多于對(duì)照組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)
結(jié)論:
與傳統(tǒng)平皿蓋玻片比較,新型原位培養(yǎng)瓶的培養(yǎng)時(shí)間短、核分裂相多、傳代率低,操作簡(jiǎn)單,適于在國(guó)內(nèi)臨床推廣應(yīng)用。
第二部分快速染色體檢測(cè)(RAD)技術(shù)在產(chǎn)前診斷臨床應(yīng)用
目的:
研究FISH和QF-PCR兩種技術(shù)在產(chǎn)前診斷的大樣本臨床應(yīng)用結(jié)果,比較兩種技術(shù)的優(yōu)缺點(diǎn),綜合評(píng)
19、估RAD技術(shù)臨床應(yīng)用的可行性。
方法:
1.隨機(jī)選擇1955例產(chǎn)前診斷樣本:絨毛10例、羊水1036例用FISH進(jìn)行檢測(cè);絨毛15例、羊水894例用QF-PCR進(jìn)行檢測(cè),均以核型分析作為結(jié)果驗(yàn)證。
2.優(yōu)化FISH技術(shù)以降低檢測(cè)成本應(yīng)用于絨毛、羊水樣本的快速檢測(cè)。
3.選取13、18、21、X、Y關(guān)鍵區(qū)域STR位點(diǎn)合成23對(duì)探針?lè)謨晒軘U(kuò)增,建立QF-PCR多重PCR技術(shù),同時(shí)檢測(cè)常
20、見(jiàn)5種染色體異常。
4.按照國(guó)際通用的對(duì)診斷技術(shù)評(píng)價(jià)的層次框架模式,從技術(shù)效能,診斷效能,效益評(píng)價(jià),對(duì)RAD進(jìn)行綜合評(píng)估,獲得該技術(shù)合適的國(guó)內(nèi)產(chǎn)前診斷臨床應(yīng)用方案。
結(jié)果:
1.對(duì)1955例樣本進(jìn)行核型分析后,發(fā)現(xiàn)正常核型1892例,異常核型62例,其中數(shù)目異常40例,結(jié)構(gòu)異常19例,嵌合體3例。
2.FISH檢測(cè)1046例樣本,成功率99.90%(1045/1046),絕對(duì)敏感性
21、96%(24/25),絕對(duì)特異性100%(1021/1021)
3.改進(jìn)雜交的處理過(guò)程,將探針雜交液的用量減為常規(guī)用量的1/4即2.5μL,探針雜交效率沒(méi)有受到影響,探針雜交信號(hào)清晰。
4.QF-PCR檢測(cè)909例樣本,成功率99.89%(908/909),絕對(duì)敏感性93.75%(15/16),絕對(duì)特異性100%(892/892)
5.設(shè)計(jì)23對(duì)探針進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增效率沒(méi)有受到到影響,達(dá)
22、99.78%。
6.在RAD的5種染色體檢測(cè)范圍內(nèi),共檢出39例異常,與核型分析一致的符合率99.90%,漏診2例。
7.在核型分析檢出的所有染色體異常,RAD漏診了23例,其中8例為有臨床意義染色體異常,漏診率0.4%(8/1955)。
結(jié)論:
1.優(yōu)化FISH實(shí)驗(yàn)操作,提高雜交效率,可以達(dá)到減少探針雜交液用量,減少試劑成本,降低檢測(cè)費(fèi)用
2.選擇的23個(gè)STR位點(diǎn)
23、特異性高,多重?cái)U(kuò)增效率高,對(duì)5種染色體異常診斷效率高
3.FISH和QF-PCR兩種RAD技術(shù)診斷5種染色體異常的靈敏度和特異度無(wú)顯著性差異,由于FISH檢測(cè)設(shè)備相對(duì)QF-PCR的設(shè)備價(jià)格低,而且有商業(yè)化的試劑盒對(duì)技術(shù)要求相對(duì)低,因此在一些病例數(shù)不多且沒(méi)有開(kāi)展分子診斷技術(shù)的中心,開(kāi)展FISH檢測(cè)有較高的可行性。
4.從檢測(cè)范圍(21,13,18,X,Y)的特異度和敏感度而言,RAD和核型分析在檢測(cè)染色體異常方
24、面沒(méi)有顯著差別。
5.RAD技術(shù)對(duì)于超聲正常、單純唐氏高?;蚴窃袐D高齡的病例可以考慮用RAD檢測(cè)部分代替核型分析的應(yīng)用方案。
第三部分array-CGH技術(shù)在產(chǎn)前診斷中的臨床應(yīng)用
目的:
建立array-CGH技術(shù)平臺(tái),探討array-CGH技術(shù)在產(chǎn)前診斷的應(yīng)用價(jià)值和應(yīng)用方案。
方法:
1.孕周在17~34周,34例產(chǎn)前診斷病例,1例羊水,33例臍血。羊
