金柑果皮油胞特性和相關(guān)調(diào)控基因表達(dá)量的研究.pdf

1、金柑果實(shí)是柑橘類水果中可以帶皮食用的果實(shí)，其果皮油胞的大小、數(shù)量、內(nèi)含物等直接影響食用品質(zhì)。因此，本試驗(yàn)以金柑油胞為出發(fā)點(diǎn)，以油胞較多的普通品種融安金柑、油胞較少的芽變品種滑皮金柑、油胞最少的芽變品種脆蜜金柑為試材，研究三個(gè)品種間果實(shí)品質(zhì)，油胞大小、數(shù)量差異;并對(duì)三個(gè)品種果實(shí)果皮轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，通過差異基因分析油胞形成的相關(guān)調(diào)控基因;再用測(cè)定參選基因在各個(gè)時(shí)期的表達(dá)量，分析這些基因在果實(shí)發(fā)育過程中的不同表達(dá)，預(yù)測(cè)這些基因與油胞發(fā)育過程的關(guān)系

2、;旨在為應(yīng)用基因工程培育油胞精油含量較少的優(yōu)質(zhì)金柑提供理論依據(jù)。
　　1.脆蜜金柑、融安金柑、滑皮金柑三個(gè)品種之間，果皮油胞數(shù)量從果實(shí)生長(zhǎng)初期則已表現(xiàn)出來。隨著果實(shí)的成熟，果皮油胞密度則略有下降。單位果皮面積內(nèi)油胞含量最多的是融安金柑、滑皮金柑次之、脆蜜金柑最少。融安金柑和滑皮金柑果實(shí)赤道部密度最小，果實(shí)頂部密度最大。
　　2.脆蜜金柑呈現(xiàn)出果大、果重、油胞含量少、可食率高、果汁率高、可溶性固形物含量高、蔗糖含量高、總糖含量

3、高、含酸量低的優(yōu)點(diǎn)，在口感上呈現(xiàn)出辛辣味小、皮脆、汁多、肉厚、甜蜜少酸的特點(diǎn)。
　　3.對(duì)三個(gè)金柑品種進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，共獲得36093條基因。將獲得的基因與蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì)，對(duì)其功能進(jìn)行注釋和分類。比對(duì)到NR數(shù)據(jù)庫的基因有20973條，占總基因數(shù)的58.11％;在GO得到功能注釋和預(yù)測(cè)的基因有20973條，占組裝轉(zhuǎn)錄本的58.11％。
　　4.36093條基因在融安金柑（對(duì)照組）、滑皮金柑、脆蜜金柑三個(gè)轉(zhuǎn)錄組文庫中進(jìn)行表

4、達(dá)量差異比較分析，獲得8113個(gè)差異表達(dá)基因DEGs。融安金柑和滑皮金柑比較，有DEGs1417個(gè)上調(diào)表達(dá)，277個(gè)下調(diào)表達(dá)。融安金柑和脆蜜金柑比較，有DEGs3134個(gè)，1514個(gè)下調(diào)。滑皮金柑和脆蜜金柑比較，有DEGs757個(gè)上調(diào)表達(dá)，1014個(gè)下調(diào)表達(dá)。
　　5.8113個(gè)DEGs進(jìn)行GO顯著富集分析，融安金柑和滑皮金柑比較、融安金柑和脆蜜金柑比較、滑皮金柑和脆蜜金柑比較分別有12個(gè)、28個(gè)、22個(gè)顯著性富集的GO term

5、。
　　6.通過與NR庫比對(duì)，200條基因編碼了超過46種不同類別的轉(zhuǎn)錄因子，參與烯類等物質(zhì)調(diào)控有關(guān)的AP2/ERF和WRKY轉(zhuǎn)錄因子，在融安金柑和滑皮金柑比較中有AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子4個(gè);在融安金柑和脆蜜金柑比較中，WRKY轉(zhuǎn)錄因子26個(gè)，在滑皮金柑和脆蜜金柑比較中，有WRKY轉(zhuǎn)錄因子18個(gè)。
　　7.篩選獲得135條DEGs可能編碼油胞精油成分烯萜類、酮類物質(zhì)的5條調(diào)控酶基因和5條轉(zhuǎn)錄因子。預(yù)測(cè)金柑油胞相關(guān)物質(zhì)的控制基