稻絲核菌菌株40-1中兩個新型病毒基因組的分子特性研究.pdf

1、真菌病毒是指侵染真菌的病毒。與其它類型的病毒相似，真菌病毒可以在宿主中復(fù)制。絲核菌屬是可以導(dǎo)致作物產(chǎn)量損失并干擾其生長發(fā)育過程的植物病原真菌。本研究從稻絲核菌株40-1中分離克隆出了一個線粒體病毒RoMV1（Rhizoctonia oryzae-sativae mitovirus1）和一個雙分病毒RoPV1(Rhizoctoniaoryzae-sativae paritivirus1)。線粒體病毒RoMV1的cDNA全長含有3096個核

2、苷酸，推定含有一個編碼RdRp的開放閱讀框(ORF)，該ORF編碼的RdRp具有4個保守的RdRp結(jié)構(gòu)域。多重比對及聚類分析，表明該線粒體病毒與來源于Rhizophagus sp.RF1的線粒體病毒有31％的相似性，與其它線粒體病毒有28％-44％相似性。此外線粒體病毒RoMV1的5'和3'非編碼區(qū)可以折疊成穩(wěn)定的莖環(huán)結(jié)構(gòu)，而且末端的反向互補(bǔ)序列可以形成一個“鍋柄”結(jié)構(gòu)。因此，RoMV1是一個線粒體病毒新種。進(jìn)化分析表明線粒體病毒RdR

3、p進(jìn)化與植物線粒體基因組中RdRp-like基因進(jìn)化相關(guān)。雙分病毒RoPV1含有兩條dsRNA片段(RNA1和RNA2)，RNA1的cDNA全長含2186個核苷酸，有一個推定的編碼RdRp的ORF;獲得部分RNA2的cDNA序列（1014個核苷酸），編碼推定衣殼蛋白。多重比對及聚類分析表明，雙分病毒RoPV1的RdRp與櫻桃致病相關(guān)真菌病毒有70％的相似性，而其部分衣殼蛋白序列與Diuris pendunculata潛隱病毒有28％相似