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1、遼寧絨山羊是我國(guó)特有的禁止基因外流的寶貴遺傳資源,產(chǎn)絨量居全國(guó)第一。在前期工作中,我們通過建庫(kù)及Primer walking質(zhì)粒測(cè)通的方法克隆篩選出蛋白脂質(zhì)蛋白質(zhì)基因(proteolipid protein2,PLP2)的全長(zhǎng)序列。為了探究該基因的功能,我們對(duì)其進(jìn)行了生物信息學(xué)分析(包括預(yù)測(cè)其開放閱讀框,親疏水性分析、跨膜預(yù)測(cè)分析、信號(hào)肽預(yù)測(cè)分析、磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)分析、二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)、進(jìn)化樹的構(gòu)建、多重序列的比對(duì)、保守結(jié)構(gòu)域搜索),Real
2、-time PCR,RT-PCR,原位雜交以及Noggin基因干擾慢病毒感染后目的基因的qPCR檢測(cè)等的一系列分析研究。
分析結(jié)果顯示:首先,通過生物信息學(xué)分析,我們發(fā)現(xiàn)PLP2基因能夠編碼含有152個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì),二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)顯示,PLP2基因含有α螺旋結(jié)構(gòu)(46.05%)、延伸結(jié)構(gòu)(12.5%)和無規(guī)卷曲結(jié)構(gòu)(41.45%),功能位點(diǎn)分析顯示,PLP2含有MARVEL結(jié)構(gòu)域并且存在4個(gè)跨膜區(qū),不存在信號(hào)肽,PLP2氨基酸
3、含有3個(gè)Ser、2個(gè)Tyr和1個(gè)Thr可能成為蛋白激酶磷酸化位點(diǎn);其次,通過RT-PCR檢測(cè)顯示,PLP2基因在皮膚、心臟、肝臟、腎臟、肺、脾臟中均有表達(dá),且表達(dá)差異不是很明顯,其中皮膚中的表達(dá)含量相對(duì)較高;同時(shí),還運(yùn)用了熒光定量PCR技術(shù),定量的檢測(cè)其在不同時(shí)期的表達(dá)情況,發(fā)現(xiàn)在興盛期時(shí),PLP2基因在次級(jí)毛囊的表達(dá)量約為初級(jí)毛囊的1.02倍(0.01<P<0.05),在退行期時(shí),PLP2基因的表達(dá)量仍是次級(jí)毛囊高于初級(jí)毛囊,是初級(jí)毛
4、囊的1.16倍(0.01<P<0.05);另外,經(jīng)過原位雜交分析,發(fā)現(xiàn)PLP2基因在內(nèi)根鞘有表達(dá),而在外根鞘、毛干(角質(zhì)層、皮層和髓層)以及毛囊乳突中無表達(dá);最后,通過Noggin基因干擾后PLP2基因的qPCR檢測(cè),顯示空白組的表達(dá)量是NC陰性對(duì)照的1.15倍,而noggin干擾后PLP2的表達(dá)量是NC陰性對(duì)照組的0.64倍。
結(jié)論:(1) PLP2基因在皮膚、心臟、肝臟、腎臟、肺、脾臟各個(gè)組織中都有表達(dá),這說明PLP2與各
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