25、水病例是由于胎死宮內(nèi),羊水培養(yǎng)不成功,無(wú)法行核型分析。4例臍血是羊水染色體檢查發(fā)現(xiàn)可疑染色體不平衡易位。其余29例臍血是超聲發(fā)現(xiàn)胎兒發(fā)育異常。
2.33例臍血按常規(guī)進(jìn)行細(xì)胞培養(yǎng)、G顯帶染色體核型分析。有異常結(jié)果,同時(shí)檢測(cè)父母染色體核型。
3.按OligoCGHMicroarray芯片的標(biāo)準(zhǔn)操作常規(guī)對(duì)34例病例進(jìn)行檢測(cè)。
結(jié)果:
1.本研究成功對(duì)34個(gè)樣本進(jìn)行了array-CGH技術(shù)
26、分析,發(fā)現(xiàn)了7例異常。
2.病例1:G顯帶染色體核型結(jié)果為衍生X染色體,但無(wú)法確定條帶[46,X,der(X)?t(X;?Y)(q12;q11)]。父母染色體核型正常。行array-CGH分析顯示X染色體長(zhǎng)臂發(fā)生了66Mb缺失,46,X,del(X)(q21.31-q28)
3.病例2:G顯帶染色體核型分析初步結(jié)果為9號(hào)染色體短臂插入部分片段,無(wú)法確定條帶[46,XN,ins(9;?)(p12;?)]。母親為
27、相同9號(hào)染色體。行array-CGH分析實(shí)驗(yàn)結(jié)果提示胎兒微陣列結(jié)果未見(jiàn)異常。
4.病例3:G顯帶染色體核型分析考慮為10號(hào)染色體長(zhǎng)臂插入了部分片段,本院臍血檢查G顯帶染色體核型分析結(jié)果相同,但無(wú)法明確片段來(lái)源[46,XX,ins(10;?)(q22;?)]。父母染色體核型正常。array-CGH分析結(jié)果提示10號(hào)染色體長(zhǎng)臂發(fā)生了22.5Mbp的重復(fù),46,XN,dup(10)(q21.2-q23.1)。
5.
28、病例4:G顯帶染色體核型分析,可疑18號(hào)染色體長(zhǎng)臂部分缺失,但未確定斷裂點(diǎn),以及缺失片段是否有易位到其他染色體上[46,XN,del(8)(p11?)]。父親染色體核型7號(hào)和18號(hào)染色體平衡易位,無(wú)法確定胎兒是否與父親的易位一致。array-CGH分析,清楚顯示7號(hào)染色體長(zhǎng)臂發(fā)生了11.2Mbp的重復(fù),18號(hào)染色體短臂發(fā)生了14Mbp的缺失,不平衡易位,46,XY,dup(7)(q36.1-q36.3),del(18)(p11.32-p
29、11.21)
6.病例5:因胎兒發(fā)育異常,要求行羊水檢查,穿刺術(shù)前超聲檢查發(fā)現(xiàn)胎死宮內(nèi),擔(dān)心羊水細(xì)胞培養(yǎng)的成功率低,同時(shí)行array-CGH檢測(cè)。G顯帶核型45,X。arrayCGH結(jié)果提示胎兒為X單體;同時(shí)發(fā)現(xiàn)在9號(hào)染色體長(zhǎng)臂有11Mbp的重復(fù),45,X,dup(9)(q34.11-q34.3)
7.病例6-34均因胎兒發(fā)育異常行核型分析和arrayCGH。病例6:G顯帶核型46,XN,der(14)(q1
30、2?)。array-CGH結(jié)果提示14號(hào)染色體長(zhǎng)臂同時(shí)發(fā)生了重復(fù)和缺失,重復(fù)片段有30.7Mb,缺失片段有2.3Mb;病例7G顯帶核型47,XN,+13,array-CGH結(jié)果提示13號(hào)染色體整體片段發(fā)生重復(fù),重復(fù)片段有96Mb,為13三體;病例8G顯帶核型47,XN,+21,array-CGH結(jié)果提示21號(hào)染色體整體片段發(fā)生重復(fù),重復(fù)片段有33Mb,為21三體。病例9-34,G顯帶核型和array-CGH未發(fā)現(xiàn)異常。
結(jié)
31、論:
1.Array-CGH技術(shù)是一種全新的分子核型分析技術(shù),其分辨率和準(zhǔn)確性極高,有效地克服或彌補(bǔ)了現(xiàn)有的染色體診斷技術(shù)的局限性。
2.Array-CGH技術(shù)應(yīng)用于產(chǎn)前診斷中不平衡染色體病和胎兒發(fā)育異常的檢測(cè),可快速、準(zhǔn)確地在分子水平上明確診斷,為產(chǎn)前診斷醫(yī)生進(jìn)行遺傳咨詢析提供科學(xué)依據(jù),有利于準(zhǔn)確評(píng)估胎兒預(yù)后和指導(dǎo)妊娠結(jié)局。
3.對(duì)于Array-CGH技術(shù)檢測(cè)得到的結(jié)果,需要進(jìn)行相應(yīng)的生物信息
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