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文檔簡介
1、背景:長鏈非編碼RNA(Long noncoding RNAs,lncRNAs)參與多種生物學過程,在保持正常細胞功能(如細胞增殖、凋亡、周期等)的同時在生物學過程中也發(fā)揮重要的調(diào)節(jié)作用。lncRNA的調(diào)節(jié)異??蓪е露喾N神經(jīng)系統(tǒng)疾病的發(fā)生如(),相關研究進展迅速;然而,lncRNA在創(chuàng)傷性腦損傷(traumatic braininjury,TBI)發(fā)展過程中起到的作用仍不明確。本研究通過LncNRA表達譜探索TBI患者(血液)中存在的l
2、ncRNA對TBI的病理生理學機制是否發(fā)揮作用。
方法:嚴格篩選格拉斯哥昏迷評分(GCS)小于8分的重型閉合性顱腦外傷患者,總共12個樣本的血液組織,9例創(chuàng)傷性腦損傷成年男性患者(分別在24h、48h、72h共3個時間點采集靜脈血)3例非創(chuàng)傷性成年男性對照組,提取總RNA,并進行單色基于微陣列基因芯片表達譜分析。進一步作包括基因本體(GO)分析和信號通路分析在內(nèi)的生物信息學分析。
結果:在每個觀察時間點都有2倍以上差
3、異表達,表達上調(diào)的lncRNA有232種,其中有生物學注釋的較完整注釋的lncRNA有75種;表達下調(diào)的lncRNA有63種,其中有生物學注釋的較完整注釋的lncRNA有22種。信號通路分析表明,lncRNA相關mRNA轉錄本對應有16種信號通路上調(diào)和10種信號通路下調(diào)(p<0.01)。GO功能分類分析表明,上調(diào)轉錄本對應的最高富集的GO靶標與補體和凝血級聯(lián)反應相關,下調(diào)轉錄本對應的最高富集GO靶標與自然殺傷細胞介導的細胞毒作用相關。<
4、br> 結論:lncRNA在創(chuàng)傷性顱腦損傷研究領域目前尚未有報道,本課題率先探索了顱腦外傷后循環(huán)外周血血液中是否有l(wèi)ncRNA的參與,動態(tài)觀察了其在傷后不同時間點上的變化趨勢,發(fā)現(xiàn)了存在差異表達的lncRNA。其中參與上調(diào)的信號通路有16條,下調(diào)的信號通路有10條。隨機選取其中兩條通路進一步進行分子生物學功能注釋Pathway分析,發(fā)現(xiàn)有自然殺傷細胞介導的細胞毒作用、補體及凝血級聯(lián)反應和細胞凋亡等一些與顱腦損傷過程密切相關的重要病理生
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